FuNGI

A6QTB6

Protein Details

Accession

A6QTB6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
879-901	NALNDIKKRFRDKKINWERQHGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	aje:HCAG_00622 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MSSSSDDEFENSDLDDLDINLDIPSLGLADSSDNNQGPKAPKQRRIDEYMTTSKNVRKSVSSPSGKPLNNENTSFQTVTTEQSNSFGASFGASTPATSFSRSFETGQFDLNEASTYSSTARPPPDAKFSGLWGNANTTSPSKNTKMQPEADLDWREQKIRNIIQDLEEKGPFSNKNVVKTTVPLRYRYEAQRAANFFKVPAENILQKLDRRKLPEYEDFWKSLHNGEQERLEKTAPEPWDMAVDQYKDRKLTGDVVTLSCELTWCSQKEPGYFKLNLKPLKLMRGYRFCRRFGSDRFLELTYPILTEPPAHLVRKGNAVEKDILIDAISRWMATSEHHLVGRVWKVLYLEDIQNKQKKAKKYDSGEIRAGVSAIEIPHKQKAYFFATDGIDFRKAGDPLDIPPHVETSGQRTSMSIDALIDWHMPRAKNSHQSDMKLFQRLHLGLSRTLATVILRREEIIYVKDPPGTVMNDGCALMSKSLGMAVASALGLDGHPAIFQARISGAKGVWMVDLDDSRFKTGDRGFWLQITESQLKIHPAPPHDTKPMDEPQLTFEVVQWRLLQDYLDNLKKLKITVSQSTFAYCVADPFGVLRPDEVHLGFSREWEHGSAGTELHDIDVLLARLPAHLATDIQKRKSVYKNELRHMKDVIVFPTTGDTPLASLLSGGDYDGDQCWVCWDPIIVREFKSTEFDPGTVPSAESLGLRSCSTLMSKIGSTEEFLTNAFRFNIKPSKLGQCTIERETYCYHENNITSPMAVKLAWLLSYLVDSKKAGLELTDDTWECLRPKYSKVITEKQPLVPAYKSLSRGVKPLVWNSCNIIDYLLFDVIVAESDQMLVRFDKFCSEHCELPLDHDLLSEWGKVEKRGIQEKNEMNPVLYNALNDIKKRFRDKKINWERQHGLNSEIPYARKILEAAQSLQELTPPTFDHPLSHTWANSTYEWERLRALCAYKDCRSDFVWYAVGPVLCEIKAKAMGQCRIVLPNIHKVLHVNRNVAKRVAEDVMRRNAGELSGDEGGGEDDYDDDDDDEFFDIDPFSFPEDLERDIDDTTSHNSSP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.11
3	0.09
4	0.09
5	0.09
6	0.09
7	0.08
8	0.08
9	0.07
10	0.06
11	0.06
12	0.05
13	0.05
14	0.04
15	0.05
16	0.07
17	0.09
18	0.12
19	0.17
20	0.18
21	0.19
22	0.2
23	0.25
24	0.27
25	0.36
26	0.44
27	0.49
28	0.57
29	0.65
30	0.74
31	0.75
32	0.79
33	0.74
34	0.71
35	0.69
36	0.69
37	0.63
38	0.56
39	0.54
40	0.51
41	0.52
42	0.48
43	0.43
44	0.39
45	0.4
46	0.48
47	0.54
48	0.56
49	0.52
50	0.56
51	0.62
52	0.58
53	0.58
54	0.57
55	0.56
56	0.54
57	0.54
58	0.5
59	0.47
60	0.5
61	0.48
62	0.38
63	0.33
64	0.28
65	0.28
66	0.28
67	0.24
68	0.19
69	0.21
70	0.22
71	0.18
72	0.18
73	0.15
74	0.12
75	0.1
76	0.1
77	0.09
78	0.11
79	0.1
80	0.1
81	0.11
82	0.15
83	0.15
84	0.18
85	0.18
86	0.17
87	0.23
88	0.25
89	0.27
90	0.26
91	0.32
92	0.3
93	0.33
94	0.31
95	0.27
96	0.25
97	0.23
98	0.2
99	0.13
100	0.15
101	0.12
102	0.12
103	0.13
104	0.15
105	0.17
106	0.22
107	0.25
108	0.28
109	0.32
110	0.35
111	0.41
112	0.41
113	0.42
114	0.38
115	0.38
116	0.4
117	0.38
118	0.35
119	0.27
120	0.29
121	0.27
122	0.27
123	0.26
124	0.21
125	0.21
126	0.23
127	0.28
128	0.28
129	0.34
130	0.4
131	0.47
132	0.51
133	0.53
134	0.53
135	0.52
136	0.52
137	0.51
138	0.47
139	0.4
140	0.41
141	0.39
142	0.38
143	0.36
144	0.37
145	0.4
146	0.43
147	0.46
148	0.43
149	0.43
150	0.44
151	0.47
152	0.45
153	0.4
154	0.35
155	0.29
156	0.26
157	0.29
158	0.26
159	0.24
160	0.3
161	0.29
162	0.35
163	0.38
164	0.41
165	0.37
166	0.41
167	0.44
168	0.44
169	0.43
170	0.41
171	0.43
172	0.44
173	0.49
174	0.5
175	0.53
176	0.51
177	0.52
178	0.55
179	0.55
180	0.55
181	0.52
182	0.46
183	0.38
184	0.35
185	0.32
186	0.25
187	0.24
188	0.24
189	0.24
190	0.25
191	0.29
192	0.28
193	0.3
194	0.38
195	0.41
196	0.41
197	0.44
198	0.47
199	0.48
200	0.53
201	0.57
202	0.55
203	0.54
204	0.53
205	0.49
206	0.44
207	0.41
208	0.35
209	0.29
210	0.28
211	0.28
212	0.27
213	0.27
214	0.35
215	0.35
216	0.36
217	0.35
218	0.3
219	0.25
220	0.24
221	0.28
222	0.22
223	0.21
224	0.2
225	0.19
226	0.22
227	0.21
228	0.22
229	0.2
230	0.2
231	0.21
232	0.26
233	0.28
234	0.26
235	0.26
236	0.26
237	0.23
238	0.28
239	0.27
240	0.27
241	0.26
242	0.26
243	0.28
244	0.26
245	0.24
246	0.17
247	0.15
248	0.1
249	0.11
250	0.16
251	0.15
252	0.17
253	0.22
254	0.25
255	0.29
256	0.34
257	0.36
258	0.37
259	0.4
260	0.41
261	0.45
262	0.49
263	0.48
264	0.45
265	0.46
266	0.42
267	0.47
268	0.48
269	0.47
270	0.48
271	0.54
272	0.57
273	0.61
274	0.64
275	0.58
276	0.58
277	0.57
278	0.56
279	0.52
280	0.55
281	0.47
282	0.45
283	0.46
284	0.41
285	0.36
286	0.29
287	0.25
288	0.17
289	0.15
290	0.12
291	0.09
292	0.08
293	0.09
294	0.1
295	0.13
296	0.17
297	0.17
298	0.19
299	0.23
300	0.24
301	0.3
302	0.31
303	0.32
304	0.3
305	0.32
306	0.31
307	0.28
308	0.27
309	0.2
310	0.18
311	0.12
312	0.1
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.14
322	0.16
323	0.18
324	0.18
325	0.19
326	0.19
327	0.23
328	0.25
329	0.21
330	0.16
331	0.16
332	0.16
333	0.16
334	0.17
335	0.15
336	0.17
337	0.2
338	0.24
339	0.3
340	0.34
341	0.36
342	0.41
343	0.44
344	0.48
345	0.52
346	0.58
347	0.6
348	0.62
349	0.69
350	0.71
351	0.71
352	0.65
353	0.57
354	0.47
355	0.38
356	0.32
357	0.23
358	0.13
359	0.09
360	0.07
361	0.09
362	0.1
363	0.11
364	0.16
365	0.17
366	0.17
367	0.17
368	0.22
369	0.25
370	0.25
371	0.24
372	0.24
373	0.23
374	0.24
375	0.24
376	0.21
377	0.16
378	0.15
379	0.15
380	0.15
381	0.15
382	0.14
383	0.15
384	0.14
385	0.15
386	0.2
387	0.19
388	0.16
389	0.16
390	0.17
391	0.15
392	0.15
393	0.14
394	0.15
395	0.18
396	0.18
397	0.17
398	0.17
399	0.18
400	0.18
401	0.18
402	0.12
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.09
407	0.08
408	0.07
409	0.08
410	0.11
411	0.11
412	0.12
413	0.17
414	0.21
415	0.3
416	0.33
417	0.4
418	0.41
419	0.43
420	0.45
421	0.46
422	0.44
423	0.41
424	0.38
425	0.3
426	0.32
427	0.3
428	0.28
429	0.26
430	0.25
431	0.19
432	0.21
433	0.2
434	0.15
435	0.14
436	0.13
437	0.1
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.12
444	0.12
445	0.13
446	0.12
447	0.13
448	0.14
449	0.14
450	0.15
451	0.14
452	0.14
453	0.15
454	0.14
455	0.13
456	0.11
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.07
462	0.07
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.04
467	0.04
468	0.05
469	0.04
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.06
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.07
500	0.06
501	0.09
502	0.09
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.13
507	0.14
508	0.17
509	0.19
510	0.22
511	0.22
512	0.23
513	0.23
514	0.19
515	0.2
516	0.21
517	0.18
518	0.14
519	0.15
520	0.15
521	0.16
522	0.17
523	0.18
524	0.17
525	0.17
526	0.22
527	0.26
528	0.29
529	0.31
530	0.31
531	0.27
532	0.3
533	0.31
534	0.29
535	0.25
536	0.22
537	0.21
538	0.22
539	0.21
540	0.16
541	0.14
542	0.16
543	0.16
544	0.17
545	0.14
546	0.13
547	0.13
548	0.13
549	0.11
550	0.06
551	0.1
552	0.13
553	0.15
554	0.15
555	0.15
556	0.17
557	0.17
558	0.18
559	0.16
560	0.17
561	0.19
562	0.25
563	0.28
564	0.29
565	0.28
566	0.29
567	0.27
568	0.22
569	0.19
570	0.12
571	0.09
572	0.08
573	0.07
574	0.06
575	0.07
576	0.1
577	0.09
578	0.09
579	0.09
580	0.09
581	0.11
582	0.12
583	0.11
584	0.1
585	0.09
586	0.13
587	0.12
588	0.12
589	0.13
590	0.12
591	0.13
592	0.12
593	0.12
594	0.09
595	0.11
596	0.11
597	0.09
598	0.09
599	0.09
600	0.08
601	0.08
602	0.07
603	0.05
604	0.05
605	0.06
606	0.05
607	0.05
608	0.06
609	0.05
610	0.05
611	0.06
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.09
617	0.18
618	0.22
619	0.24
620	0.27
621	0.28
622	0.33
623	0.4
624	0.44
625	0.45
626	0.51
627	0.57
628	0.62
629	0.7
630	0.67
631	0.61
632	0.55
633	0.47
634	0.41
635	0.36
636	0.3
637	0.22
638	0.19
639	0.16
640	0.17
641	0.15
642	0.11
643	0.09
644	0.08
645	0.06
646	0.07
647	0.07
648	0.05
649	0.05
650	0.04
651	0.05
652	0.05
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.05
657	0.05
658	0.06
659	0.05
660	0.05
661	0.07
662	0.08
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.13
668	0.16
669	0.15
670	0.15
671	0.17
672	0.18
673	0.18
674	0.21
675	0.18
676	0.19
677	0.19
678	0.19
679	0.17
680	0.18
681	0.19
682	0.16
683	0.15
684	0.11
685	0.1
686	0.1
687	0.09
688	0.09
689	0.08
690	0.09
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.11
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.11
700	0.12
701	0.13
702	0.13
703	0.13
704	0.14
705	0.14
706	0.12
707	0.12
708	0.14
709	0.13
710	0.14
711	0.13
712	0.12
713	0.12
714	0.17
715	0.25
716	0.23
717	0.26
718	0.29
719	0.37
720	0.39
721	0.4
722	0.39
723	0.37
724	0.41
725	0.41
726	0.43
727	0.34
728	0.34
729	0.34
730	0.33
731	0.3
732	0.26
733	0.25
734	0.23
735	0.24
736	0.23
737	0.24
738	0.2
739	0.17
740	0.17
741	0.15
742	0.12
743	0.11
744	0.1
745	0.08
746	0.08
747	0.08
748	0.08
749	0.08
750	0.07
751	0.09
752	0.11
753	0.1
754	0.11
755	0.11
756	0.11
757	0.12
758	0.12
759	0.11
760	0.09
761	0.11
762	0.12
763	0.13
764	0.16
765	0.14
766	0.15
767	0.16
768	0.18
769	0.16
770	0.16
771	0.19
772	0.19
773	0.22
774	0.3
775	0.34
776	0.39
777	0.46
778	0.53
779	0.56
780	0.62
781	0.63
782	0.56
783	0.57
784	0.5
785	0.46
786	0.38
787	0.33
788	0.29
789	0.29
790	0.29
791	0.29
792	0.34
793	0.31
794	0.34
795	0.35
796	0.35
797	0.34
798	0.39
799	0.42
800	0.37
801	0.38
802	0.37
803	0.37
804	0.32
805	0.29
806	0.23
807	0.15
808	0.15
809	0.16
810	0.13
811	0.09
812	0.09
813	0.09
814	0.08
815	0.08
816	0.07
817	0.05
818	0.04
819	0.05
820	0.06
821	0.06
822	0.07
823	0.08
824	0.1
825	0.11
826	0.11
827	0.16
828	0.17
829	0.2
830	0.26
831	0.3
832	0.31
833	0.31
834	0.35
835	0.29
836	0.33
837	0.36
838	0.28
839	0.24
840	0.21
841	0.2
842	0.18
843	0.19
844	0.15
845	0.1
846	0.14
847	0.15
848	0.16
849	0.19
850	0.21
851	0.27
852	0.36
853	0.4
854	0.42
855	0.5
856	0.55
857	0.57
858	0.59
859	0.52
860	0.43
861	0.39
862	0.35
863	0.29
864	0.24
865	0.18
866	0.14
867	0.2
868	0.22
869	0.23
870	0.27
871	0.31
872	0.38
873	0.48
874	0.55
875	0.58
876	0.67
877	0.73
878	0.79
879	0.83
880	0.88
881	0.83
882	0.84
883	0.78
884	0.74
885	0.72
886	0.63
887	0.56
888	0.49
889	0.45
890	0.41
891	0.39
892	0.33
893	0.27
894	0.27
895	0.23
896	0.2
897	0.19
898	0.18
899	0.21
900	0.24
901	0.25
902	0.26
903	0.26
904	0.26
905	0.25
906	0.23
907	0.18
908	0.16
909	0.16
910	0.14
911	0.17
912	0.2
913	0.2
914	0.21
915	0.22
916	0.25
917	0.28
918	0.3
919	0.27
920	0.25
921	0.29
922	0.3
923	0.27
924	0.3
925	0.26
926	0.31
927	0.32
928	0.31
929	0.31
930	0.28
931	0.3
932	0.29
933	0.3
934	0.29
935	0.35
936	0.41
937	0.43
938	0.49
939	0.47
940	0.46
941	0.45
942	0.45
943	0.4
944	0.37
945	0.34
946	0.27
947	0.28
948	0.28
949	0.26
950	0.2
951	0.18
952	0.16
953	0.14
954	0.15
955	0.13
956	0.14
957	0.18
958	0.19
959	0.23
960	0.3
961	0.34
962	0.35
963	0.38
964	0.36
965	0.36
966	0.36
967	0.37
968	0.33
969	0.38
970	0.41
971	0.38
972	0.36
973	0.37
974	0.44
975	0.48
976	0.49
977	0.46
978	0.48
979	0.55
980	0.58
981	0.56
982	0.49
983	0.42
984	0.41
985	0.38
986	0.37
987	0.36
988	0.4
989	0.46
990	0.46
991	0.44
992	0.41
993	0.37
994	0.33
995	0.28
996	0.21
997	0.18
998	0.17
999	0.16
1000	0.15
1001	0.14
1002	0.14
1003	0.12
1004	0.11
1005	0.06
1006	0.05
1007	0.07
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.08
1013	0.09
1014	0.1
1015	0.09
1016	0.09
1017	0.09
1018	0.09
1019	0.09
1020	0.11
1021	0.11
1022	0.13
1023	0.13
1024	0.13
1025	0.18
1026	0.19
1027	0.22
1028	0.22
1029	0.23
1030	0.21
1031	0.21
1032	0.21
1033	0.16
1034	0.16
1035	0.18

A6QTB6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer