Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CDM3

Protein Details
Accession I1CDM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-60NYANKWMPNRIRKKGGKQRLVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-55RKKGGK
113-117KKKPL
121-126QHKKAR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, nucl 10.5, cyto 10, cyto_pero 6.833, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MPKSLPYETQMDIKSALEHDVSTDVIAKRFGVHQNTVINYANKWMPNRIRKKGGKQRLVSDITRRLIKREVLNGSLRTAKEVHLKLEELGYSMSYQSAINVLHSVEIFAEIKKKKPLLTAQHKKARLAWAKKHQYWTIHDWRRVIFSDETKINIWGSDGCKYYWKRKGDRLQPHHIEVTVKHGGGGIMLWGCITSEGPGYACQIYDGTMNSEVQWVEKWFQCF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.21
4 0.15
5 0.13
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.11
10 0.16
11 0.15
12 0.16
13 0.17
14 0.15
15 0.15
16 0.2
17 0.26
18 0.26
19 0.27
20 0.31
21 0.35
22 0.36
23 0.39
24 0.37
25 0.32
26 0.27
27 0.28
28 0.27
29 0.25
30 0.26
31 0.3
32 0.36
33 0.45
34 0.54
35 0.59
36 0.65
37 0.7
38 0.79
39 0.82
40 0.83
41 0.82
42 0.77
43 0.75
44 0.73
45 0.71
46 0.62
47 0.59
48 0.55
49 0.49
50 0.51
51 0.45
52 0.4
53 0.39
54 0.41
55 0.38
56 0.38
57 0.39
58 0.36
59 0.4
60 0.38
61 0.36
62 0.35
63 0.31
64 0.26
65 0.23
66 0.21
67 0.24
68 0.25
69 0.25
70 0.22
71 0.23
72 0.21
73 0.21
74 0.19
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.12
97 0.12
98 0.15
99 0.19
100 0.2
101 0.2
102 0.24
103 0.31
104 0.36
105 0.46
106 0.54
107 0.59
108 0.66
109 0.66
110 0.63
111 0.58
112 0.57
113 0.55
114 0.52
115 0.52
116 0.55
117 0.62
118 0.65
119 0.66
120 0.61
121 0.56
122 0.53
123 0.53
124 0.53
125 0.52
126 0.51
127 0.48
128 0.45
129 0.44
130 0.4
131 0.36
132 0.29
133 0.24
134 0.26
135 0.25
136 0.27
137 0.25
138 0.24
139 0.2
140 0.17
141 0.15
142 0.13
143 0.14
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.24
148 0.27
149 0.35
150 0.4
151 0.46
152 0.48
153 0.56
154 0.66
155 0.69
156 0.77
157 0.76
158 0.78
159 0.76
160 0.73
161 0.65
162 0.57
163 0.48
164 0.38
165 0.37
166 0.3
167 0.25
168 0.21
169 0.2
170 0.18
171 0.16
172 0.15
173 0.1
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.09
185 0.1
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.17
199 0.16
200 0.16
201 0.18
202 0.18
203 0.2