FuNGI

A6RF85

Protein Details

Accession

A6RF85

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
60-85	QASASKSAKKSKASRPKTSQDTPRAG	Hydrophilic
281-305	GITPPLRWVRKRRFRKRISNRTIEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
65-92	KSAKKSKASRPKTSQDTPRAGTSKKRGR
111-143	KASKQPAVKRIKLSTRPPPSIRLRSKGEPPVRP
289-297	VRKRRFRKR

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037817 TAF7 IPR006751 TAFII55_prot_cons_reg
Gene Ontology	GO:0005669 C:transcription factor TFIID complex GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	aje:HCAG_08301 -
Pfam	View protein in Pfam PF04658 TAFII55_N
CDD	cd08047 TAF7

Amino Acid Sequences

MSSRPVLKLTFSKPKVDQVANSSSSSPPPSNPTTPGGSSLPKLKFKIGPKPIAEESVAAQASASKSAKKSKASRPKTSQDTPRAGTSKKRGREASSNDADIGTTAKGSATKASKQPAVKRIKLSTRPPPSIRLRSKGEPPVRPKGVGYDSEASDTERDPALEEQFILRMLPGEDCDYLRQAVMEKRFGPRSQGGADISFKSLTRDGRRAVLNIRGHIYAASLVDLPCIIEGMKSWDKRGWYKSADICQMLLVLGRVNSDDEARTYPLPRDVDESTFQYAHGITPPLRWVRKRRFRKRISNRTIEAVELEVARLLKEDMAAESPPEFEIMDYTQYMRETSAMSDDGARYGLTGQEYDDEQDAEGEVDEYGMDGYTQPSAQEEAADYFEDELAAEMEAALAAHADGGSTPGPASTSATARDTQNNMSTPTQATVPITKMGPESHTEGEVDVYVDASTPNSKPQTPAETSGDEDEDDESEDGSSGDEANEADLDEDALEQQRQLEQQREEIAELEVLVQTETLKWESMANPILKSKLGKRVQSLKQALELKKVSFGEGDEDG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.62
3	0.58
4	0.55
5	0.51
6	0.56
7	0.51
8	0.5
9	0.44
10	0.37
11	0.37
12	0.38
13	0.32
14	0.27
15	0.31
16	0.36
17	0.38
18	0.4
19	0.41
20	0.41
21	0.4
22	0.41
23	0.38
24	0.34
25	0.33
26	0.38
27	0.4
28	0.42
29	0.43
30	0.44
31	0.48
32	0.52
33	0.6
34	0.61
35	0.63
36	0.59
37	0.64
38	0.6
39	0.57
40	0.5
41	0.4
42	0.33
43	0.31
44	0.28
45	0.21
46	0.18
47	0.18
48	0.18
49	0.23
50	0.22
51	0.19
52	0.24
53	0.33
54	0.4
55	0.46
56	0.54
57	0.59
58	0.69
59	0.74
60	0.81
61	0.8
62	0.84
63	0.84
64	0.84
65	0.83
66	0.81
67	0.79
68	0.71
69	0.7
70	0.65
71	0.59
72	0.59
73	0.59
74	0.59
75	0.58
76	0.63
77	0.6
78	0.62
79	0.7
80	0.69
81	0.69
82	0.64
83	0.59
84	0.51
85	0.47
86	0.4
87	0.3
88	0.23
89	0.13
90	0.08
91	0.07
92	0.07
93	0.08
94	0.09
95	0.15
96	0.18
97	0.23
98	0.28
99	0.33
100	0.38
101	0.44
102	0.51
103	0.55
104	0.6
105	0.6
106	0.62
107	0.64
108	0.68
109	0.71
110	0.7
111	0.71
112	0.71
113	0.73
114	0.69
115	0.7
116	0.69
117	0.71
118	0.7
119	0.67
120	0.64
121	0.61
122	0.67
123	0.68
124	0.67
125	0.65
126	0.65
127	0.68
128	0.64
129	0.6
130	0.53
131	0.49
132	0.45
133	0.39
134	0.37
135	0.31
136	0.28
137	0.29
138	0.29
139	0.24
140	0.21
141	0.19
142	0.15
143	0.12
144	0.11
145	0.11
146	0.13
147	0.14
148	0.13
149	0.13
150	0.12
151	0.12
152	0.12
153	0.1
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.08
159	0.1
160	0.1
161	0.11
162	0.13
163	0.13
164	0.12
165	0.12
166	0.11
167	0.12
168	0.16
169	0.19
170	0.22
171	0.22
172	0.27
173	0.31
174	0.31
175	0.33
176	0.31
177	0.31
178	0.29
179	0.3
180	0.26
181	0.25
182	0.26
183	0.22
184	0.2
185	0.17
186	0.16
187	0.15
188	0.17
189	0.21
190	0.24
191	0.27
192	0.27
193	0.31
194	0.33
195	0.32
196	0.32
197	0.34
198	0.32
199	0.29
200	0.3
201	0.25
202	0.24
203	0.22
204	0.19
205	0.12
206	0.09
207	0.09
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.03
217	0.04
218	0.11
219	0.17
220	0.17
221	0.19
222	0.21
223	0.24
224	0.29
225	0.33
226	0.31
227	0.28
228	0.33
229	0.36
230	0.39
231	0.4
232	0.35
233	0.31
234	0.25
235	0.23
236	0.17
237	0.13
238	0.08
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.08
249	0.1
250	0.1
251	0.11
252	0.12
253	0.16
254	0.17
255	0.16
256	0.18
257	0.18
258	0.2
259	0.2
260	0.21
261	0.18
262	0.18
263	0.17
264	0.14
265	0.13
266	0.1
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.09
271	0.12
272	0.17
273	0.2
274	0.24
275	0.32
276	0.42
277	0.52
278	0.63
279	0.7
280	0.76
281	0.83
282	0.9
283	0.92
284	0.92
285	0.9
286	0.87
287	0.78
288	0.71
289	0.62
290	0.5
291	0.39
292	0.28
293	0.2
294	0.12
295	0.1
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.05
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.07
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.09
323	0.09
324	0.08
325	0.08
326	0.1
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.09
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.08
375	0.07
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.02
386	0.02
387	0.02
388	0.02
389	0.02
390	0.03
391	0.04
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.07
398	0.09
399	0.09
400	0.11
401	0.13
402	0.15
403	0.17
404	0.19
405	0.24
406	0.24
407	0.26
408	0.29
409	0.29
410	0.3
411	0.29
412	0.29
413	0.25
414	0.23
415	0.21
416	0.17
417	0.17
418	0.16
419	0.17
420	0.18
421	0.17
422	0.17
423	0.18
424	0.18
425	0.18
426	0.18
427	0.2
428	0.19
429	0.2
430	0.19
431	0.18
432	0.17
433	0.15
434	0.13
435	0.08
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.09
442	0.09
443	0.16
444	0.18
445	0.2
446	0.22
447	0.28
448	0.34
449	0.35
450	0.4
451	0.39
452	0.37
453	0.38
454	0.38
455	0.33
456	0.25
457	0.22
458	0.17
459	0.13
460	0.13
461	0.11
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.07
474	0.06
475	0.07
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.08
482	0.09
483	0.08
484	0.1
485	0.12
486	0.16
487	0.21
488	0.28
489	0.27
490	0.32
491	0.37
492	0.37
493	0.35
494	0.32
495	0.29
496	0.21
497	0.19
498	0.16
499	0.11
500	0.1
501	0.09
502	0.08
503	0.07
504	0.08
505	0.1
506	0.11
507	0.11
508	0.11
509	0.14
510	0.15
511	0.21
512	0.27
513	0.26
514	0.28
515	0.3
516	0.31
517	0.31
518	0.35
519	0.36
520	0.39
521	0.45
522	0.48
523	0.54
524	0.62
525	0.68
526	0.74
527	0.73
528	0.65
529	0.66
530	0.69
531	0.63
532	0.62
533	0.57
534	0.48
535	0.48
536	0.46
537	0.39
538	0.32
539	0.3

A6RF85

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer