FuNGI

A6RFB5

Protein Details

Accession

A6RFB5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1187-1213	LCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 15, extr 4, cyto 3, nucl 2, plas 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
KEGG	aje:HCAG_08331 -
Pfam	View protein in Pfam PF14529 Exo_endo_phos_2 PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MCQLLPTLPSWASALPCRTQAREWHPQAPNSKRASSCSPPWRQVPQGCSGAATPASTASTNGRSGGAYTNRSVNPVNTARWASTPQAGGDSEFHQQPGTDAVMDYLTNLSPPARCLIGGDINVRHDAFEPGAVNLHRGGELVQWASEHGMDFVGEIGVPTHAAGHVIDLTFSNVAFASTTVRQDLHCGSDHQSMITMLPTTPQTQPSDARIKITDSQLEPFADLVRGLMVDMPCPEGVGNVAQLDDLAQHFTQSLLAAAQAVSKPAQQGRTTAPWWTADCRRAHRELTIHQTEAAKHQFKDAVRKAKRAYWRQVINEARDGRDLYRVVAWHKLEPNLRAPPLVIGDQVIEETAAKAEALQQAILKRYNSADDLEYNPLDDEHWSGMGNLPWNPRVGMEEVERNTIGVQSTSPGTDGITVRMLKACWQHVSLFIQQLYNCCLRLCHFPRAWKLAEVAMIPKVGKRDRSSVRSWRPIALLSVISKGLERIIARRLAYTALIHGIVSPQHGGALPRRSAMDLVAAFTHEVEAAFAQNKEVSMVTMDVQGAFDAVLRRRLLQRMAQQGWPRELLQLIDSFLTERRAQVRLEGTTTAAHQMQCGTPQGSPLSPILFLLYLAELLWQNSELRFGYADDLNIWRATHSLDNNATLLRQDIQSILRWGEINKVAFAPEKLEMIHLTRKRHNEAPAVVVSEDLTVHPVTAPAGQEPALRWLGVHFDRRLTWRPHVSTRAKKARAVAQHIRSLGKTRDGPPADALRKAVTTCVVPSLLYGTEAWYGGRTQPARHTGRSGEVSSRLGWHVGTVEKVLTMAARGVLPVFRTTPIATLYRDAGLPSAMVALEEAKIRFATRLQVVDEKHPLASRIAPPMITRGRGAGTRQRSKTKIQRLGALLPAVNRPTLAIPHYSEGCGTDPTEGVDKKSAAQAFKEWWRSQPSTDLYVFSDGSERNLDNSRQVGYGFIVYQGNKQLASFSAALSPMSHVFDAEAVGACRALECAVKLLPCVTEDSSNPQIWLCLDNTSVIWGIRGSAAASSNWAYNRCHELLRQHNVGLKWAPGHMGIEGNEEADRLAKRAVSSTAAPAYGLEATPTVSGVRTVAKQLSQEARRKWWSGACGRLSDWYRGWSFSRPTVEYQVKAPPELTMPRHALHRWLALRSSHGDFSWYHRRFQHADARLTCVCGHNKSPEHLVLCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAVAYLGSLTPTDFVELLDCTQFYTRYCTRHGSGGPLREPHYSPTMNGHTSGQKWMRSSEKSFAMS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.26
3	0.33
4	0.36
5	0.38
6	0.41
7	0.47
8	0.5
9	0.56
10	0.6
11	0.63
12	0.65
13	0.68
14	0.73
15	0.72
16	0.72
17	0.67
18	0.68
19	0.6
20	0.6
21	0.61
22	0.59
23	0.61
24	0.63
25	0.65
26	0.65
27	0.69
28	0.71
29	0.71
30	0.71
31	0.66
32	0.63
33	0.58
34	0.52
35	0.47
36	0.4
37	0.35
38	0.29
39	0.24
40	0.17
41	0.14
42	0.16
43	0.14
44	0.15
45	0.16
46	0.19
47	0.2
48	0.21
49	0.2
50	0.19
51	0.2
52	0.27
53	0.28
54	0.28
55	0.29
56	0.35
57	0.35
58	0.38
59	0.38
60	0.32
61	0.34
62	0.35
63	0.36
64	0.34
65	0.36
66	0.34
67	0.35
68	0.37
69	0.31
70	0.31
71	0.31
72	0.26
73	0.27
74	0.26
75	0.25
76	0.24
77	0.23
78	0.23
79	0.22
80	0.21
81	0.18
82	0.18
83	0.17
84	0.17
85	0.16
86	0.13
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.13
91	0.13
92	0.11
93	0.09
94	0.09
95	0.09
96	0.1
97	0.1
98	0.12
99	0.14
100	0.13
101	0.13
102	0.15
103	0.19
104	0.23
105	0.25
106	0.28
107	0.28
108	0.29
109	0.31
110	0.3
111	0.25
112	0.21
113	0.2
114	0.16
115	0.17
116	0.16
117	0.15
118	0.19
119	0.19
120	0.19
121	0.17
122	0.18
123	0.14
124	0.14
125	0.14
126	0.11
127	0.14
128	0.14
129	0.13
130	0.12
131	0.13
132	0.13
133	0.13
134	0.11
135	0.09
136	0.08
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.05
149	0.06
150	0.06
151	0.07
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.09
156	0.11
157	0.11
158	0.1
159	0.09
160	0.07
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.1
165	0.12
166	0.14
167	0.15
168	0.16
169	0.16
170	0.2
171	0.22
172	0.21
173	0.2
174	0.21
175	0.24
176	0.3
177	0.3
178	0.26
179	0.25
180	0.22
181	0.2
182	0.19
183	0.16
184	0.09
185	0.11
186	0.13
187	0.14
188	0.17
189	0.2
190	0.22
191	0.25
192	0.28
193	0.33
194	0.4
195	0.37
196	0.39
197	0.36
198	0.37
199	0.38
200	0.39
201	0.38
202	0.31
203	0.33
204	0.32
205	0.31
206	0.27
207	0.23
208	0.2
209	0.15
210	0.13
211	0.1
212	0.08
213	0.07
214	0.07
215	0.1
216	0.09
217	0.09
218	0.1
219	0.12
220	0.11
221	0.12
222	0.12
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.09
235	0.08
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.09
241	0.09
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.1
251	0.14
252	0.16
253	0.22
254	0.2
255	0.23
256	0.28
257	0.33
258	0.33
259	0.32
260	0.31
261	0.29
262	0.3
263	0.33
264	0.33
265	0.34
266	0.39
267	0.44
268	0.47
269	0.49
270	0.48
271	0.48
272	0.47
273	0.47
274	0.5
275	0.47
276	0.42
277	0.4
278	0.4
279	0.36
280	0.37
281	0.39
282	0.34
283	0.3
284	0.32
285	0.35
286	0.34
287	0.44
288	0.46
289	0.49
290	0.49
291	0.56
292	0.56
293	0.58
294	0.66
295	0.65
296	0.65
297	0.64
298	0.67
299	0.64
300	0.7
301	0.69
302	0.63
303	0.61
304	0.54
305	0.46
306	0.41
307	0.39
308	0.3
309	0.3
310	0.26
311	0.2
312	0.2
313	0.2
314	0.2
315	0.25
316	0.26
317	0.25
318	0.28
319	0.32
320	0.33
321	0.34
322	0.39
323	0.38
324	0.37
325	0.33
326	0.3
327	0.26
328	0.25
329	0.23
330	0.16
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.1
335	0.08
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.08
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.13
348	0.15
349	0.19
350	0.21
351	0.18
352	0.17
353	0.17
354	0.19
355	0.19
356	0.18
357	0.17
358	0.17
359	0.19
360	0.21
361	0.2
362	0.18
363	0.17
364	0.15
365	0.14
366	0.12
367	0.1
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.1
373	0.11
374	0.13
375	0.14
376	0.16
377	0.17
378	0.17
379	0.17
380	0.15
381	0.16
382	0.16
383	0.16
384	0.15
385	0.21
386	0.21
387	0.23
388	0.23
389	0.2
390	0.19
391	0.17
392	0.15
393	0.09
394	0.08
395	0.07
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.07
400	0.07
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.14
405	0.14
406	0.14
407	0.15
408	0.15
409	0.16
410	0.19
411	0.21
412	0.19
413	0.21
414	0.21
415	0.23
416	0.27
417	0.25
418	0.25
419	0.23
420	0.22
421	0.21
422	0.22
423	0.22
424	0.2
425	0.17
426	0.14
427	0.14
428	0.14
429	0.24
430	0.28
431	0.33
432	0.35
433	0.41
434	0.46
435	0.51
436	0.5
437	0.41
438	0.37
439	0.3
440	0.28
441	0.23
442	0.19
443	0.14
444	0.14
445	0.12
446	0.12
447	0.16
448	0.17
449	0.21
450	0.23
451	0.3
452	0.36
453	0.42
454	0.48
455	0.53
456	0.59
457	0.63
458	0.61
459	0.55
460	0.49
461	0.45
462	0.39
463	0.3
464	0.24
465	0.16
466	0.16
467	0.13
468	0.12
469	0.11
470	0.1
471	0.08
472	0.09
473	0.09
474	0.1
475	0.13
476	0.16
477	0.17
478	0.17
479	0.17
480	0.16
481	0.16
482	0.14
483	0.11
484	0.09
485	0.09
486	0.08
487	0.08
488	0.08
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.05
493	0.06
494	0.07
495	0.08
496	0.12
497	0.17
498	0.17
499	0.18
500	0.18
501	0.18
502	0.18
503	0.17
504	0.16
505	0.11
506	0.11
507	0.1
508	0.1
509	0.1
510	0.09
511	0.09
512	0.05
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.05
517	0.06
518	0.06
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.06
533	0.06
534	0.05
535	0.06
536	0.07
537	0.08
538	0.12
539	0.12
540	0.14
541	0.17
542	0.19
543	0.21
544	0.24
545	0.3
546	0.35
547	0.37
548	0.4
549	0.41
550	0.41
551	0.41
552	0.36
553	0.3
554	0.22
555	0.2
556	0.15
557	0.13
558	0.11
559	0.09
560	0.08
561	0.07
562	0.07
563	0.08
564	0.1
565	0.09
566	0.1
567	0.12
568	0.14
569	0.14
570	0.17
571	0.19
572	0.17
573	0.19
574	0.18
575	0.16
576	0.14
577	0.15
578	0.13
579	0.12
580	0.11
581	0.09
582	0.1
583	0.09
584	0.1
585	0.12
586	0.11
587	0.09
588	0.11
589	0.12
590	0.1
591	0.12
592	0.11
593	0.1
594	0.09
595	0.09
596	0.08
597	0.07
598	0.07
599	0.05
600	0.05
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.04
605	0.04
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.07
614	0.07
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.08
619	0.09
620	0.09
621	0.09
622	0.09
623	0.07
624	0.07
625	0.08
626	0.1
627	0.1
628	0.13
629	0.13
630	0.14
631	0.14
632	0.14
633	0.13
634	0.1
635	0.1
636	0.07
637	0.07
638	0.06
639	0.07
640	0.08
641	0.1
642	0.11
643	0.1
644	0.1
645	0.1
646	0.1
647	0.13
648	0.15
649	0.14
650	0.13
651	0.13
652	0.13
653	0.13
654	0.13
655	0.11
656	0.09
657	0.09
658	0.08
659	0.09
660	0.09
661	0.11
662	0.18
663	0.2
664	0.23
665	0.28
666	0.32
667	0.36
668	0.4
669	0.41
670	0.39
671	0.37
672	0.36
673	0.32
674	0.29
675	0.24
676	0.2
677	0.16
678	0.11
679	0.1
680	0.06
681	0.07
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.06
687	0.07
688	0.07
689	0.06
690	0.07
691	0.07
692	0.08
693	0.09
694	0.12
695	0.11
696	0.1
697	0.1
698	0.09
699	0.14
700	0.16
701	0.19
702	0.16
703	0.17
704	0.19
705	0.23
706	0.29
707	0.29
708	0.32
709	0.34
710	0.37
711	0.41
712	0.48
713	0.53
714	0.55
715	0.61
716	0.65
717	0.61
718	0.6
719	0.58
720	0.56
721	0.54
722	0.54
723	0.52
724	0.46
725	0.48
726	0.47
727	0.45
728	0.38
729	0.36
730	0.3
731	0.26
732	0.25
733	0.24
734	0.32
735	0.32
736	0.32
737	0.31
738	0.38
739	0.34
740	0.32
741	0.3
742	0.22
743	0.21
744	0.2
745	0.18
746	0.11
747	0.1
748	0.09
749	0.1
750	0.09
751	0.08
752	0.08
753	0.09
754	0.08
755	0.08
756	0.08
757	0.07
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.07
762	0.08
763	0.08
764	0.13
765	0.13
766	0.13
767	0.19
768	0.28
769	0.31
770	0.31
771	0.33
772	0.3
773	0.34
774	0.36
775	0.32
776	0.25
777	0.24
778	0.24
779	0.22
780	0.22
781	0.18
782	0.14
783	0.13
784	0.11
785	0.1
786	0.09
787	0.09
788	0.08
789	0.08
790	0.07
791	0.08
792	0.07
793	0.05
794	0.05
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.06
801	0.07
802	0.08
803	0.09
804	0.09
805	0.1
806	0.11
807	0.12
808	0.14
809	0.15
810	0.14
811	0.15
812	0.15
813	0.14
814	0.14
815	0.13
816	0.11
817	0.09
818	0.08
819	0.06
820	0.06
821	0.05
822	0.04
823	0.04
824	0.04
825	0.05
826	0.07
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.08
831	0.09
832	0.09
833	0.13
834	0.14
835	0.16
836	0.18
837	0.23
838	0.24
839	0.28
840	0.3
841	0.26
842	0.25
843	0.23
844	0.22
845	0.18
846	0.21
847	0.19
848	0.21
849	0.2
850	0.2
851	0.2
852	0.26
853	0.27
854	0.24
855	0.22
856	0.18
857	0.19
858	0.2
859	0.24
860	0.25
861	0.32
862	0.4
863	0.44
864	0.5
865	0.52
866	0.59
867	0.65
868	0.67
869	0.67
870	0.61
871	0.62
872	0.59
873	0.59
874	0.53
875	0.44
876	0.34
877	0.27
878	0.27
879	0.21
880	0.17
881	0.14
882	0.12
883	0.11
884	0.12
885	0.12
886	0.13
887	0.14
888	0.16
889	0.17
890	0.17
891	0.16
892	0.16
893	0.15
894	0.14
895	0.12
896	0.11
897	0.1
898	0.11
899	0.16
900	0.15
901	0.16
902	0.18
903	0.18
904	0.18
905	0.23
906	0.25
907	0.2
908	0.21
909	0.22
910	0.24
911	0.31
912	0.38
913	0.34
914	0.35
915	0.42
916	0.42
917	0.41
918	0.43
919	0.4
920	0.37
921	0.37
922	0.34
923	0.28
924	0.28
925	0.27
926	0.19
927	0.19
928	0.14
929	0.16
930	0.17
931	0.16
932	0.16
933	0.2
934	0.2
935	0.2
936	0.21
937	0.21
938	0.18
939	0.18
940	0.16
941	0.14
942	0.14
943	0.11
944	0.12
945	0.13
946	0.13
947	0.15
948	0.17
949	0.17
950	0.16
951	0.15
952	0.15
953	0.13
954	0.16
955	0.15
956	0.12
957	0.13
958	0.13
959	0.14
960	0.13
961	0.14
962	0.11
963	0.13
964	0.12
965	0.1
966	0.1
967	0.1
968	0.1
969	0.09
970	0.08
971	0.07
972	0.07
973	0.07
974	0.07
975	0.06
976	0.06
977	0.06
978	0.06
979	0.06
980	0.09
981	0.11
982	0.11
983	0.11
984	0.12
985	0.12
986	0.12
987	0.15
988	0.14
989	0.15
990	0.16
991	0.23
992	0.27
993	0.26
994	0.26
995	0.23
996	0.22
997	0.2
998	0.21
999	0.15
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.12
1003	0.12
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.11
1007	0.1
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.08
1011	0.09
1012	0.07
1013	0.08
1014	0.09
1015	0.09
1016	0.11
1017	0.11
1018	0.14
1019	0.16
1020	0.18
1021	0.18
1022	0.2
1023	0.27
1024	0.26
1025	0.27
1026	0.28
1027	0.35
1028	0.42
1029	0.48
1030	0.47
1031	0.42
1032	0.45
1033	0.44
1034	0.45
1035	0.37
1036	0.29
1037	0.23
1038	0.21
1039	0.2
1040	0.16
1041	0.16
1042	0.13
1043	0.14
1044	0.13
1045	0.15
1046	0.15
1047	0.15
1048	0.14
1049	0.13
1050	0.12
1051	0.13
1052	0.13
1053	0.1
1054	0.12
1055	0.12
1056	0.13
1057	0.16
1058	0.18
1059	0.18
1060	0.19
1061	0.22
1062	0.23
1063	0.21
1064	0.2
1065	0.18
1066	0.17
1067	0.15
1068	0.13
1069	0.1
1070	0.08
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.09
1074	0.08
1075	0.07
1076	0.08
1077	0.08
1078	0.11
1079	0.12
1080	0.15
1081	0.17
1082	0.19
1083	0.2
1084	0.26
1085	0.34
1086	0.39
1087	0.46
1088	0.47
1089	0.53
1090	0.57
1091	0.58
1092	0.56
1093	0.52
1094	0.52
1095	0.52
1096	0.56
1097	0.51
1098	0.48
1099	0.46
1100	0.5
1101	0.47
1102	0.43
1103	0.38
1104	0.34
1105	0.32
1106	0.32
1107	0.34
1108	0.33
1109	0.34
1110	0.36
1111	0.41
1112	0.38
1113	0.41
1114	0.47
1115	0.5
1116	0.44
1117	0.43
1118	0.45
1119	0.4
1120	0.38
1121	0.35
1122	0.27
1123	0.27
1124	0.32
1125	0.32
1126	0.31
1127	0.33
1128	0.33
1129	0.38
1130	0.38
1131	0.38
1132	0.36
1133	0.41
1134	0.38
1135	0.37
1136	0.4
1137	0.36
1138	0.39
1139	0.39
1140	0.38
1141	0.32
1142	0.28
1143	0.27
1144	0.24
1145	0.31
1146	0.38
1147	0.35
1148	0.36
1149	0.37
1150	0.43
1151	0.45
1152	0.51
1153	0.54
1154	0.51
1155	0.58
1156	0.55
1157	0.59
1158	0.53
1159	0.51
1160	0.46
1161	0.42
1162	0.38
1163	0.34
1164	0.36
1165	0.39
1166	0.42
1167	0.43
1168	0.48
1169	0.47
1170	0.46
1171	0.44
1172	0.46
1173	0.42
1174	0.48
1175	0.52
1176	0.5
1177	0.47
1178	0.53
1179	0.53
1180	0.56
1181	0.61
1182	0.63
1183	0.65
1184	0.7
1185	0.77
1186	0.76
1187	0.81
1188	0.81
1189	0.8
1190	0.81
1191	0.82
1192	0.82
1193	0.81
1194	0.83
1195	0.76
1196	0.69
1197	0.62
1198	0.56
1199	0.47
1200	0.39
1201	0.3
1202	0.21
1203	0.19
1204	0.18
1205	0.14
1206	0.09
1207	0.08
1208	0.08
1209	0.1
1210	0.09
1211	0.09
1212	0.1
1213	0.11
1214	0.13
1215	0.13
1216	0.13
1217	0.13
1218	0.15
1219	0.16
1220	0.16
1221	0.23
1222	0.26
1223	0.29
1224	0.33
1225	0.38
1226	0.38
1227	0.45
1228	0.45
1229	0.47
1230	0.49
1231	0.54
1232	0.55
1233	0.53
1234	0.54
1235	0.51
1236	0.51
1237	0.45
1238	0.46
1239	0.39
1240	0.35
1241	0.39
1242	0.42
1243	0.39
1244	0.39
1245	0.39
1246	0.37
1247	0.37
1248	0.46
1249	0.42
1250	0.4
1251	0.4
1252	0.45
1253	0.49
1254	0.49
1255	0.53
1256	0.51

A6RFB5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer