FuNGI

A6QX31

Protein Details

Accession

A6QX31

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-29	GVELTAEKKRKRTSEKPDRPSKKPALAP	Hydrophilic
63-82	LTAYSKPRHQNRPSASKQNA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-25	KKRKRTSEKPDRPSKKP
493-516	AGARRIAKLRVPVEFPKVSRGGRR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	aje:HCAG_01938 -
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MGVELTAEKKRKRTSEKPDRPSKKPALAPVAPAVKVQFVQNTNGLVPIIASTPGINLPNSIPLTAYSKPRHQNRPSASKQNAAANTTLSTSEFLLQSSAHPRIDFIGKEGENELDTLWNHYVAVYDSDARTLELMEARKMTVRSCVRRVPRKPTNDEGSDGDLAMQSNWAKRTALTEAFGTKQSRKAIISVAENALLSNAPAGLSPSAAENALLSSIPKDHPTASGGSPQKTAQAEIQAAKPLPQPNLAATHPSQVYAIETLVPNGLSTLRTMPVKEWQTSIAAGEPVLSSSRFVAHRVDHVVRSGDATQLQLLRYIMVLIQLSRSLKPSRGGGASSAMAAGSKKLPPREDLRRILSSSSYTQPGRTATATATATTATATATATAMTSTSNPSPLLPDSFLEALRRKFVPQRYFLSKTDVTFLHTTICALSLHIPPEAGFSHNELATDPADLRDDLGLEFHTIQQYFRELGCKVGKPRESEFAKWGVRSKVEAGARRIAKLRVPVEFPKVSRGGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.8
3	0.87
4	0.89
5	0.92
6	0.9
7	0.87
8	0.87
9	0.84
10	0.82
11	0.77
12	0.75
13	0.73
14	0.67
15	0.65
16	0.62
17	0.58
18	0.49
19	0.44
20	0.36
21	0.29
22	0.27
23	0.26
24	0.25
25	0.22
26	0.25
27	0.27
28	0.28
29	0.26
30	0.26
31	0.23
32	0.16
33	0.14
34	0.12
35	0.1
36	0.08
37	0.08
38	0.07
39	0.09
40	0.12
41	0.13
42	0.12
43	0.13
44	0.13
45	0.2
46	0.2
47	0.19
48	0.17
49	0.17
50	0.22
51	0.24
52	0.32
53	0.3
54	0.38
55	0.47
56	0.56
57	0.65
58	0.67
59	0.73
60	0.74
61	0.79
62	0.79
63	0.8
64	0.75
65	0.7
66	0.67
67	0.65
68	0.59
69	0.5
70	0.43
71	0.34
72	0.31
73	0.26
74	0.23
75	0.16
76	0.13
77	0.12
78	0.14
79	0.12
80	0.12
81	0.11
82	0.11
83	0.13
84	0.18
85	0.21
86	0.2
87	0.19
88	0.2
89	0.22
90	0.26
91	0.23
92	0.2
93	0.24
94	0.23
95	0.25
96	0.25
97	0.23
98	0.19
99	0.19
100	0.17
101	0.11
102	0.12
103	0.14
104	0.13
105	0.12
106	0.12
107	0.12
108	0.12
109	0.1
110	0.12
111	0.1
112	0.11
113	0.11
114	0.13
115	0.13
116	0.12
117	0.11
118	0.1
119	0.1
120	0.12
121	0.13
122	0.14
123	0.14
124	0.15
125	0.18
126	0.18
127	0.17
128	0.22
129	0.29
130	0.34
131	0.39
132	0.47
133	0.53
134	0.62
135	0.69
136	0.7
137	0.71
138	0.73
139	0.75
140	0.75
141	0.72
142	0.65
143	0.61
144	0.53
145	0.48
146	0.39
147	0.32
148	0.24
149	0.17
150	0.15
151	0.12
152	0.11
153	0.09
154	0.11
155	0.12
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.16
160	0.19
161	0.2
162	0.18
163	0.18
164	0.19
165	0.21
166	0.24
167	0.24
168	0.21
169	0.24
170	0.25
171	0.26
172	0.25
173	0.25
174	0.24
175	0.25
176	0.26
177	0.24
178	0.22
179	0.2
180	0.19
181	0.17
182	0.14
183	0.1
184	0.08
185	0.05
186	0.04
187	0.03
188	0.03
189	0.05
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.04
202	0.04
203	0.06
204	0.07
205	0.08
206	0.09
207	0.1
208	0.11
209	0.12
210	0.14
211	0.14
212	0.21
213	0.22
214	0.22
215	0.23
216	0.22
217	0.25
218	0.22
219	0.23
220	0.16
221	0.16
222	0.17
223	0.17
224	0.18
225	0.16
226	0.16
227	0.16
228	0.18
229	0.18
230	0.17
231	0.18
232	0.17
233	0.16
234	0.2
235	0.19
236	0.18
237	0.16
238	0.18
239	0.17
240	0.16
241	0.15
242	0.11
243	0.12
244	0.09
245	0.09
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.07
250	0.06
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.05
255	0.05
256	0.06
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.17
262	0.19
263	0.2
264	0.19
265	0.19
266	0.19
267	0.19
268	0.18
269	0.12
270	0.09
271	0.08
272	0.08
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.06
277	0.05
278	0.06
279	0.09
280	0.09
281	0.1
282	0.13
283	0.13
284	0.16
285	0.21
286	0.22
287	0.2
288	0.21
289	0.21
290	0.18
291	0.19
292	0.17
293	0.13
294	0.11
295	0.11
296	0.11
297	0.12
298	0.12
299	0.11
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.07
309	0.09
310	0.1
311	0.11
312	0.14
313	0.14
314	0.16
315	0.19
316	0.2
317	0.21
318	0.21
319	0.21
320	0.19
321	0.2
322	0.18
323	0.15
324	0.13
325	0.1
326	0.09
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.1
331	0.14
332	0.18
333	0.2
334	0.23
335	0.31
336	0.4
337	0.46
338	0.5
339	0.52
340	0.52
341	0.52
342	0.5
343	0.43
344	0.36
345	0.31
346	0.28
347	0.26
348	0.23
349	0.23
350	0.24
351	0.23
352	0.23
353	0.2
354	0.18
355	0.14
356	0.19
357	0.19
358	0.17
359	0.16
360	0.13
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.09
376	0.1
377	0.12
378	0.12
379	0.12
380	0.15
381	0.16
382	0.18
383	0.16
384	0.16
385	0.17
386	0.18
387	0.19
388	0.21
389	0.23
390	0.22
391	0.25
392	0.25
393	0.25
394	0.31
395	0.4
396	0.43
397	0.45
398	0.51
399	0.55
400	0.6
401	0.58
402	0.58
403	0.52
404	0.45
405	0.44
406	0.37
407	0.33
408	0.28
409	0.27
410	0.22
411	0.2
412	0.19
413	0.15
414	0.16
415	0.11
416	0.11
417	0.14
418	0.14
419	0.16
420	0.16
421	0.16
422	0.14
423	0.17
424	0.17
425	0.15
426	0.13
427	0.15
428	0.18
429	0.18
430	0.18
431	0.16
432	0.17
433	0.16
434	0.16
435	0.13
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.13
440	0.11
441	0.11
442	0.1
443	0.11
444	0.1
445	0.11
446	0.12
447	0.13
448	0.16
449	0.16
450	0.16
451	0.17
452	0.19
453	0.19
454	0.19
455	0.22
456	0.18
457	0.25
458	0.31
459	0.36
460	0.39
461	0.47
462	0.5
463	0.51
464	0.55
465	0.58
466	0.57
467	0.55
468	0.53
469	0.52
470	0.52
471	0.49
472	0.51
473	0.47
474	0.44
475	0.43
476	0.41
477	0.4
478	0.44
479	0.47
480	0.46
481	0.5
482	0.5
483	0.5
484	0.52
485	0.47
486	0.44
487	0.46
488	0.45
489	0.41
490	0.46
491	0.47
492	0.51
493	0.54
494	0.5
495	0.49
496	0.51

A6QX31

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer