Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RHC4

Protein Details
Accession A6RHC4    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
372-397WDDRGVHAKRKGPKGKRGKNGNEVVGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
276-281RRKKRK
378-390HAKRKGPKGKRGK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG aje:HCAG_09041  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRRQWIDKKSATTYQLFHRSQNDPLIHDPDADDRILHKISGTPTTESSLKPSELPSGQSHFVEATPVKGKGKIKGMRLEEALKETSLDDVEDLASVRHHDALSTASTYSRKQTYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLRETLEALEDDAFVDGDEDGDFFESLVQGGIDAEVDASEWRDTHIEDDDEGWESDATEKASKQPSVSTKAATPPAKGPVDDEHIPDTAAGEGDWLRNFAQYKKDMKSKPSATSTQRETVSVLHAGTVASTMFTAGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERIEALYAVDEQGEDYDGSSMADDMSVVSGMSTVSEIPSLVSGGTPLRSDFNQIMDGFLDGWDDRGVHAKRKGPKGKRGKNGNEVVGIRMLDEIRQGLGPARLPGKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.57
3 0.56
4 0.58
5 0.54
6 0.52
7 0.51
8 0.49
9 0.5
10 0.55
11 0.48
12 0.42
13 0.45
14 0.45
15 0.39
16 0.37
17 0.33
18 0.29
19 0.28
20 0.25
21 0.2
22 0.16
23 0.21
24 0.21
25 0.19
26 0.15
27 0.18
28 0.21
29 0.27
30 0.29
31 0.26
32 0.27
33 0.31
34 0.33
35 0.29
36 0.31
37 0.29
38 0.27
39 0.26
40 0.26
41 0.28
42 0.27
43 0.31
44 0.3
45 0.31
46 0.32
47 0.31
48 0.3
49 0.24
50 0.22
51 0.24
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.23
56 0.24
57 0.29
58 0.32
59 0.33
60 0.43
61 0.44
62 0.46
63 0.52
64 0.55
65 0.54
66 0.54
67 0.52
68 0.43
69 0.42
70 0.36
71 0.28
72 0.24
73 0.2
74 0.18
75 0.14
76 0.12
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.13
95 0.15
96 0.16
97 0.2
98 0.22
99 0.21
100 0.23
101 0.32
102 0.4
103 0.48
104 0.55
105 0.52
106 0.51
107 0.52
108 0.5
109 0.41
110 0.32
111 0.22
112 0.15
113 0.13
114 0.11
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.07
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.12
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.2
187 0.23
188 0.29
189 0.29
190 0.26
191 0.24
192 0.27
193 0.33
194 0.3
195 0.27
196 0.22
197 0.27
198 0.26
199 0.25
200 0.23
201 0.19
202 0.23
203 0.23
204 0.22
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.16
209 0.13
210 0.08
211 0.07
212 0.05
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.12
222 0.17
223 0.22
224 0.27
225 0.31
226 0.39
227 0.4
228 0.43
229 0.5
230 0.49
231 0.49
232 0.49
233 0.51
234 0.48
235 0.51
236 0.51
237 0.47
238 0.43
239 0.38
240 0.34
241 0.28
242 0.26
243 0.21
244 0.16
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.08
259 0.1
260 0.16
261 0.24
262 0.35
263 0.42
264 0.46
265 0.55
266 0.62
267 0.7
268 0.75
269 0.77
270 0.77
271 0.79
272 0.8
273 0.71
274 0.63
275 0.53
276 0.43
277 0.34
278 0.24
279 0.18
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.12
286 0.14
287 0.18
288 0.2
289 0.21
290 0.22
291 0.23
292 0.24
293 0.3
294 0.29
295 0.26
296 0.24
297 0.23
298 0.21
299 0.2
300 0.2
301 0.13
302 0.13
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.13
345 0.13
346 0.18
347 0.18
348 0.2
349 0.23
350 0.22
351 0.22
352 0.2
353 0.2
354 0.16
355 0.14
356 0.13
357 0.08
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.18
363 0.2
364 0.26
365 0.33
366 0.39
367 0.47
368 0.58
369 0.68
370 0.68
371 0.76
372 0.8
373 0.84
374 0.87
375 0.9
376 0.88
377 0.88
378 0.86
379 0.8
380 0.76
381 0.66
382 0.59
383 0.51
384 0.41
385 0.31
386 0.26
387 0.22
388 0.15
389 0.16
390 0.14
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.18
396 0.19
397 0.22