Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6R1K3

Protein Details
Accession A6R1K3    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
355-378SSSDSSVSKKRRKEQSSNQSNKSAHydrophilic
449-476LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGLIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
455-467KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG aje:HCAG_03510  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MARSKDVEKSSETAKPTPAKKSVVSKPVTCKDGNKKGASISENASVSPALIAAISSFLTTYGFDKTSKAFTAERKAKKSLMKAGDKSNDKGTTNKPFLVKIFERWELIRNAQHSVEKEGTLRCGDRDKSDTSDSESDSNFTESSDSDVVMEGARAPSSVLSLSSSSCSSSASESSDEDVKKAPITQLSNQKRKHDDSSSSSCDSDSDEAHPEVKRTKLTTEKPTLNSLAKSSSTLESSSESFSGSDTGSDSSSDFDCDSTSDSNSSSSTSASVKSKLIPITKSAEAATIAAQIPLPGSVKKGFGDSSPSSSSPFSGSSSDTDNSSSCRQLADSNATHKNSSSSSNSSSDSSSNSSSSDSSVSKKRRKEQSSNQSNKSATSSAILKKAASITSTFNIVSARGSNPAASTPSIKHSGTQPTPLALAGQLSHDHPSNAYIPYAYAERAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGLIDIGPGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.49
4 0.54
5 0.55
6 0.54
7 0.56
8 0.62
9 0.64
10 0.65
11 0.65
12 0.63
13 0.67
14 0.69
15 0.68
16 0.61
17 0.61
18 0.62
19 0.67
20 0.69
21 0.63
22 0.57
23 0.56
24 0.6
25 0.54
26 0.47
27 0.4
28 0.38
29 0.34
30 0.32
31 0.29
32 0.22
33 0.2
34 0.16
35 0.12
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.04
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.11
49 0.13
50 0.13
51 0.15
52 0.18
53 0.21
54 0.22
55 0.24
56 0.25
57 0.3
58 0.4
59 0.48
60 0.54
61 0.56
62 0.59
63 0.61
64 0.63
65 0.65
66 0.63
67 0.63
68 0.64
69 0.63
70 0.67
71 0.7
72 0.68
73 0.63
74 0.61
75 0.56
76 0.48
77 0.49
78 0.48
79 0.49
80 0.49
81 0.5
82 0.44
83 0.42
84 0.42
85 0.45
86 0.4
87 0.36
88 0.38
89 0.37
90 0.37
91 0.36
92 0.39
93 0.34
94 0.36
95 0.33
96 0.29
97 0.29
98 0.3
99 0.32
100 0.29
101 0.31
102 0.29
103 0.25
104 0.26
105 0.25
106 0.25
107 0.24
108 0.23
109 0.19
110 0.24
111 0.25
112 0.27
113 0.29
114 0.3
115 0.32
116 0.34
117 0.33
118 0.32
119 0.34
120 0.31
121 0.3
122 0.27
123 0.23
124 0.21
125 0.22
126 0.16
127 0.13
128 0.12
129 0.09
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.18
163 0.17
164 0.16
165 0.17
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.15
171 0.19
172 0.24
173 0.34
174 0.42
175 0.51
176 0.53
177 0.58
178 0.59
179 0.59
180 0.59
181 0.54
182 0.5
183 0.49
184 0.53
185 0.51
186 0.47
187 0.43
188 0.37
189 0.32
190 0.28
191 0.22
192 0.15
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.17
203 0.21
204 0.27
205 0.33
206 0.4
207 0.44
208 0.47
209 0.47
210 0.48
211 0.47
212 0.41
213 0.35
214 0.28
215 0.23
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.18
263 0.2
264 0.23
265 0.21
266 0.22
267 0.25
268 0.25
269 0.25
270 0.21
271 0.18
272 0.15
273 0.15
274 0.12
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.06
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.19
292 0.18
293 0.22
294 0.23
295 0.23
296 0.23
297 0.23
298 0.23
299 0.17
300 0.17
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.13
305 0.17
306 0.17
307 0.16
308 0.16
309 0.15
310 0.17
311 0.18
312 0.18
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.18
318 0.22
319 0.22
320 0.28
321 0.34
322 0.34
323 0.34
324 0.32
325 0.31
326 0.25
327 0.27
328 0.25
329 0.23
330 0.26
331 0.28
332 0.29
333 0.28
334 0.28
335 0.24
336 0.22
337 0.22
338 0.19
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.15
346 0.18
347 0.26
348 0.35
349 0.41
350 0.49
351 0.57
352 0.64
353 0.72
354 0.78
355 0.8
356 0.82
357 0.86
358 0.87
359 0.83
360 0.78
361 0.7
362 0.6
363 0.53
364 0.43
365 0.32
366 0.26
367 0.27
368 0.25
369 0.29
370 0.28
371 0.24
372 0.25
373 0.27
374 0.25
375 0.2
376 0.18
377 0.18
378 0.18
379 0.21
380 0.18
381 0.17
382 0.16
383 0.15
384 0.15
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.16
394 0.19
395 0.18
396 0.22
397 0.26
398 0.26
399 0.25
400 0.29
401 0.38
402 0.37
403 0.41
404 0.37
405 0.34
406 0.35
407 0.33
408 0.28
409 0.18
410 0.16
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.15
416 0.15
417 0.15
418 0.14
419 0.17
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.15
424 0.14
425 0.16
426 0.17
427 0.15
428 0.15
429 0.16
430 0.17
431 0.19
432 0.2
433 0.19
434 0.2
435 0.24
436 0.26
437 0.32
438 0.33
439 0.34
440 0.38
441 0.39
442 0.44
443 0.48
444 0.52
445 0.56
446 0.64
447 0.71
448 0.77
449 0.85
450 0.87
451 0.9
452 0.91
453 0.9
454 0.9
455 0.88
456 0.86
457 0.84
458 0.77
459 0.67
460 0.57
461 0.53
462 0.45
463 0.38
464 0.29
465 0.22
466 0.2