FuNGI

A6QSW3

Protein Details

Accession

A6QSW3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-44	TPDLTKEYVTTRRRRNPQTPEAQQESN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, pero 8, cyto_nucl 7.5, nucl 4.5, cysk 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
KEGG	aje:HCAG_00469 -
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MAIAYDLNPMVNLRSGGTPDLTKEYVTTRRRRNPQTPEAQQESNAGLPTPATNKVTAPGAFEPDDTIEEESNESNIEYEDPVNDNEMSDNAGGPSSHDVSEETRMRLEIARLQHEVQQMRTGRGQASTSDENISADLANYLQRKGRTSAIVKILNEFRDQDKVIQGDDATRYRWAILMMSKGIEATTQRRVGTLHWDGGSEFKGQDLKAYCQSRGIAYETTTPDTPQSNGPAERANRIVAEKTRSLLFDSGLAKELWGEAMQAAIMMINTSPTSTKIYGCKQVVPLTPFEAWTGVQPTAHWIRRWGCKVYKKNLKVTNKLADRTDGKEWQLVGYQGLHQYRIWDPIGRRLEIARDVVFDEGLDKGETTPANVVRQSSELPEELDVLDAADGWQHCLLRHLAKVKPDVLKMIANGDLEGAIDPTYLLDNETELVENDEPEDPANEDDPVLSTLTDRPTTVAEAKRSPDWDYWYEAMKKEVSMFENKQTYIVVEKTPGMDILTGKWVFDRKLNNKGETIRFRARWVVRGFLQQQGVHYTKSYAAVVSGPTSRSLFAISTAKGWKAKAIDYVSAFLNGILPQHEMVYMQLPTGIKHGRGGLVGLLRQSLYGMKQAARVWYFLATEHLTTLGFKISPYDGGFLYHPIRKIYLTLHVDDCRVTGPQEQQLDWILAEIAKRFETKDVEENKPYLGMEVKRQMNGDLAVTQNRYIDEILEDFGMDKVNPASTPMAAGIRLEFSPDEDSGLDDDFTATRYRQGLGSLQYLVSSSRPDLAFAVNYLSRFNSRPHKECWAALKHVLRYVKKTKDHGILYKKEMIGGLSPVAYSDSDWAGADPQYKSTTGYIILLNGSPISWRSQRQTSVAKSTTEAEYIAASEAACEVIWLNDMLFDAGLVEGKAKVCSHLRVDNKGAIDLAKGESLTRRSRHIEIRYHILRDLVEKGEIMMEHVGSTANIADGLTKPLARPAFEEFVKRIGLMEIGKKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.17
3	0.18
4	0.21
5	0.2
6	0.21
7	0.26
8	0.25
9	0.23
10	0.22
11	0.27
12	0.34
13	0.42
14	0.48
15	0.53
16	0.63
17	0.73
18	0.81
19	0.85
20	0.86
21	0.87
22	0.89
23	0.87
24	0.86
25	0.82
26	0.73
27	0.65
28	0.57
29	0.49
30	0.4
31	0.32
32	0.23
33	0.17
34	0.15
35	0.17
36	0.18
37	0.2
38	0.2
39	0.2
40	0.21
41	0.23
42	0.28
43	0.26
44	0.27
45	0.25
46	0.28
47	0.27
48	0.27
49	0.26
50	0.22
51	0.23
52	0.19
53	0.19
54	0.15
55	0.15
56	0.17
57	0.15
58	0.14
59	0.13
60	0.11
61	0.1
62	0.1
63	0.1
64	0.1
65	0.1
66	0.12
67	0.14
68	0.15
69	0.17
70	0.16
71	0.15
72	0.15
73	0.14
74	0.14
75	0.12
76	0.12
77	0.1
78	0.1
79	0.1
80	0.11
81	0.15
82	0.15
83	0.15
84	0.15
85	0.16
86	0.18
87	0.27
88	0.29
89	0.26
90	0.25
91	0.25
92	0.26
93	0.27
94	0.28
95	0.25
96	0.27
97	0.3
98	0.32
99	0.33
100	0.36
101	0.4
102	0.4
103	0.36
104	0.38
105	0.35
106	0.36
107	0.37
108	0.35
109	0.3
110	0.3
111	0.29
112	0.23
113	0.28
114	0.28
115	0.26
116	0.26
117	0.25
118	0.22
119	0.21
120	0.2
121	0.13
122	0.1
123	0.09
124	0.08
125	0.12
126	0.13
127	0.15
128	0.18
129	0.2
130	0.24
131	0.26
132	0.31
133	0.33
134	0.36
135	0.42
136	0.46
137	0.49
138	0.46
139	0.49
140	0.49
141	0.43
142	0.41
143	0.36
144	0.29
145	0.29
146	0.3
147	0.27
148	0.27
149	0.27
150	0.25
151	0.24
152	0.22
153	0.2
154	0.24
155	0.23
156	0.2
157	0.2
158	0.19
159	0.18
160	0.19
161	0.16
162	0.15
163	0.16
164	0.18
165	0.18
166	0.18
167	0.18
168	0.17
169	0.16
170	0.14
171	0.14
172	0.15
173	0.21
174	0.24
175	0.24
176	0.25
177	0.26
178	0.26
179	0.32
180	0.32
181	0.29
182	0.25
183	0.26
184	0.25
185	0.27
186	0.27
187	0.19
188	0.15
189	0.12
190	0.15
191	0.14
192	0.19
193	0.21
194	0.23
195	0.3
196	0.33
197	0.32
198	0.32
199	0.34
200	0.3
201	0.29
202	0.28
203	0.21
204	0.2
205	0.26
206	0.25
207	0.27
208	0.26
209	0.24
210	0.23
211	0.23
212	0.23
213	0.19
214	0.21
215	0.23
216	0.24
217	0.25
218	0.29
219	0.29
220	0.31
221	0.29
222	0.26
223	0.23
224	0.24
225	0.27
226	0.25
227	0.28
228	0.26
229	0.26
230	0.26
231	0.25
232	0.26
233	0.23
234	0.19
235	0.19
236	0.19
237	0.19
238	0.19
239	0.18
240	0.15
241	0.14
242	0.14
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.04
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.07
260	0.12
261	0.13
262	0.16
263	0.21
264	0.26
265	0.33
266	0.34
267	0.36
268	0.35
269	0.4
270	0.42
271	0.38
272	0.35
273	0.3
274	0.29
275	0.26
276	0.24
277	0.19
278	0.14
279	0.14
280	0.15
281	0.12
282	0.11
283	0.11
284	0.16
285	0.22
286	0.26
287	0.24
288	0.27
289	0.32
290	0.4
291	0.45
292	0.46
293	0.46
294	0.53
295	0.61
296	0.66
297	0.72
298	0.69
299	0.74
300	0.77
301	0.77
302	0.74
303	0.72
304	0.71
305	0.66
306	0.63
307	0.55
308	0.51
309	0.45
310	0.42
311	0.4
312	0.34
313	0.3
314	0.29
315	0.28
316	0.24
317	0.23
318	0.19
319	0.15
320	0.13
321	0.13
322	0.16
323	0.16
324	0.16
325	0.15
326	0.17
327	0.17
328	0.2
329	0.2
330	0.2
331	0.2
332	0.28
333	0.32
334	0.3
335	0.29
336	0.26
337	0.27
338	0.25
339	0.27
340	0.18
341	0.15
342	0.15
343	0.14
344	0.14
345	0.1
346	0.09
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.08
353	0.09
354	0.09
355	0.12
356	0.13
357	0.15
358	0.15
359	0.16
360	0.14
361	0.16
362	0.16
363	0.14
364	0.14
365	0.12
366	0.12
367	0.12
368	0.11
369	0.1
370	0.09
371	0.08
372	0.06
373	0.05
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.05
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.1
383	0.12
384	0.13
385	0.16
386	0.2
387	0.21
388	0.25
389	0.28
390	0.3
391	0.32
392	0.3
393	0.28
394	0.25
395	0.24
396	0.21
397	0.19
398	0.17
399	0.13
400	0.13
401	0.11
402	0.09
403	0.08
404	0.07
405	0.06
406	0.04
407	0.04
408	0.03
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.06
428	0.07
429	0.08
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.08
439	0.1
440	0.11
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.12
445	0.17
446	0.18
447	0.19
448	0.21
449	0.22
450	0.23
451	0.24
452	0.25
453	0.22
454	0.23
455	0.22
456	0.23
457	0.23
458	0.25
459	0.25
460	0.23
461	0.23
462	0.18
463	0.17
464	0.15
465	0.16
466	0.14
467	0.17
468	0.18
469	0.21
470	0.24
471	0.23
472	0.22
473	0.2
474	0.19
475	0.15
476	0.15
477	0.11
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.11
488	0.11
489	0.1
490	0.11
491	0.13
492	0.12
493	0.16
494	0.24
495	0.24
496	0.34
497	0.37
498	0.38
499	0.39
500	0.43
501	0.46
502	0.42
503	0.44
504	0.4
505	0.37
506	0.37
507	0.42
508	0.38
509	0.39
510	0.36
511	0.32
512	0.28
513	0.33
514	0.34
515	0.3
516	0.32
517	0.25
518	0.24
519	0.26
520	0.25
521	0.2
522	0.19
523	0.16
524	0.14
525	0.15
526	0.14
527	0.09
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.09
532	0.09
533	0.09
534	0.09
535	0.1
536	0.1
537	0.09
538	0.1
539	0.08
540	0.1
541	0.12
542	0.11
543	0.14
544	0.15
545	0.16
546	0.17
547	0.17
548	0.17
549	0.16
550	0.17
551	0.2
552	0.2
553	0.21
554	0.21
555	0.22
556	0.2
557	0.19
558	0.17
559	0.12
560	0.11
561	0.08
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.06
569	0.06
570	0.08
571	0.07
572	0.07
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.13
577	0.14
578	0.12
579	0.13
580	0.14
581	0.13
582	0.13
583	0.13
584	0.11
585	0.11
586	0.11
587	0.1
588	0.1
589	0.09
590	0.08
591	0.08
592	0.07
593	0.07
594	0.09
595	0.11
596	0.11
597	0.15
598	0.16
599	0.2
600	0.2
601	0.19
602	0.17
603	0.17
604	0.17
605	0.14
606	0.16
607	0.12
608	0.12
609	0.11
610	0.11
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.07
615	0.06
616	0.06
617	0.08
618	0.08
619	0.1
620	0.11
621	0.12
622	0.1
623	0.12
624	0.12
625	0.14
626	0.16
627	0.17
628	0.18
629	0.17
630	0.18
631	0.17
632	0.18
633	0.16
634	0.22
635	0.22
636	0.23
637	0.26
638	0.27
639	0.27
640	0.25
641	0.24
642	0.16
643	0.14
644	0.13
645	0.13
646	0.15
647	0.2
648	0.22
649	0.22
650	0.22
651	0.22
652	0.22
653	0.17
654	0.14
655	0.09
656	0.08
657	0.09
658	0.08
659	0.09
660	0.09
661	0.1
662	0.1
663	0.13
664	0.16
665	0.18
666	0.25
667	0.31
668	0.35
669	0.37
670	0.37
671	0.34
672	0.32
673	0.29
674	0.21
675	0.2
676	0.16
677	0.2
678	0.27
679	0.29
680	0.29
681	0.3
682	0.29
683	0.26
684	0.26
685	0.21
686	0.15
687	0.15
688	0.16
689	0.16
690	0.16
691	0.15
692	0.15
693	0.15
694	0.13
695	0.12
696	0.1
697	0.1
698	0.1
699	0.09
700	0.09
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.07
705	0.07
706	0.07
707	0.08
708	0.08
709	0.1
710	0.1
711	0.1
712	0.11
713	0.11
714	0.11
715	0.1
716	0.11
717	0.09
718	0.1
719	0.09
720	0.1
721	0.09
722	0.1
723	0.13
724	0.12
725	0.13
726	0.11
727	0.12
728	0.12
729	0.13
730	0.11
731	0.08
732	0.09
733	0.07
734	0.09
735	0.1
736	0.09
737	0.11
738	0.13
739	0.14
740	0.14
741	0.16
742	0.19
743	0.2
744	0.22
745	0.2
746	0.19
747	0.18
748	0.18
749	0.17
750	0.13
751	0.12
752	0.1
753	0.14
754	0.14
755	0.15
756	0.15
757	0.16
758	0.16
759	0.15
760	0.18
761	0.15
762	0.15
763	0.15
764	0.16
765	0.16
766	0.18
767	0.22
768	0.29
769	0.35
770	0.4
771	0.43
772	0.51
773	0.51
774	0.54
775	0.57
776	0.53
777	0.5
778	0.52
779	0.53
780	0.47
781	0.49
782	0.52
783	0.47
784	0.48
785	0.53
786	0.55
787	0.56
788	0.59
789	0.61
790	0.63
791	0.66
792	0.67
793	0.67
794	0.64
795	0.63
796	0.64
797	0.57
798	0.49
799	0.43
800	0.35
801	0.28
802	0.23
803	0.19
804	0.12
805	0.12
806	0.11
807	0.11
808	0.1
809	0.09
810	0.09
811	0.09
812	0.09
813	0.1
814	0.1
815	0.11
816	0.12
817	0.16
818	0.14
819	0.17
820	0.18
821	0.18
822	0.2
823	0.19
824	0.19
825	0.16
826	0.18
827	0.15
828	0.14
829	0.15
830	0.13
831	0.13
832	0.11
833	0.1
834	0.09
835	0.09
836	0.13
837	0.17
838	0.21
839	0.26
840	0.33
841	0.37
842	0.43
843	0.51
844	0.51
845	0.56
846	0.55
847	0.51
848	0.45
849	0.45
850	0.4
851	0.32
852	0.26
853	0.17
854	0.15
855	0.14
856	0.13
857	0.1
858	0.08
859	0.08
860	0.07
861	0.07
862	0.06
863	0.06
864	0.05
865	0.05
866	0.07
867	0.07
868	0.06
869	0.07
870	0.07
871	0.08
872	0.07
873	0.06
874	0.06
875	0.06
876	0.07
877	0.06
878	0.06
879	0.08
880	0.09
881	0.11
882	0.11
883	0.15
884	0.19
885	0.24
886	0.29
887	0.36
888	0.41
889	0.46
890	0.5
891	0.51
892	0.48
893	0.44
894	0.39
895	0.31
896	0.26
897	0.21
898	0.18
899	0.14
900	0.13
901	0.13
902	0.18
903	0.23
904	0.3
905	0.31
906	0.35
907	0.39
908	0.46
909	0.54
910	0.57
911	0.61
912	0.58
913	0.66
914	0.65
915	0.62
916	0.56
917	0.49
918	0.42
919	0.36
920	0.35
921	0.27
922	0.22
923	0.2
924	0.19
925	0.2
926	0.19
927	0.17
928	0.14
929	0.12
930	0.12
931	0.12
932	0.12
933	0.09
934	0.1
935	0.08
936	0.06
937	0.06
938	0.06
939	0.08
940	0.09
941	0.13
942	0.14
943	0.15
944	0.15
945	0.22
946	0.25
947	0.24
948	0.26
949	0.29
950	0.34
951	0.35
952	0.4
953	0.35
954	0.36
955	0.36
956	0.33
957	0.27
958	0.21
959	0.23
960	0.21

A6QSW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer