FuNGI

I1C8L3

Protein Details

Accession

I1C8L3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
559-578	NENNGGRRRRYNRMRDRLQG	Hydrophilic
737-756	QKDCVKFHYKKTPKWVGLNG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 6, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028802 SMG8 IPR019354 SMG8/SMG9
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF10220 Smg8_Smg9

Amino Acid Sequences

MYTHLAQFQSCCWKYWDIPVPNALFEKKEFDRVNPNFLGWWGPAKGVPMLVFVAANIPFPEITSTAIKRMQESLQIRLKSIFRALHLAPLKQEPGNSSHAPVDVKSLFLLPSTSQPIIHIVPSVPQEFDAEQEYVFDQPISISSYLQQSANNEPNSSHHEYGDNLLRNFVTIWAKTATSRHPLHKKMNDTKHAPLPTPIQFASAAIPLLYFLFNQPMRENGTDFREIIIAEYSSTKGMIQQIEVILRKKIKDNIEIERVFSKNYCYGVMQNCNEAYLQDSPSFYPKKYHIWKRDNVLRQYKSLARGSCKEEYAARLERECDLVWKQDRQSCEHLSLTDRFCRLKIGHEAIPPQSQKRDDRTILIETGKHSSGFTFFHACNCGRSQKLRDDPFAISDANIRFYEKFSCCSGKDRAFVNIRASTFGNNQKLELSYDDAPEDDSALLFLGPSTVYKNNVGLDKTEGFLNNTNYLIPWSITTVNDIKLHQQEQLAKEVKDSARSSVQEEWPMLGKIPAPVVAKPVKVISAVSLEAFPALGTNPPPTATPTIAPPPTKQLFEANENNGGRRRRYNRMRDRLQGLVRGYVGAEYECAQGHRFLSCGEGRVCKLGHASHPKEHGNYFVHQDLQIFILCPCCYVPNSNTGSGAVNSPNEMTAQLMRFYVVTPDEDITITMEPKIKINVPGNEEPIIVDLGINDPLSLGPGGSYVLRLPFIYRDNNGSPIPIETDLEKRMASAVLQKDCVKFHYKKTPKWVGLNG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.45
3	0.51
4	0.45
5	0.49
6	0.53
7	0.51
8	0.49
9	0.5
10	0.42
11	0.34
12	0.3
13	0.33
14	0.29
15	0.37
16	0.36
17	0.36
18	0.46
19	0.47
20	0.53
21	0.47
22	0.45
23	0.37
24	0.35
25	0.34
26	0.24
27	0.26
28	0.19
29	0.19
30	0.19
31	0.21
32	0.21
33	0.2
34	0.19
35	0.15
36	0.15
37	0.15
38	0.13
39	0.11
40	0.14
41	0.12
42	0.13
43	0.11
44	0.12
45	0.11
46	0.12
47	0.14
48	0.11
49	0.14
50	0.19
51	0.2
52	0.24
53	0.28
54	0.29
55	0.28
56	0.32
57	0.31
58	0.34
59	0.35
60	0.39
61	0.43
62	0.43
63	0.43
64	0.43
65	0.43
66	0.36
67	0.4
68	0.34
69	0.28
70	0.33
71	0.32
72	0.36
73	0.38
74	0.37
75	0.33
76	0.35
77	0.36
78	0.31
79	0.32
80	0.25
81	0.26
82	0.31
83	0.29
84	0.28
85	0.26
86	0.28
87	0.28
88	0.25
89	0.28
90	0.21
91	0.21
92	0.19
93	0.18
94	0.15
95	0.15
96	0.16
97	0.11
98	0.15
99	0.2
100	0.2
101	0.19
102	0.19
103	0.23
104	0.23
105	0.22
106	0.19
107	0.14
108	0.17
109	0.2
110	0.21
111	0.17
112	0.16
113	0.18
114	0.16
115	0.18
116	0.17
117	0.14
118	0.13
119	0.13
120	0.14
121	0.12
122	0.12
123	0.1
124	0.07
125	0.07
126	0.08
127	0.11
128	0.11
129	0.1
130	0.12
131	0.16
132	0.17
133	0.18
134	0.18
135	0.18
136	0.25
137	0.32
138	0.31
139	0.28
140	0.27
141	0.3
142	0.36
143	0.39
144	0.33
145	0.26
146	0.27
147	0.27
148	0.31
149	0.36
150	0.33
151	0.27
152	0.27
153	0.25
154	0.24
155	0.24
156	0.24
157	0.2
158	0.15
159	0.18
160	0.18
161	0.19
162	0.2
163	0.23
164	0.23
165	0.27
166	0.32
167	0.38
168	0.46
169	0.52
170	0.61
171	0.65
172	0.7
173	0.72
174	0.78
175	0.76
176	0.72
177	0.71
178	0.68
179	0.64
180	0.55
181	0.47
182	0.44
183	0.39
184	0.38
185	0.33
186	0.27
187	0.24
188	0.24
189	0.22
190	0.17
191	0.13
192	0.09
193	0.09
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.06
198	0.06
199	0.12
200	0.13
201	0.15
202	0.15
203	0.17
204	0.21
205	0.22
206	0.24
207	0.2
208	0.24
209	0.24
210	0.24
211	0.22
212	0.18
213	0.17
214	0.16
215	0.14
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.08
223	0.09
224	0.12
225	0.13
226	0.12
227	0.13
228	0.14
229	0.18
230	0.2
231	0.2
232	0.2
233	0.21
234	0.22
235	0.25
236	0.3
237	0.31
238	0.36
239	0.39
240	0.42
241	0.49
242	0.48
243	0.45
244	0.43
245	0.38
246	0.32
247	0.27
248	0.24
249	0.18
250	0.19
251	0.18
252	0.15
253	0.19
254	0.24
255	0.3
256	0.28
257	0.28
258	0.26
259	0.26
260	0.25
261	0.2
262	0.17
263	0.13
264	0.14
265	0.12
266	0.13
267	0.13
268	0.2
269	0.22
270	0.19
271	0.21
272	0.22
273	0.31
274	0.4
275	0.49
276	0.53
277	0.59
278	0.64
279	0.68
280	0.74
281	0.73
282	0.71
283	0.71
284	0.63
285	0.56
286	0.56
287	0.51
288	0.47
289	0.43
290	0.38
291	0.33
292	0.35
293	0.39
294	0.37
295	0.34
296	0.3
297	0.27
298	0.26
299	0.28
300	0.28
301	0.24
302	0.22
303	0.22
304	0.22
305	0.22
306	0.2
307	0.17
308	0.14
309	0.19
310	0.21
311	0.23
312	0.26
313	0.27
314	0.28
315	0.3
316	0.34
317	0.31
318	0.31
319	0.28
320	0.26
321	0.26
322	0.29
323	0.27
324	0.25
325	0.24
326	0.22
327	0.21
328	0.24
329	0.21
330	0.22
331	0.25
332	0.26
333	0.28
334	0.3
335	0.32
336	0.3
337	0.35
338	0.31
339	0.26
340	0.25
341	0.26
342	0.28
343	0.31
344	0.36
345	0.32
346	0.33
347	0.35
348	0.33
349	0.31
350	0.28
351	0.24
352	0.18
353	0.2
354	0.18
355	0.14
356	0.12
357	0.11
358	0.11
359	0.11
360	0.11
361	0.12
362	0.12
363	0.13
364	0.16
365	0.16
366	0.16
367	0.17
368	0.19
369	0.18
370	0.21
371	0.24
372	0.29
373	0.37
374	0.38
375	0.38
376	0.38
377	0.37
378	0.35
379	0.32
380	0.24
381	0.16
382	0.17
383	0.15
384	0.14
385	0.14
386	0.14
387	0.12
388	0.13
389	0.19
390	0.16
391	0.18
392	0.18
393	0.22
394	0.21
395	0.26
396	0.31
397	0.29
398	0.31
399	0.3
400	0.33
401	0.34
402	0.35
403	0.35
404	0.32
405	0.29
406	0.27
407	0.27
408	0.22
409	0.23
410	0.28
411	0.28
412	0.25
413	0.25
414	0.24
415	0.24
416	0.23
417	0.2
418	0.17
419	0.13
420	0.13
421	0.13
422	0.12
423	0.12
424	0.11
425	0.1
426	0.07
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.04
436	0.07
437	0.08
438	0.1
439	0.11
440	0.13
441	0.14
442	0.17
443	0.17
444	0.15
445	0.17
446	0.16
447	0.16
448	0.16
449	0.14
450	0.14
451	0.17
452	0.18
453	0.16
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.14
458	0.13
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.1
463	0.1
464	0.13
465	0.14
466	0.16
467	0.17
468	0.17
469	0.19
470	0.22
471	0.23
472	0.22
473	0.23
474	0.26
475	0.25
476	0.33
477	0.33
478	0.29
479	0.28
480	0.32
481	0.3
482	0.31
483	0.3
484	0.25
485	0.27
486	0.28
487	0.3
488	0.3
489	0.32
490	0.28
491	0.28
492	0.26
493	0.22
494	0.22
495	0.19
496	0.14
497	0.12
498	0.1
499	0.11
500	0.14
501	0.14
502	0.14
503	0.18
504	0.21
505	0.2
506	0.2
507	0.2
508	0.16
509	0.15
510	0.15
511	0.12
512	0.11
513	0.11
514	0.11
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.07
520	0.04
521	0.05
522	0.06
523	0.07
524	0.08
525	0.09
526	0.1
527	0.1
528	0.13
529	0.16
530	0.16
531	0.16
532	0.18
533	0.24
534	0.28
535	0.29
536	0.27
537	0.32
538	0.33
539	0.33
540	0.31
541	0.3
542	0.3
543	0.36
544	0.4
545	0.35
546	0.4
547	0.4
548	0.41
549	0.41
550	0.4
551	0.37
552	0.4
553	0.44
554	0.47
555	0.57
556	0.66
557	0.71
558	0.78
559	0.82
560	0.8
561	0.78
562	0.75
563	0.68
564	0.63
565	0.53
566	0.45
567	0.38
568	0.31
569	0.26
570	0.18
571	0.15
572	0.1
573	0.09
574	0.08
575	0.09
576	0.09
577	0.1
578	0.11
579	0.12
580	0.12
581	0.12
582	0.11
583	0.1
584	0.15
585	0.15
586	0.18
587	0.19
588	0.22
589	0.23
590	0.26
591	0.26
592	0.22
593	0.24
594	0.23
595	0.29
596	0.36
597	0.4
598	0.42
599	0.48
600	0.5
601	0.5
602	0.48
603	0.45
604	0.38
605	0.36
606	0.35
607	0.31
608	0.29
609	0.27
610	0.27
611	0.21
612	0.19
613	0.17
614	0.13
615	0.11
616	0.14
617	0.13
618	0.13
619	0.13
620	0.14
621	0.15
622	0.19
623	0.21
624	0.25
625	0.3
626	0.3
627	0.3
628	0.29
629	0.3
630	0.25
631	0.26
632	0.2
633	0.16
634	0.16
635	0.15
636	0.15
637	0.13
638	0.12
639	0.12
640	0.13
641	0.14
642	0.15
643	0.14
644	0.14
645	0.14
646	0.15
647	0.16
648	0.13
649	0.13
650	0.14
651	0.15
652	0.15
653	0.15
654	0.15
655	0.14
656	0.14
657	0.13
658	0.14
659	0.18
660	0.17
661	0.19
662	0.23
663	0.24
664	0.29
665	0.36
666	0.4
667	0.43
668	0.47
669	0.48
670	0.46
671	0.43
672	0.35
673	0.29
674	0.24
675	0.16
676	0.11
677	0.08
678	0.09
679	0.1
680	0.1
681	0.08
682	0.08
683	0.08
684	0.09
685	0.09
686	0.07
687	0.06
688	0.06
689	0.08
690	0.07
691	0.09
692	0.08
693	0.1
694	0.11
695	0.12
696	0.13
697	0.17
698	0.22
699	0.26
700	0.27
701	0.32
702	0.34
703	0.39
704	0.37
705	0.34
706	0.3
707	0.27
708	0.28
709	0.22
710	0.2
711	0.18
712	0.23
713	0.24
714	0.24
715	0.22
716	0.19
717	0.19
718	0.19
719	0.18
720	0.21
721	0.27
722	0.29
723	0.33
724	0.37
725	0.39
726	0.4
727	0.43
728	0.43
729	0.41
730	0.46
731	0.53
732	0.58
733	0.64
734	0.73
735	0.79
736	0.78

I1C8L3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer