FuNGI

A6RCC1

Protein Details

Accession

A6RCC1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
293-317	DSDNKAAVKKKKRRKQEIQVDRTGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
299-307	AVKKKKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 4, pero 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR045209 Rrp5 IPR022967 S1_dom IPR003029 S1_domain IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	aje:HCAG_07279 -
Pfam	View protein in Pfam PF01535 PPR PF00575 S1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50126 S1
CDD	cd05707 S1_Rrp5_repeat_sc11 cd05708 S1_Rrp5_repeat_sc12

Amino Acid Sequences

MRSSRVLSSSLPIQDPEISSISQIKVNDIVRGFVRRVADNGLFVTLGHNVIAYVRISDLSDSYLKEWQNEFQVNQLVRGRVILADAESNKLQMSLKESVLDPNYKTPITIKDLKRGQTVTGKVRNVEEFGAFIVIDGTANLSGLCHRTEMAEGKVEDARKLFEKGDIVKAKIVKIDLNKERISLGLKASYFKDSDDESDGENVQGESEEIVSESEDDGDMDLELESGNDISMGGVDLEDTMNGDNSESDSSDGDVQMTGTKDAGITGGLVTSGFDWNGNNTIGSDEDNESDSDSDNKAAVKKKKRRKQEIQVDRTGDLDTNGPQSVADYERLLLGEPNSSFLWLKYMAFQLELSEVDKAREIAERALRSISIGQDTEKFNIWVAMLNLENTFGNDDTLEDVFKRACQYNDPQEIHERLTSIYIQSGKHDKADELFQAILKKKFTQSPKIYLNFATFLFDTLAEPERGRALLPRAIQSLPTHTHVDITSKFGQLEFRSPNGDVERGRTIFEGLISSFPKRVDLWNVLLDLEIKNGDMEQVRGLFLKRFWGWDIPLRRTRLCSAWAKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.28
4	0.24
5	0.2
6	0.21
7	0.24
8	0.24
9	0.24
10	0.23
11	0.21
12	0.25
13	0.26
14	0.3
15	0.26
16	0.27
17	0.27
18	0.31
19	0.3
20	0.28
21	0.3
22	0.26
23	0.28
24	0.31
25	0.3
26	0.27
27	0.26
28	0.24
29	0.2
30	0.18
31	0.18
32	0.13
33	0.12
34	0.1
35	0.09
36	0.08
37	0.08
38	0.1
39	0.09
40	0.08
41	0.08
42	0.09
43	0.1
44	0.11
45	0.11
46	0.13
47	0.15
48	0.15
49	0.17
50	0.21
51	0.22
52	0.25
53	0.26
54	0.26
55	0.31
56	0.34
57	0.32
58	0.31
59	0.38
60	0.34
61	0.37
62	0.38
63	0.32
64	0.28
65	0.28
66	0.24
67	0.17
68	0.18
69	0.13
70	0.1
71	0.14
72	0.15
73	0.18
74	0.17
75	0.17
76	0.16
77	0.16
78	0.16
79	0.13
80	0.18
81	0.19
82	0.19
83	0.21
84	0.21
85	0.25
86	0.28
87	0.3
88	0.26
89	0.27
90	0.3
91	0.28
92	0.28
93	0.26
94	0.28
95	0.31
96	0.39
97	0.37
98	0.43
99	0.49
100	0.52
101	0.54
102	0.49
103	0.47
104	0.45
105	0.49
106	0.48
107	0.5
108	0.49
109	0.45
110	0.47
111	0.44
112	0.38
113	0.33
114	0.24
115	0.16
116	0.15
117	0.14
118	0.11
119	0.09
120	0.07
121	0.06
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.04
126	0.05
127	0.05
128	0.04
129	0.06
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.08
134	0.09
135	0.12
136	0.15
137	0.16
138	0.19
139	0.19
140	0.2
141	0.23
142	0.23
143	0.22
144	0.19
145	0.2
146	0.17
147	0.19
148	0.18
149	0.17
150	0.21
151	0.22
152	0.31
153	0.32
154	0.31
155	0.32
156	0.33
157	0.31
158	0.29
159	0.28
160	0.22
161	0.24
162	0.32
163	0.34
164	0.38
165	0.37
166	0.36
167	0.35
168	0.32
169	0.3
170	0.23
171	0.19
172	0.17
173	0.17
174	0.19
175	0.2
176	0.21
177	0.19
178	0.17
179	0.17
180	0.14
181	0.16
182	0.18
183	0.17
184	0.15
185	0.17
186	0.16
187	0.14
188	0.14
189	0.11
190	0.08
191	0.07
192	0.06
193	0.05
194	0.05
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.04
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.05
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.04
252	0.04
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.08
272	0.07
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.09
284	0.12
285	0.19
286	0.27
287	0.36
288	0.46
289	0.56
290	0.63
291	0.73
292	0.8
293	0.83
294	0.86
295	0.86
296	0.88
297	0.85
298	0.83
299	0.74
300	0.64
301	0.54
302	0.43
303	0.32
304	0.22
305	0.16
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.09
314	0.1
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.07
322	0.09
323	0.09
324	0.11
325	0.1
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.13
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.12
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.1
345	0.09
346	0.09
347	0.11
348	0.12
349	0.14
350	0.2
351	0.2
352	0.2
353	0.21
354	0.19
355	0.18
356	0.19
357	0.16
358	0.13
359	0.12
360	0.12
361	0.16
362	0.18
363	0.18
364	0.18
365	0.17
366	0.14
367	0.15
368	0.14
369	0.12
370	0.11
371	0.11
372	0.1
373	0.11
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.08
378	0.1
379	0.08
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.13
391	0.14
392	0.15
393	0.19
394	0.26
395	0.35
396	0.44
397	0.44
398	0.43
399	0.46
400	0.47
401	0.44
402	0.38
403	0.29
404	0.2
405	0.21
406	0.19
407	0.14
408	0.15
409	0.16
410	0.16
411	0.19
412	0.25
413	0.24
414	0.26
415	0.27
416	0.24
417	0.23
418	0.27
419	0.24
420	0.2
421	0.19
422	0.18
423	0.23
424	0.27
425	0.28
426	0.26
427	0.28
428	0.3
429	0.37
430	0.42
431	0.47
432	0.49
433	0.54
434	0.61
435	0.61
436	0.59
437	0.54
438	0.5
439	0.41
440	0.34
441	0.28
442	0.2
443	0.18
444	0.17
445	0.15
446	0.13
447	0.13
448	0.16
449	0.14
450	0.14
451	0.14
452	0.15
453	0.14
454	0.14
455	0.16
456	0.17
457	0.21
458	0.24
459	0.26
460	0.28
461	0.28
462	0.3
463	0.28
464	0.3
465	0.28
466	0.29
467	0.29
468	0.26
469	0.28
470	0.26
471	0.3
472	0.25
473	0.28
474	0.27
475	0.26
476	0.26
477	0.24
478	0.29
479	0.26
480	0.32
481	0.3
482	0.29
483	0.31
484	0.31
485	0.36
486	0.34
487	0.36
488	0.29
489	0.3
490	0.35
491	0.32
492	0.33
493	0.28
494	0.27
495	0.23
496	0.22
497	0.2
498	0.13
499	0.17
500	0.18
501	0.2
502	0.21
503	0.2
504	0.22
505	0.21
506	0.24
507	0.27
508	0.31
509	0.33
510	0.34
511	0.35
512	0.32
513	0.31
514	0.28
515	0.21
516	0.17
517	0.13
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.12
522	0.12
523	0.13
524	0.14
525	0.15
526	0.16
527	0.17
528	0.19
529	0.2
530	0.19
531	0.26
532	0.24
533	0.26
534	0.29
535	0.33
536	0.35
537	0.41
538	0.48
539	0.49
540	0.55
541	0.57
542	0.57
543	0.56
544	0.57
545	0.53
546	0.53

A6RCC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer