FuNGI

A6RDA4

Protein Details

Accession

A6RDA4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
917-943	LCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 8.5, mito 8, cyto_nucl 7, cyto 4.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
KEGG	aje:HCAG_07612 -
Pfam	View protein in Pfam PF14529 Exo_endo_phos_2 PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR

Amino Acid Sequences

MDYLTNLSPPARCLIGGDINVRHDAFEPGAVNLHRGGELVQWASEHGMDFVGEIGVPTHAAGHVIDLTFSNVAFASTTVRQDLHCGSDHQSMITMLPTTPQTQLSDARIKITDSQLEPFADLVRGLMVDMPCPEGVGNVAQLDDLAQHFTQSLLAAAQAVSKPAQQGRTTAPWWTADCRRAHRELTTHQTEAAKHQFKDAVRKAKRAYWRQVINEARDGRDLYRVVAWHKLEPNLRAPPLVIGDQVIEETAAKAEALQQAILKRYNSADDLEYDPLDDEHWSGMGSYTTAASGSATSHEPGNWQSFLTERRAQVRLEGTTTAAHQMQCSTPQGSPLSPKLFLLYLAELLWQNSELRFGYADDLNIWRATHSLDNNATLLRQDIQSILMWGEINKVAFAPEKLEMIHLTRKRHNEAPAVVVSEDLTVHPVTAPAGQEPALRWLGVHFDRRLTWRPHVSTRAKKARAVAQHIRSLGKTRDGPPADALRKAVTTCVVPSLLYGTEAWYGGRTQPARHTGRSGEVSSRLGWHGGTVEKVLTMAARGVLPVFRTTPIATLYRDAGLPSAMVALEEAKMRFATRLQVVDEKHPLASRIAPPMITRGRGAGTRQRSKTKIQRLGALLPAVNRPTLAIPHYSEGCGTDPTEGVDKKSAAQAFKKWWRSQPSTDLYVFSDGSERSLDNSRQVGYGFIVYQGNKQLASFSAALSPMSHVFDAEAVGACRALECAVKLLPCVTEDSSNPQIWLCLDNTSVIWGILGSAAASSNWAYNRCHELLRQHNVGLKWAPGHMGIEGNEEADRLAKRAVSSTAAPAYGLEATPTVSGVRTVAKQLSQEARRKWWSGACGRLSDWYRGWSFSRPTVEYQVKAPPELTMPRHALHRWLALRSSHGDFSWYHRRFQHADARLTCVCGHNKSPEHLVLCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAVAYLGSLTPTDFVELLDCTQFYTRYCTR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.26
3	0.28
4	0.31
5	0.31
6	0.33
7	0.35
8	0.33
9	0.28
10	0.23
11	0.23
12	0.19
13	0.2
14	0.18
15	0.16
16	0.22
17	0.21
18	0.21
19	0.2
20	0.2
21	0.16
22	0.15
23	0.15
24	0.13
25	0.16
26	0.16
27	0.15
28	0.14
29	0.15
30	0.15
31	0.15
32	0.13
33	0.1
34	0.09
35	0.08
36	0.08
37	0.08
38	0.07
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.06
43	0.06
44	0.06
45	0.06
46	0.06
47	0.07
48	0.07
49	0.08
50	0.1
51	0.1
52	0.11
53	0.11
54	0.13
55	0.12
56	0.12
57	0.11
58	0.08
59	0.09
60	0.08
61	0.08
62	0.11
63	0.13
64	0.16
65	0.17
66	0.18
67	0.18
68	0.22
69	0.24
70	0.23
71	0.22
72	0.23
73	0.26
74	0.32
75	0.32
76	0.28
77	0.27
78	0.23
79	0.22
80	0.21
81	0.17
82	0.1
83	0.12
84	0.14
85	0.15
86	0.16
87	0.18
88	0.18
89	0.21
90	0.25
91	0.29
92	0.35
93	0.33
94	0.35
95	0.34
96	0.33
97	0.35
98	0.35
99	0.35
100	0.29
101	0.31
102	0.31
103	0.31
104	0.29
105	0.25
106	0.22
107	0.16
108	0.14
109	0.11
110	0.08
111	0.08
112	0.07
113	0.1
114	0.09
115	0.1
116	0.11
117	0.13
118	0.12
119	0.13
120	0.12
121	0.09
122	0.1
123	0.1
124	0.1
125	0.08
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.07
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.09
139	0.09
140	0.06
141	0.06
142	0.07
143	0.06
144	0.09
145	0.08
146	0.1
147	0.1
148	0.11
149	0.15
150	0.18
151	0.23
152	0.21
153	0.25
154	0.29
155	0.35
156	0.35
157	0.34
158	0.32
159	0.3
160	0.32
161	0.35
162	0.35
163	0.36
164	0.41
165	0.46
166	0.49
167	0.51
168	0.51
169	0.5
170	0.5
171	0.5
172	0.54
173	0.52
174	0.46
175	0.45
176	0.45
177	0.41
178	0.41
179	0.44
180	0.41
181	0.36
182	0.38
183	0.41
184	0.4
185	0.5
186	0.51
187	0.52
188	0.5
189	0.57
190	0.57
191	0.6
192	0.67
193	0.66
194	0.67
195	0.65
196	0.68
197	0.65
198	0.71
199	0.7
200	0.64
201	0.63
202	0.56
203	0.48
204	0.43
205	0.4
206	0.32
207	0.31
208	0.27
209	0.21
210	0.21
211	0.21
212	0.21
213	0.26
214	0.27
215	0.26
216	0.29
217	0.33
218	0.34
219	0.36
220	0.4
221	0.4
222	0.39
223	0.34
224	0.31
225	0.27
226	0.26
227	0.24
228	0.17
229	0.12
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.08
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.08
242	0.11
243	0.11
244	0.12
245	0.13
246	0.16
247	0.19
248	0.22
249	0.19
250	0.17
251	0.18
252	0.2
253	0.19
254	0.19
255	0.17
256	0.16
257	0.19
258	0.19
259	0.18
260	0.16
261	0.15
262	0.13
263	0.12
264	0.1
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.07
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.1
287	0.13
288	0.16
289	0.14
290	0.13
291	0.13
292	0.15
293	0.18
294	0.23
295	0.25
296	0.23
297	0.28
298	0.3
299	0.3
300	0.31
301	0.33
302	0.28
303	0.25
304	0.24
305	0.2
306	0.18
307	0.19
308	0.17
309	0.15
310	0.13
311	0.12
312	0.13
313	0.12
314	0.14
315	0.16
316	0.16
317	0.14
318	0.17
319	0.19
320	0.18
321	0.21
322	0.24
323	0.24
324	0.23
325	0.22
326	0.2
327	0.19
328	0.18
329	0.16
330	0.12
331	0.1
332	0.09
333	0.1
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.1
346	0.11
347	0.11
348	0.1
349	0.11
350	0.12
351	0.12
352	0.11
353	0.08
354	0.08
355	0.1
356	0.12
357	0.12
358	0.16
359	0.16
360	0.17
361	0.18
362	0.17
363	0.16
364	0.12
365	0.12
366	0.09
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.09
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.08
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.1
391	0.12
392	0.19
393	0.21
394	0.25
395	0.3
396	0.34
397	0.38
398	0.42
399	0.44
400	0.41
401	0.39
402	0.38
403	0.34
404	0.31
405	0.26
406	0.21
407	0.17
408	0.12
409	0.1
410	0.06
411	0.07
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.06
417	0.07
418	0.07
419	0.06
420	0.07
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.12
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.14
430	0.15
431	0.19
432	0.16
433	0.17
434	0.19
435	0.23
436	0.29
437	0.28
438	0.31
439	0.33
440	0.36
441	0.39
442	0.47
443	0.51
444	0.53
445	0.59
446	0.63
447	0.59
448	0.58
449	0.56
450	0.54
451	0.51
452	0.52
453	0.5
454	0.44
455	0.45
456	0.44
457	0.42
458	0.36
459	0.34
460	0.27
461	0.24
462	0.23
463	0.22
464	0.29
465	0.29
466	0.29
467	0.28
468	0.34
469	0.31
470	0.29
471	0.27
472	0.19
473	0.19
474	0.18
475	0.15
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.11
495	0.11
496	0.12
497	0.16
498	0.25
499	0.28
500	0.28
501	0.3
502	0.27
503	0.3
504	0.32
505	0.28
506	0.22
507	0.2
508	0.21
509	0.19
510	0.19
511	0.15
512	0.12
513	0.11
514	0.09
515	0.09
516	0.08
517	0.08
518	0.07
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.05
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.05
530	0.05
531	0.06
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.09
536	0.09
537	0.1
538	0.12
539	0.13
540	0.13
541	0.13
542	0.14
543	0.13
544	0.13
545	0.11
546	0.09
547	0.08
548	0.07
549	0.06
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.05
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.07
560	0.07
561	0.08
562	0.08
563	0.11
564	0.13
565	0.14
566	0.16
567	0.2
568	0.21
569	0.25
570	0.27
571	0.24
572	0.22
573	0.21
574	0.2
575	0.16
576	0.19
577	0.17
578	0.18
579	0.18
580	0.18
581	0.18
582	0.23
583	0.24
584	0.21
585	0.19
586	0.16
587	0.17
588	0.18
589	0.21
590	0.23
591	0.3
592	0.37
593	0.41
594	0.47
595	0.49
596	0.55
597	0.62
598	0.65
599	0.65
600	0.58
601	0.6
602	0.57
603	0.56
604	0.5
605	0.42
606	0.32
607	0.24
608	0.24
609	0.19
610	0.15
611	0.12
612	0.11
613	0.1
614	0.11
615	0.11
616	0.11
617	0.12
618	0.15
619	0.16
620	0.15
621	0.14
622	0.14
623	0.14
624	0.12
625	0.11
626	0.1
627	0.09
628	0.1
629	0.15
630	0.14
631	0.14
632	0.16
633	0.16
634	0.16
635	0.21
636	0.23
637	0.21
638	0.24
639	0.27
640	0.33
641	0.42
642	0.49
643	0.48
644	0.53
645	0.58
646	0.61
647	0.62
648	0.62
649	0.58
650	0.55
651	0.52
652	0.46
653	0.38
654	0.34
655	0.29
656	0.2
657	0.18
658	0.13
659	0.13
660	0.13
661	0.12
662	0.12
663	0.17
664	0.18
665	0.19
666	0.21
667	0.2
668	0.2
669	0.2
670	0.18
671	0.14
672	0.14
673	0.11
674	0.11
675	0.12
676	0.12
677	0.14
678	0.16
679	0.16
680	0.15
681	0.14
682	0.14
683	0.12
684	0.15
685	0.14
686	0.11
687	0.12
688	0.13
689	0.13
690	0.12
691	0.13
692	0.11
693	0.12
694	0.11
695	0.09
696	0.09
697	0.09
698	0.09
699	0.08
700	0.08
701	0.07
702	0.07
703	0.07
704	0.06
705	0.06
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.08
711	0.1
712	0.1
713	0.11
714	0.11
715	0.11
716	0.11
717	0.14
718	0.13
719	0.14
720	0.15
721	0.22
722	0.26
723	0.25
724	0.25
725	0.22
726	0.21
727	0.19
728	0.21
729	0.15
730	0.11
731	0.11
732	0.12
733	0.12
734	0.13
735	0.12
736	0.09
737	0.08
738	0.07
739	0.06
740	0.06
741	0.06
742	0.04
743	0.04
744	0.04
745	0.04
746	0.05
747	0.05
748	0.08
749	0.1
750	0.13
751	0.14
752	0.17
753	0.24
754	0.25
755	0.26
756	0.27
757	0.34
758	0.41
759	0.47
760	0.46
761	0.41
762	0.44
763	0.43
764	0.44
765	0.36
766	0.28
767	0.23
768	0.2
769	0.2
770	0.15
771	0.16
772	0.13
773	0.14
774	0.12
775	0.15
776	0.15
777	0.14
778	0.13
779	0.13
780	0.12
781	0.13
782	0.13
783	0.1
784	0.11
785	0.12
786	0.13
787	0.15
788	0.17
789	0.17
790	0.18
791	0.21
792	0.22
793	0.21
794	0.2
795	0.17
796	0.17
797	0.15
798	0.13
799	0.09
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.09
804	0.08
805	0.07
806	0.08
807	0.08
808	0.11
809	0.11
810	0.15
811	0.17
812	0.19
813	0.2
814	0.26
815	0.34
816	0.39
817	0.45
818	0.47
819	0.53
820	0.57
821	0.58
822	0.55
823	0.51
824	0.52
825	0.52
826	0.55
827	0.5
828	0.47
829	0.46
830	0.49
831	0.47
832	0.43
833	0.38
834	0.34
835	0.32
836	0.32
837	0.34
838	0.33
839	0.34
840	0.36
841	0.41
842	0.38
843	0.41
844	0.47
845	0.5
846	0.44
847	0.43
848	0.45
849	0.4
850	0.38
851	0.35
852	0.27
853	0.27
854	0.32
855	0.32
856	0.31
857	0.33
858	0.34
859	0.38
860	0.38
861	0.38
862	0.36
863	0.41
864	0.38
865	0.38
866	0.4
867	0.36
868	0.4
869	0.39
870	0.39
871	0.32
872	0.29
873	0.27
874	0.25
875	0.31
876	0.38
877	0.35
878	0.36
879	0.37
880	0.43
881	0.45
882	0.51
883	0.54
884	0.51
885	0.58
886	0.56
887	0.59
888	0.54
889	0.52
890	0.46
891	0.42
892	0.39
893	0.35
894	0.37
895	0.39
896	0.43
897	0.44
898	0.48
899	0.48
900	0.47
901	0.45
902	0.47
903	0.43
904	0.48
905	0.53
906	0.51
907	0.48
908	0.53
909	0.54
910	0.57
911	0.62
912	0.63
913	0.65
914	0.71
915	0.78
916	0.76
917	0.82
918	0.81
919	0.81
920	0.82
921	0.83
922	0.82
923	0.81
924	0.84
925	0.77
926	0.7
927	0.63
928	0.57
929	0.48
930	0.39
931	0.31
932	0.22
933	0.2
934	0.19
935	0.15
936	0.1
937	0.09
938	0.09
939	0.1
940	0.09
941	0.09
942	0.11
943	0.12
944	0.13
945	0.14
946	0.14
947	0.14
948	0.16
949	0.17
950	0.17

A6RDA4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer