Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5ACW8

Protein Details
Accession Q5ACW8    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
559-585SVSDAALKRQRNRRKRKLMELKYPSSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
498-501KKRR
566-575KRQRNRRKRK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR011659  PD40  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0000417  C:HIR complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0031491  F:nucleosome binding  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0007059  P:chromosome segregation  
GO:0030448  P:hyphal growth  
GO:0000070  P:mitotic sister chromatid segregation  
GO:1905268  P:negative regulation of chromatin organization  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0016480  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase III  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0034728  P:nucleosome organization  
GO:0006808  P:regulation of nitrogen utilization  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG cal:CAALFM_C200330CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF07676  PD40  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MQILKIPWFGHKTENKTVECYAVTINKDGTRLASGGLDGNVKIWDLTTINVFYKMADQPHKSKKDSTSTKLEESLPDKSLRRPLCSMSRHNGVVTSLKFSPDGRWLASGSDDKICLIWEKDNTQIAKSFGTDEHDLEHWTVRKRLVAHDNDIQDICWSPDGNLLVTVGLDRSVIIWNALTFEKIKRYDIHQSMVKGIVFDPANKFFATASDDRTVRIFRYYKKLNEYNNYEFQMEHVVVDPFKKSPLTSYFRRMSWSPDGQHIAVPNATNGPVPSVAIINRGNWGSDISLIGHEAPVEVCSFSPTLFQIADTPANEEIKFQTVVATGGQDRTLAIWSTCNSRPIVVCSDIVDSSITDICWSPDGETLYFSCLDGSITGVKFGARELGQPVKEDLIDQQLNRYGADRESTILPESVEQLQLEEQSKDSRAISIRRMMPIQEAKPEQTPPISTPASAAIDIERLRKQTVTMTKSGKKRVAPLLVSTSAAPKNVLQKPLEKKRRTKSSSKISQAAYLLPKMGVQTTVHGIKKKAESMSNDTEVEENNDNDDIGENVMANTNSVSDAALKRQRNRRKRKLMELKYPSSFKYISNLPEGLFNNHTLQNIEINKIYKAHSKHKDISAEISSSTAVEIDEDLVFSVVFRVFDHMRKENEVLGQTSGRIRTTIEVRNGKPWDDDISDRDFDDATKVIVTEEGNDKREYCLFFPFRVQHVLPIILNDVLKYYVLCSFHGSVQIISADTGSYRCPTFELGESVVTMRHSQGYMLVLTSSGLFYSWDLKAMKVTMTGISIAAILNNYEIGGKIVVSPIVRGLEINPQDGSPLVLLDMTNDIYGYSIDLQCWVKTVDSWYYGVGADKDLDVVLTGLVKKSKMSYEEDKVTEKIFTYKFDSSNDLEDAMRKRGQELLDLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.57
3 0.57
4 0.57
5 0.51
6 0.43
7 0.37
8 0.32
9 0.3
10 0.3
11 0.28
12 0.31
13 0.29
14 0.3
15 0.28
16 0.26
17 0.23
18 0.21
19 0.19
20 0.16
21 0.15
22 0.16
23 0.17
24 0.16
25 0.13
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.11
34 0.14
35 0.16
36 0.18
37 0.19
38 0.19
39 0.17
40 0.21
41 0.24
42 0.27
43 0.32
44 0.36
45 0.44
46 0.55
47 0.62
48 0.61
49 0.64
50 0.65
51 0.68
52 0.71
53 0.69
54 0.69
55 0.67
56 0.67
57 0.64
58 0.58
59 0.53
60 0.48
61 0.46
62 0.39
63 0.38
64 0.37
65 0.38
66 0.45
67 0.44
68 0.46
69 0.44
70 0.48
71 0.52
72 0.58
73 0.6
74 0.59
75 0.61
76 0.56
77 0.53
78 0.48
79 0.41
80 0.4
81 0.33
82 0.31
83 0.26
84 0.25
85 0.26
86 0.25
87 0.26
88 0.27
89 0.28
90 0.25
91 0.26
92 0.25
93 0.25
94 0.28
95 0.28
96 0.23
97 0.23
98 0.22
99 0.2
100 0.19
101 0.19
102 0.18
103 0.17
104 0.19
105 0.21
106 0.23
107 0.28
108 0.34
109 0.34
110 0.33
111 0.34
112 0.31
113 0.28
114 0.26
115 0.24
116 0.19
117 0.23
118 0.23
119 0.2
120 0.22
121 0.21
122 0.21
123 0.2
124 0.24
125 0.23
126 0.26
127 0.29
128 0.28
129 0.31
130 0.32
131 0.39
132 0.43
133 0.44
134 0.46
135 0.49
136 0.49
137 0.48
138 0.46
139 0.38
140 0.29
141 0.24
142 0.19
143 0.14
144 0.13
145 0.11
146 0.14
147 0.15
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.07
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.13
169 0.2
170 0.22
171 0.25
172 0.25
173 0.3
174 0.4
175 0.42
176 0.45
177 0.42
178 0.42
179 0.41
180 0.42
181 0.37
182 0.27
183 0.23
184 0.23
185 0.19
186 0.2
187 0.22
188 0.22
189 0.23
190 0.22
191 0.22
192 0.17
193 0.18
194 0.22
195 0.19
196 0.21
197 0.24
198 0.24
199 0.25
200 0.27
201 0.27
202 0.22
203 0.27
204 0.27
205 0.27
206 0.37
207 0.43
208 0.47
209 0.55
210 0.61
211 0.6
212 0.64
213 0.67
214 0.64
215 0.63
216 0.59
217 0.5
218 0.43
219 0.37
220 0.33
221 0.25
222 0.18
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.15
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.11
232 0.15
233 0.24
234 0.29
235 0.32
236 0.4
237 0.42
238 0.42
239 0.46
240 0.42
241 0.4
242 0.42
243 0.44
244 0.37
245 0.39
246 0.41
247 0.38
248 0.38
249 0.33
250 0.26
251 0.21
252 0.19
253 0.14
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.14
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.12
297 0.14
298 0.13
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.16
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.09
323 0.09
324 0.15
325 0.16
326 0.18
327 0.17
328 0.18
329 0.19
330 0.2
331 0.23
332 0.19
333 0.18
334 0.17
335 0.19
336 0.17
337 0.17
338 0.14
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.12
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.07
371 0.08
372 0.12
373 0.16
374 0.17
375 0.18
376 0.18
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.13
381 0.14
382 0.15
383 0.14
384 0.16
385 0.18
386 0.18
387 0.18
388 0.18
389 0.13
390 0.12
391 0.13
392 0.12
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.1
407 0.11
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.11
414 0.12
415 0.14
416 0.16
417 0.19
418 0.24
419 0.25
420 0.25
421 0.26
422 0.24
423 0.26
424 0.28
425 0.26
426 0.25
427 0.24
428 0.24
429 0.25
430 0.25
431 0.21
432 0.17
433 0.17
434 0.13
435 0.17
436 0.16
437 0.14
438 0.14
439 0.15
440 0.15
441 0.14
442 0.13
443 0.07
444 0.1
445 0.11
446 0.13
447 0.12
448 0.12
449 0.13
450 0.13
451 0.13
452 0.17
453 0.24
454 0.25
455 0.29
456 0.34
457 0.39
458 0.45
459 0.5
460 0.48
461 0.42
462 0.43
463 0.44
464 0.44
465 0.39
466 0.36
467 0.35
468 0.31
469 0.3
470 0.25
471 0.22
472 0.17
473 0.16
474 0.15
475 0.12
476 0.19
477 0.22
478 0.26
479 0.23
480 0.3
481 0.39
482 0.49
483 0.58
484 0.56
485 0.61
486 0.67
487 0.77
488 0.75
489 0.75
490 0.73
491 0.74
492 0.77
493 0.74
494 0.7
495 0.6
496 0.57
497 0.49
498 0.43
499 0.34
500 0.25
501 0.2
502 0.15
503 0.14
504 0.11
505 0.11
506 0.09
507 0.07
508 0.08
509 0.11
510 0.16
511 0.18
512 0.2
513 0.21
514 0.23
515 0.26
516 0.28
517 0.28
518 0.26
519 0.29
520 0.34
521 0.38
522 0.36
523 0.34
524 0.31
525 0.29
526 0.25
527 0.24
528 0.18
529 0.13
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.1
534 0.1
535 0.07
536 0.05
537 0.05
538 0.04
539 0.04
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.07
549 0.08
550 0.14
551 0.21
552 0.25
553 0.32
554 0.42
555 0.52
556 0.61
557 0.71
558 0.76
559 0.8
560 0.84
561 0.89
562 0.9
563 0.89
564 0.89
565 0.86
566 0.8
567 0.73
568 0.67
569 0.57
570 0.49
571 0.41
572 0.3
573 0.26
574 0.25
575 0.23
576 0.25
577 0.24
578 0.21
579 0.25
580 0.26
581 0.25
582 0.23
583 0.22
584 0.21
585 0.22
586 0.22
587 0.17
588 0.16
589 0.19
590 0.19
591 0.19
592 0.19
593 0.18
594 0.19
595 0.2
596 0.21
597 0.21
598 0.25
599 0.34
600 0.39
601 0.46
602 0.51
603 0.55
604 0.57
605 0.52
606 0.52
607 0.44
608 0.37
609 0.3
610 0.25
611 0.19
612 0.15
613 0.13
614 0.08
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.06
619 0.05
620 0.05
621 0.06
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.1
630 0.12
631 0.17
632 0.23
633 0.26
634 0.28
635 0.31
636 0.32
637 0.31
638 0.32
639 0.3
640 0.26
641 0.23
642 0.21
643 0.18
644 0.2
645 0.19
646 0.16
647 0.14
648 0.13
649 0.15
650 0.21
651 0.26
652 0.32
653 0.38
654 0.39
655 0.47
656 0.47
657 0.45
658 0.4
659 0.35
660 0.31
661 0.27
662 0.28
663 0.23
664 0.27
665 0.26
666 0.25
667 0.24
668 0.19
669 0.17
670 0.17
671 0.14
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.08
676 0.1
677 0.1
678 0.11
679 0.18
680 0.22
681 0.24
682 0.24
683 0.25
684 0.25
685 0.29
686 0.28
687 0.22
688 0.27
689 0.28
690 0.28
691 0.34
692 0.36
693 0.35
694 0.38
695 0.36
696 0.31
697 0.31
698 0.32
699 0.26
700 0.23
701 0.22
702 0.18
703 0.17
704 0.14
705 0.12
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.09
710 0.11
711 0.12
712 0.13
713 0.16
714 0.17
715 0.19
716 0.23
717 0.22
718 0.18
719 0.19
720 0.18
721 0.15
722 0.13
723 0.12
724 0.08
725 0.07
726 0.08
727 0.08
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.11
732 0.13
733 0.15
734 0.17
735 0.2
736 0.19
737 0.19
738 0.19
739 0.19
740 0.18
741 0.16
742 0.14
743 0.12
744 0.12
745 0.12
746 0.11
747 0.13
748 0.14
749 0.13
750 0.13
751 0.12
752 0.1
753 0.1
754 0.1
755 0.08
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.11
761 0.11
762 0.15
763 0.16
764 0.16
765 0.18
766 0.19
767 0.19
768 0.16
769 0.17
770 0.14
771 0.14
772 0.14
773 0.12
774 0.11
775 0.1
776 0.09
777 0.08
778 0.07
779 0.06
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.06
784 0.06
785 0.07
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.08
790 0.1
791 0.1
792 0.11
793 0.12
794 0.13
795 0.13
796 0.13
797 0.13
798 0.2
799 0.22
800 0.24
801 0.22
802 0.2
803 0.21
804 0.2
805 0.2
806 0.11
807 0.09
808 0.07
809 0.07
810 0.07
811 0.08
812 0.1
813 0.09
814 0.09
815 0.09
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.09
820 0.11
821 0.11
822 0.11
823 0.16
824 0.17
825 0.17
826 0.19
827 0.18
828 0.15
829 0.16
830 0.21
831 0.22
832 0.23
833 0.23
834 0.22
835 0.22
836 0.22
837 0.23
838 0.19
839 0.15
840 0.13
841 0.13
842 0.13
843 0.11
844 0.1
845 0.08
846 0.08
847 0.07
848 0.09
849 0.1
850 0.12
851 0.14
852 0.15
853 0.16
854 0.19
855 0.25
856 0.26
857 0.32
858 0.38
859 0.44
860 0.51
861 0.53
862 0.54
863 0.49
864 0.47
865 0.41
866 0.34
867 0.34
868 0.28
869 0.28
870 0.31
871 0.35
872 0.37
873 0.38
874 0.42
875 0.37
876 0.39
877 0.37
878 0.31
879 0.27
880 0.3
881 0.31
882 0.32
883 0.32
884 0.28
885 0.28
886 0.32
887 0.32