Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6QSM9

Protein Details
Accession A6QSM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-335TALNNERRRRKREAAQRREEAKBasic
377-407LAEASKRPTRRSTKHRRSSIQPSKSGNKCRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
320-394RRRRKREAAQRREEAKAAAAAKRCIEKQRRDEQKLQLQKEKEERAAKRHEAQLAKKALAEASKRPTRRSTKHRRS
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, cyto 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG aje:HCAG_00385  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
Amino Acid Sequences MQLQEKIKQYNVLPQNTYNFDEKGFLLGLLRTLKRIVSIEALKRKHTIGAVQDGSREFIFLLAGICADGTTIPPALIYRGESRDMQDTWLEDFDPKKDQAYFAASENGWSNDEYGLTWLKQVFDPHTKQKARNHYRLLILDGHSSHINMAFIDYADQNRILLAILPPHSTHRLQPLDVGIFGPLAKAYSDQLDSYTRSGYGFIRTTKRDFWRLFRAAWEISTTAENIKSAFMATGIHPIDPARVLKKIQPRPLTPPELLQQRTPTSIRALRGLIKQASQRHRRLSVDIKKILRAGENIALDREVLLIENKNLQTALNNERRRRKREAAQRREEAKAAAAAKRCIEKQRRDEQKLQLQKEKEERAAKRHEAQLAKKALAEASKRPTRRSTKHRRSSIQPSKSGNKCRTQAPPVESNDIPSLKPSTPRSDSTVSKPRVSRSGRIIRPSNRSLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.52
3 0.5
4 0.52
5 0.46
6 0.38
7 0.32
8 0.31
9 0.27
10 0.24
11 0.2
12 0.17
13 0.15
14 0.14
15 0.17
16 0.22
17 0.22
18 0.2
19 0.21
20 0.21
21 0.23
22 0.24
23 0.23
24 0.24
25 0.31
26 0.38
27 0.46
28 0.49
29 0.48
30 0.49
31 0.47
32 0.44
33 0.38
34 0.35
35 0.32
36 0.39
37 0.4
38 0.38
39 0.4
40 0.37
41 0.37
42 0.31
43 0.25
44 0.16
45 0.12
46 0.11
47 0.08
48 0.08
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.12
65 0.16
66 0.18
67 0.21
68 0.22
69 0.24
70 0.28
71 0.27
72 0.26
73 0.23
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.19
78 0.16
79 0.17
80 0.17
81 0.2
82 0.2
83 0.2
84 0.2
85 0.21
86 0.22
87 0.25
88 0.24
89 0.21
90 0.25
91 0.22
92 0.22
93 0.23
94 0.22
95 0.18
96 0.16
97 0.15
98 0.11
99 0.12
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.15
108 0.17
109 0.21
110 0.27
111 0.32
112 0.39
113 0.48
114 0.52
115 0.56
116 0.62
117 0.68
118 0.69
119 0.73
120 0.71
121 0.65
122 0.66
123 0.61
124 0.56
125 0.49
126 0.41
127 0.34
128 0.28
129 0.25
130 0.2
131 0.18
132 0.15
133 0.12
134 0.11
135 0.08
136 0.08
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.1
152 0.12
153 0.12
154 0.15
155 0.18
156 0.18
157 0.19
158 0.24
159 0.25
160 0.25
161 0.26
162 0.26
163 0.23
164 0.22
165 0.21
166 0.12
167 0.1
168 0.1
169 0.08
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.1
179 0.11
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.13
188 0.14
189 0.17
190 0.22
191 0.24
192 0.27
193 0.32
194 0.35
195 0.39
196 0.38
197 0.4
198 0.45
199 0.45
200 0.43
201 0.38
202 0.38
203 0.3
204 0.28
205 0.24
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.13
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.17
233 0.27
234 0.34
235 0.4
236 0.45
237 0.46
238 0.52
239 0.58
240 0.58
241 0.48
242 0.44
243 0.41
244 0.42
245 0.41
246 0.34
247 0.31
248 0.28
249 0.3
250 0.28
251 0.24
252 0.23
253 0.25
254 0.24
255 0.23
256 0.23
257 0.24
258 0.26
259 0.3
260 0.25
261 0.25
262 0.29
263 0.34
264 0.42
265 0.46
266 0.49
267 0.5
268 0.54
269 0.53
270 0.53
271 0.56
272 0.56
273 0.57
274 0.58
275 0.54
276 0.51
277 0.5
278 0.46
279 0.38
280 0.29
281 0.24
282 0.22
283 0.22
284 0.21
285 0.19
286 0.18
287 0.16
288 0.15
289 0.12
290 0.06
291 0.05
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.17
302 0.25
303 0.3
304 0.37
305 0.43
306 0.54
307 0.62
308 0.67
309 0.71
310 0.71
311 0.71
312 0.75
313 0.8
314 0.8
315 0.82
316 0.84
317 0.8
318 0.74
319 0.65
320 0.55
321 0.45
322 0.39
323 0.32
324 0.27
325 0.26
326 0.25
327 0.27
328 0.3
329 0.31
330 0.36
331 0.42
332 0.48
333 0.54
334 0.62
335 0.71
336 0.74
337 0.79
338 0.79
339 0.8
340 0.8
341 0.77
342 0.74
343 0.66
344 0.66
345 0.67
346 0.63
347 0.6
348 0.6
349 0.58
350 0.58
351 0.64
352 0.63
353 0.6
354 0.61
355 0.6
356 0.59
357 0.59
358 0.6
359 0.56
360 0.51
361 0.46
362 0.41
363 0.36
364 0.34
365 0.33
366 0.31
367 0.35
368 0.43
369 0.44
370 0.48
371 0.56
372 0.6
373 0.66
374 0.71
375 0.73
376 0.76
377 0.84
378 0.9
379 0.87
380 0.86
381 0.87
382 0.87
383 0.84
384 0.81
385 0.77
386 0.77
387 0.79
388 0.8
389 0.76
390 0.74
391 0.69
392 0.68
393 0.69
394 0.67
395 0.66
396 0.63
397 0.63
398 0.6
399 0.62
400 0.55
401 0.51
402 0.49
403 0.42
404 0.36
405 0.31
406 0.31
407 0.27
408 0.34
409 0.35
410 0.38
411 0.42
412 0.45
413 0.49
414 0.51
415 0.53
416 0.55
417 0.61
418 0.56
419 0.59
420 0.59
421 0.58
422 0.61
423 0.62
424 0.6
425 0.6
426 0.66
427 0.66
428 0.71
429 0.75
430 0.73
431 0.76