Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CSN4

Protein Details
Accession I1CSN4    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-134FKPMKKFKSSTQKKASNKAIKSHydrophilic
480-506VTYYTYHSSNQKHRHRHPKIPNAWEAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
252-253KR
258-267PSKVSAKKLK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 13.332, cyto_nucl 12.666, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017884  SANT_dom  
IPR029617  Snt2  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13832  zf-HC5HC2H_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS51293  SANT  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MNQVKKLNNVSLASHSSDLMDRALQELEQSQYHTDIAFEKMARLDQDDFNYITDWSKQEIYAFEQSIREHGHDLNYAKKSVGSKSMADIVRYFYQWKKSDRYEPVYSEWTKIFKPMKKFKSSTQKKASNKAIKSNIENNQESDPTIVPRATYTHNSYQCMNCLTKKSTIWRRSPSDTDRKRKVFKEVLCNDCGIYWLKYAKAKPIPEPIKRANSQGNASTIYHTQHGRVTTICNTANVTTDSDTLDSLQKRKRNDGIPSKVSAKKLKEEKSKVQLKFEPEECKVCLQIGPEDKLYTCYDCGMSVHNEESRQPLKMTSGHQWAHVQCAAFIPEIKFVHPKTLSTIEYIGCVNSERLDAICQICKNTNGACVACTECKRPVHVQCAIDQKFKLAFEIQSPTVSEGGKAKVSVISPGLFYPSSPSGLMIPQVWCPTHNVVNLKLIELNMRTLATQESCIMTYAKSHKTITKGTTPAMRRFRQVTYYTYHSSNQKHRHRHPKIPNAWEAALEALNMAEVPTLDQYTSIALPSKKAILLTNLPKQVCATKGCSVQHTPIWWSVEGNPDKKICQKCHDLKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.3
3 0.25
4 0.25
5 0.23
6 0.19
7 0.16
8 0.13
9 0.14
10 0.15
11 0.13
12 0.13
13 0.15
14 0.16
15 0.16
16 0.18
17 0.17
18 0.18
19 0.18
20 0.17
21 0.15
22 0.15
23 0.17
24 0.19
25 0.18
26 0.18
27 0.19
28 0.22
29 0.22
30 0.24
31 0.24
32 0.24
33 0.28
34 0.29
35 0.28
36 0.27
37 0.27
38 0.23
39 0.21
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.18
45 0.19
46 0.21
47 0.25
48 0.28
49 0.28
50 0.26
51 0.28
52 0.28
53 0.3
54 0.3
55 0.26
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.27
60 0.29
61 0.33
62 0.33
63 0.32
64 0.3
65 0.32
66 0.31
67 0.29
68 0.35
69 0.3
70 0.28
71 0.3
72 0.38
73 0.36
74 0.35
75 0.32
76 0.29
77 0.28
78 0.28
79 0.29
80 0.26
81 0.34
82 0.38
83 0.43
84 0.45
85 0.5
86 0.58
87 0.63
88 0.66
89 0.63
90 0.61
91 0.6
92 0.6
93 0.55
94 0.48
95 0.42
96 0.37
97 0.31
98 0.35
99 0.39
100 0.37
101 0.46
102 0.53
103 0.6
104 0.66
105 0.69
106 0.71
107 0.74
108 0.78
109 0.79
110 0.79
111 0.79
112 0.76
113 0.83
114 0.84
115 0.82
116 0.76
117 0.75
118 0.73
119 0.68
120 0.68
121 0.67
122 0.64
123 0.62
124 0.59
125 0.52
126 0.46
127 0.42
128 0.36
129 0.29
130 0.23
131 0.17
132 0.18
133 0.15
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.17
138 0.21
139 0.25
140 0.32
141 0.36
142 0.38
143 0.4
144 0.39
145 0.38
146 0.37
147 0.33
148 0.28
149 0.29
150 0.31
151 0.32
152 0.34
153 0.41
154 0.47
155 0.53
156 0.58
157 0.61
158 0.64
159 0.65
160 0.69
161 0.68
162 0.69
163 0.7
164 0.72
165 0.73
166 0.75
167 0.75
168 0.71
169 0.71
170 0.69
171 0.65
172 0.66
173 0.65
174 0.62
175 0.57
176 0.54
177 0.45
178 0.36
179 0.32
180 0.23
181 0.16
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.2
186 0.21
187 0.27
188 0.31
189 0.33
190 0.35
191 0.44
192 0.5
193 0.5
194 0.57
195 0.55
196 0.56
197 0.55
198 0.55
199 0.5
200 0.46
201 0.44
202 0.39
203 0.34
204 0.29
205 0.28
206 0.26
207 0.21
208 0.19
209 0.19
210 0.17
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.15
216 0.17
217 0.17
218 0.21
219 0.2
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.19
224 0.17
225 0.15
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.13
233 0.14
234 0.18
235 0.23
236 0.26
237 0.28
238 0.33
239 0.38
240 0.4
241 0.47
242 0.52
243 0.55
244 0.55
245 0.55
246 0.56
247 0.53
248 0.51
249 0.48
250 0.4
251 0.4
252 0.45
253 0.5
254 0.54
255 0.56
256 0.6
257 0.63
258 0.7
259 0.64
260 0.61
261 0.57
262 0.52
263 0.5
264 0.46
265 0.42
266 0.35
267 0.36
268 0.31
269 0.28
270 0.24
271 0.2
272 0.17
273 0.12
274 0.15
275 0.16
276 0.17
277 0.16
278 0.17
279 0.16
280 0.18
281 0.18
282 0.14
283 0.12
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.17
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.16
301 0.18
302 0.21
303 0.21
304 0.27
305 0.26
306 0.28
307 0.31
308 0.29
309 0.29
310 0.28
311 0.22
312 0.15
313 0.16
314 0.15
315 0.12
316 0.13
317 0.1
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.18
322 0.17
323 0.23
324 0.23
325 0.22
326 0.22
327 0.26
328 0.25
329 0.23
330 0.25
331 0.18
332 0.18
333 0.18
334 0.13
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.13
346 0.13
347 0.15
348 0.16
349 0.17
350 0.18
351 0.17
352 0.18
353 0.17
354 0.17
355 0.16
356 0.16
357 0.17
358 0.19
359 0.2
360 0.2
361 0.23
362 0.24
363 0.28
364 0.33
365 0.37
366 0.39
367 0.44
368 0.42
369 0.42
370 0.51
371 0.5
372 0.46
373 0.4
374 0.36
375 0.32
376 0.31
377 0.27
378 0.19
379 0.17
380 0.17
381 0.22
382 0.2
383 0.19
384 0.19
385 0.19
386 0.18
387 0.17
388 0.15
389 0.13
390 0.15
391 0.15
392 0.14
393 0.13
394 0.14
395 0.14
396 0.15
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.13
401 0.15
402 0.12
403 0.12
404 0.14
405 0.14
406 0.15
407 0.14
408 0.15
409 0.13
410 0.14
411 0.16
412 0.13
413 0.13
414 0.14
415 0.16
416 0.16
417 0.16
418 0.19
419 0.21
420 0.24
421 0.27
422 0.27
423 0.27
424 0.33
425 0.32
426 0.3
427 0.27
428 0.23
429 0.22
430 0.2
431 0.19
432 0.14
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.15
437 0.12
438 0.13
439 0.13
440 0.13
441 0.13
442 0.14
443 0.14
444 0.12
445 0.17
446 0.22
447 0.25
448 0.28
449 0.3
450 0.33
451 0.37
452 0.43
453 0.43
454 0.44
455 0.42
456 0.42
457 0.47
458 0.49
459 0.53
460 0.56
461 0.53
462 0.5
463 0.51
464 0.52
465 0.52
466 0.49
467 0.44
468 0.4
469 0.44
470 0.43
471 0.42
472 0.42
473 0.42
474 0.46
475 0.53
476 0.57
477 0.6
478 0.67
479 0.75
480 0.82
481 0.84
482 0.87
483 0.88
484 0.89
485 0.88
486 0.86
487 0.83
488 0.77
489 0.69
490 0.59
491 0.48
492 0.39
493 0.3
494 0.21
495 0.15
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.06
500 0.04
501 0.04
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.15
512 0.15
513 0.17
514 0.2
515 0.22
516 0.21
517 0.22
518 0.23
519 0.24
520 0.32
521 0.39
522 0.45
523 0.48
524 0.47
525 0.46
526 0.46
527 0.45
528 0.4
529 0.37
530 0.34
531 0.34
532 0.41
533 0.43
534 0.47
535 0.46
536 0.47
537 0.47
538 0.44
539 0.42
540 0.4
541 0.41
542 0.36
543 0.34
544 0.32
545 0.38
546 0.41
547 0.4
548 0.4
549 0.38
550 0.41
551 0.47
552 0.53
553 0.5
554 0.51
555 0.6