Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6QXD1

Protein Details
Accession A6QXD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-229VRAPRPRSRRTSKPTPRQRVYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-223KIAPAPPVKRSPIGGVRAPRPRSRRTSKPTP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
KEGG aje:HCAG_02038  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MNRLPPVSSLMSPPETKPLDSFTRALSPCTSKQSSFDENNTLPPISSHRKRTQSEMDLPSPPVTPYTGNKKQRSNVDDQIESDASAVSSKDPVLFPNNESDILHGEPLFGPQLATVAEHLVDKHMESQMLRFQDKKNKPTRREYMFALSCVPIVGRQYNRNPGAWAMKEREFLDRQLSVTKRVGYETAANLKKIAPAPPVKRSPIGGVRAPRPRSRRTSKPTPRQRVYDSFDVATSTTPKPTRVIGTNRDDTDYRSLPDYCPPIETLYGNTKGLKADWKGQMLDLSNDPDRHQIDPAEVSLAATLRLSCATYLCSKRRIFEARLNALRIGKEFRKTDAQQACKIDVNKASKLWTAYEKVGWFKPEYFRQYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.34
3 0.34
4 0.32
5 0.33
6 0.35
7 0.37
8 0.37
9 0.32
10 0.39
11 0.38
12 0.39
13 0.38
14 0.38
15 0.38
16 0.45
17 0.46
18 0.38
19 0.41
20 0.46
21 0.49
22 0.48
23 0.47
24 0.47
25 0.44
26 0.47
27 0.46
28 0.39
29 0.31
30 0.27
31 0.3
32 0.32
33 0.38
34 0.43
35 0.49
36 0.58
37 0.61
38 0.68
39 0.7
40 0.69
41 0.71
42 0.69
43 0.64
44 0.58
45 0.58
46 0.51
47 0.42
48 0.33
49 0.25
50 0.2
51 0.19
52 0.22
53 0.3
54 0.38
55 0.47
56 0.53
57 0.59
58 0.64
59 0.7
60 0.7
61 0.68
62 0.66
63 0.63
64 0.58
65 0.52
66 0.51
67 0.42
68 0.36
69 0.28
70 0.19
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.1
78 0.1
79 0.12
80 0.17
81 0.19
82 0.19
83 0.24
84 0.25
85 0.24
86 0.24
87 0.23
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.13
115 0.16
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.25
120 0.34
121 0.42
122 0.49
123 0.55
124 0.61
125 0.66
126 0.73
127 0.77
128 0.73
129 0.69
130 0.63
131 0.62
132 0.54
133 0.48
134 0.4
135 0.31
136 0.25
137 0.21
138 0.18
139 0.09
140 0.09
141 0.13
142 0.14
143 0.19
144 0.23
145 0.32
146 0.33
147 0.33
148 0.32
149 0.3
150 0.32
151 0.28
152 0.28
153 0.23
154 0.24
155 0.26
156 0.26
157 0.29
158 0.25
159 0.24
160 0.24
161 0.21
162 0.19
163 0.23
164 0.23
165 0.22
166 0.23
167 0.23
168 0.2
169 0.2
170 0.2
171 0.15
172 0.17
173 0.15
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.2
178 0.2
179 0.22
180 0.21
181 0.21
182 0.17
183 0.23
184 0.27
185 0.34
186 0.38
187 0.37
188 0.36
189 0.35
190 0.35
191 0.33
192 0.33
193 0.3
194 0.3
195 0.35
196 0.42
197 0.44
198 0.46
199 0.46
200 0.48
201 0.54
202 0.57
203 0.61
204 0.62
205 0.7
206 0.74
207 0.8
208 0.84
209 0.86
210 0.83
211 0.78
212 0.76
213 0.72
214 0.67
215 0.62
216 0.53
217 0.43
218 0.38
219 0.33
220 0.27
221 0.2
222 0.18
223 0.13
224 0.16
225 0.17
226 0.18
227 0.18
228 0.2
229 0.23
230 0.26
231 0.33
232 0.36
233 0.42
234 0.46
235 0.45
236 0.46
237 0.42
238 0.38
239 0.38
240 0.32
241 0.26
242 0.23
243 0.23
244 0.22
245 0.27
246 0.27
247 0.21
248 0.21
249 0.21
250 0.2
251 0.2
252 0.2
253 0.18
254 0.21
255 0.23
256 0.23
257 0.23
258 0.22
259 0.21
260 0.22
261 0.24
262 0.2
263 0.26
264 0.3
265 0.32
266 0.32
267 0.32
268 0.34
269 0.29
270 0.29
271 0.23
272 0.22
273 0.23
274 0.23
275 0.23
276 0.26
277 0.26
278 0.25
279 0.25
280 0.21
281 0.21
282 0.21
283 0.21
284 0.17
285 0.15
286 0.14
287 0.13
288 0.12
289 0.1
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.11
298 0.18
299 0.26
300 0.3
301 0.38
302 0.39
303 0.41
304 0.49
305 0.53
306 0.51
307 0.52
308 0.58
309 0.59
310 0.63
311 0.63
312 0.58
313 0.53
314 0.49
315 0.43
316 0.4
317 0.35
318 0.38
319 0.37
320 0.38
321 0.45
322 0.46
323 0.53
324 0.55
325 0.56
326 0.56
327 0.59
328 0.57
329 0.54
330 0.53
331 0.48
332 0.47
333 0.46
334 0.43
335 0.41
336 0.41
337 0.39
338 0.4
339 0.38
340 0.37
341 0.36
342 0.35
343 0.38
344 0.38
345 0.39
346 0.41
347 0.41
348 0.38
349 0.38
350 0.44
351 0.48