FuNGI

A6QY00

Protein Details

Accession

A6QY00

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
37-71	SRSERRDRDRDLDRERKRRDRSRERRHERDADGDE	Basic
82-115	SANGSNRSRKRSRSRDSGKRHSRRDRDDPYRSSG	Basic
149-176	ERDDDRRSSKRDRDGRRRSPSSSRRRSR	Basic
460-480	EPTPDEKRKVPKPQVNAKPLP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
41-107	RRDRDRDLDRERKRRDRSRERRHERDADGDEEMKSPKSDRASANGSNRSRKRSRSRDSGKRHSRRDR
144-176	RSRRDERDDDRRSSKRDRDGRRRSPSSSRRRSR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	aje:HCAG_02257 -
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12283 RRM1_RBM39_like cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MSGIDVEALLESTAAPAAPPYPPEETPDKSHDESNGSRSERRDRDRDLDRERKRRDRSRERRHERDADGDEEMKSPKSDRASANGSNRSRKRSRSRDSGKRHSRRDRDDPYRSSGGDYYRGPGRTTRSRSRSPYDDRYYRPTGRSRRDERDDDRRSSKRDRDGRRRSPSSSRRRSRSPEPQLTEDERDRRTVFVQQLAARLRTKELIAFFEKVGPVKEAQIVKDRVSGRSKGVGYVEFKNEESVPLAIQLTGQKLLGIPIIAQLTEAEKNRQARNPEANVSGNQNSIPFHRLYVGNIHFSITESDLQKVFEPFGELDFVQLQKEEGGRSRGYGFVQFRDPNQAREALEKMNGFDLAGRPIRVGLGNDKFTPESTANLLQRFQGQGAHHNFQGSLFSGHGGRGAQAGGSGHFDRAGGRDNDKAAGGASALDDTDVAGVNFNNYSRDALMRKLARTDEPAVEPTPDEKRKVPKPQVNAKPLPVSVNMASRCVLLRNMFDPAEEEGESWIKELEDDVRAECEDKYGHVVHIALDPNTQGDIYLKFDRVQGGENAIKGLNGRFFGGRQISAQPVVDAVYSSLFTRSKAI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.05
3	0.06
4	0.07
5	0.09
6	0.11
7	0.14
8	0.19
9	0.2
10	0.25
11	0.31
12	0.34
13	0.38
14	0.42
15	0.45
16	0.42
17	0.44
18	0.42
19	0.43
20	0.42
21	0.42
22	0.45
23	0.42
24	0.44
25	0.46
26	0.53
27	0.56
28	0.6
29	0.62
30	0.61
31	0.66
32	0.71
33	0.76
34	0.76
35	0.77
36	0.8
37	0.82
38	0.85
39	0.86
40	0.87
41	0.88
42	0.89
43	0.89
44	0.91
45	0.92
46	0.93
47	0.93
48	0.93
49	0.92
50	0.9
51	0.82
52	0.8
53	0.73
54	0.65
55	0.59
56	0.51
57	0.42
58	0.35
59	0.33
60	0.25
61	0.21
62	0.19
63	0.21
64	0.24
65	0.29
66	0.3
67	0.35
68	0.4
69	0.47
70	0.53
71	0.58
72	0.58
73	0.62
74	0.65
75	0.67
76	0.67
77	0.69
78	0.72
79	0.73
80	0.77
81	0.78
82	0.84
83	0.85
84	0.89
85	0.9
86	0.9
87	0.89
88	0.91
89	0.9
90	0.9
91	0.88
92	0.88
93	0.88
94	0.87
95	0.86
96	0.8
97	0.77
98	0.71
99	0.62
100	0.54
101	0.47
102	0.4
103	0.36
104	0.32
105	0.28
106	0.29
107	0.3
108	0.28
109	0.29
110	0.33
111	0.38
112	0.46
113	0.52
114	0.54
115	0.61
116	0.67
117	0.7
118	0.72
119	0.7
120	0.72
121	0.71
122	0.71
123	0.67
124	0.68
125	0.69
126	0.64
127	0.61
128	0.6
129	0.61
130	0.63
131	0.69
132	0.7
133	0.72
134	0.75
135	0.78
136	0.75
137	0.77
138	0.74
139	0.7
140	0.71
141	0.67
142	0.66
143	0.66
144	0.67
145	0.66
146	0.68
147	0.73
148	0.75
149	0.81
150	0.85
151	0.86
152	0.84
153	0.79
154	0.81
155	0.8
156	0.8
157	0.8
158	0.79
159	0.75
160	0.78
161	0.8
162	0.79
163	0.8
164	0.79
165	0.78
166	0.74
167	0.71
168	0.69
169	0.66
170	0.61
171	0.56
172	0.51
173	0.42
174	0.4
175	0.37
176	0.33
177	0.3
178	0.31
179	0.28
180	0.27
181	0.3
182	0.28
183	0.32
184	0.33
185	0.35
186	0.3
187	0.28
188	0.25
189	0.22
190	0.21
191	0.18
192	0.17
193	0.19
194	0.2
195	0.21
196	0.2
197	0.21
198	0.21
199	0.19
200	0.18
201	0.15
202	0.13
203	0.12
204	0.17
205	0.16
206	0.17
207	0.25
208	0.26
209	0.25
210	0.31
211	0.31
212	0.3
213	0.33
214	0.33
215	0.27
216	0.31
217	0.31
218	0.26
219	0.26
220	0.25
221	0.24
222	0.26
223	0.26
224	0.22
225	0.21
226	0.21
227	0.2
228	0.17
229	0.15
230	0.12
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.07
235	0.08
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.08
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.06
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.11
253	0.11
254	0.11
255	0.15
256	0.19
257	0.22
258	0.26
259	0.27
260	0.3
261	0.36
262	0.37
263	0.36
264	0.35
265	0.33
266	0.3
267	0.31
268	0.26
269	0.19
270	0.16
271	0.14
272	0.12
273	0.12
274	0.14
275	0.1
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.18
281	0.18
282	0.18
283	0.18
284	0.18
285	0.16
286	0.16
287	0.16
288	0.1
289	0.12
290	0.11
291	0.12
292	0.12
293	0.13
294	0.13
295	0.12
296	0.11
297	0.08
298	0.09
299	0.08
300	0.08
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.12
314	0.12
315	0.13
316	0.14
317	0.15
318	0.15
319	0.2
320	0.19
321	0.18
322	0.23
323	0.23
324	0.22
325	0.31
326	0.31
327	0.27
328	0.28
329	0.29
330	0.24
331	0.26
332	0.27
333	0.19
334	0.21
335	0.19
336	0.18
337	0.15
338	0.14
339	0.12
340	0.11
341	0.1
342	0.12
343	0.13
344	0.12
345	0.11
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.15
351	0.19
352	0.21
353	0.21
354	0.22
355	0.22
356	0.21
357	0.24
358	0.17
359	0.14
360	0.15
361	0.21
362	0.22
363	0.23
364	0.23
365	0.2
366	0.22
367	0.21
368	0.18
369	0.17
370	0.15
371	0.22
372	0.28
373	0.29
374	0.28
375	0.27
376	0.27
377	0.22
378	0.23
379	0.16
380	0.11
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.1
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.06
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.1
395	0.11
396	0.1
397	0.1
398	0.1
399	0.1
400	0.11
401	0.17
402	0.15
403	0.17
404	0.2
405	0.2
406	0.21
407	0.21
408	0.19
409	0.14
410	0.11
411	0.09
412	0.07
413	0.06
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.07
426	0.07
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.11
431	0.15
432	0.15
433	0.17
434	0.24
435	0.27
436	0.27
437	0.3
438	0.31
439	0.3
440	0.34
441	0.36
442	0.32
443	0.31
444	0.32
445	0.29
446	0.28
447	0.26
448	0.24
449	0.29
450	0.29
451	0.29
452	0.32
453	0.4
454	0.48
455	0.59
456	0.66
457	0.64
458	0.7
459	0.77
460	0.82
461	0.82
462	0.78
463	0.72
464	0.66
465	0.59
466	0.53
467	0.43
468	0.38
469	0.3
470	0.33
471	0.29
472	0.26
473	0.26
474	0.23
475	0.23
476	0.2
477	0.21
478	0.16
479	0.19
480	0.19
481	0.23
482	0.22
483	0.22
484	0.22
485	0.21
486	0.21
487	0.18
488	0.17
489	0.15
490	0.17
491	0.17
492	0.15
493	0.13
494	0.1
495	0.1
496	0.11
497	0.12
498	0.13
499	0.14
500	0.15
501	0.16
502	0.17
503	0.18
504	0.17
505	0.16
506	0.14
507	0.14
508	0.18
509	0.17
510	0.17
511	0.18
512	0.18
513	0.17
514	0.21
515	0.23
516	0.19
517	0.18
518	0.18
519	0.17
520	0.17
521	0.15
522	0.1
523	0.1
524	0.11
525	0.16
526	0.2
527	0.21
528	0.21
529	0.23
530	0.26
531	0.26
532	0.27
533	0.24
534	0.27
535	0.28
536	0.27
537	0.27
538	0.24
539	0.23
540	0.21
541	0.22
542	0.19
543	0.17
544	0.19
545	0.18
546	0.19
547	0.26
548	0.28
549	0.26
550	0.25
551	0.28
552	0.3
553	0.31
554	0.31
555	0.24
556	0.2
557	0.2
558	0.17
559	0.14
560	0.11
561	0.1
562	0.1
563	0.11
564	0.15
565	0.15

A6QY00

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer