FuNGI

I1CCG0

Protein Details

Accession

I1CCG0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
561-585	TKEFLMSFRKRIKKNPRNREIVTAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
431-433	KKK
442-469	KLFMPKKAHAAKVKKENIPRPIGRPESP
569-577	RKRIKKNPR

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSIYNTSKYDKSRARTAAPRPRLINGRPMPPQQRMMQNPQFQQAQSFQSEPAFDEFQLVSSAKHGQHHLMDFKTNKKVDFKTFTPPVKLHRKEPDRIPYRQYIQQLQQQQQQQQQQQQQNGGKPPAQLKNAATGLTEVQPPPTHGPKTGADTSLIAPMGGATRNKQMLFKKRTKQIYLAKEDTRELKEQEQRPWILEDIEGQNNYTGTLEGGQRSDYMLFVLAENGFKVVPVDRWYKFQPKRNFKTLSIEEAEEQLKKQQKQESQRWMMLNRREQESNVEDAAPRHKFKVVDNGEKRGNKSDDEAPTKHDSDIDDLDFDDDFQDDEEGTGDHEAEDDEVKDSKERVKKEIKGFKMNGGDDYDLEDLENEIKLSSEGKQMRKLVRDLEKNRAYESDDDEDPYASSADEVASDDEEKKSDEESKNKSTPTLPKKKSSAANTSSKLFMPKKAHAAKVKKENIPRPIGRPESPSLFANKKKEGSPNPVSPSYKPTSPTPRQNSHSPPHRAASPIAVDQNRKRKLEDIPSAGAPDQKQRKSSTPADDDLITEQEVIETLRGRRMTTKEFLMSFRKRIKKNPRNREIVTALLKKVARHSASDDPNTHMLELKPELQKGHN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.67
3	0.73
4	0.74
5	0.75
6	0.77
7	0.7
8	0.71
9	0.71
10	0.65
11	0.65
12	0.6
13	0.6
14	0.59
15	0.65
16	0.65
17	0.62
18	0.64
19	0.6
20	0.64
21	0.63
22	0.66
23	0.67
24	0.68
25	0.65
26	0.65
27	0.62
28	0.53
29	0.5
30	0.44
31	0.4
32	0.36
33	0.34
34	0.29
35	0.27
36	0.28
37	0.26
38	0.26
39	0.23
40	0.19
41	0.21
42	0.19
43	0.18
44	0.2
45	0.19
46	0.14
47	0.15
48	0.21
49	0.2
50	0.23
51	0.25
52	0.26
53	0.31
54	0.36
55	0.4
56	0.36
57	0.42
58	0.42
59	0.46
60	0.51
61	0.49
62	0.47
63	0.48
64	0.51
65	0.53
66	0.56
67	0.52
68	0.53
69	0.59
70	0.6
71	0.59
72	0.56
73	0.56
74	0.6
75	0.61
76	0.6
77	0.62
78	0.64
79	0.66
80	0.72
81	0.74
82	0.7
83	0.71
84	0.68
85	0.66
86	0.64
87	0.63
88	0.59
89	0.55
90	0.54
91	0.57
92	0.59
93	0.56
94	0.57
95	0.57
96	0.58
97	0.58
98	0.6
99	0.59
100	0.6
101	0.63
102	0.63
103	0.62
104	0.64
105	0.62
106	0.6
107	0.59
108	0.55
109	0.48
110	0.45
111	0.48
112	0.47
113	0.43
114	0.42
115	0.37
116	0.41
117	0.39
118	0.36
119	0.29
120	0.23
121	0.23
122	0.2
123	0.22
124	0.14
125	0.16
126	0.16
127	0.19
128	0.23
129	0.27
130	0.27
131	0.26
132	0.31
133	0.3
134	0.36
135	0.37
136	0.32
137	0.27
138	0.27
139	0.26
140	0.25
141	0.22
142	0.15
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.16
150	0.19
151	0.2
152	0.26
153	0.32
154	0.4
155	0.48
156	0.56
157	0.59
158	0.65
159	0.72
160	0.7
161	0.71
162	0.7
163	0.71
164	0.7
165	0.67
166	0.61
167	0.55
168	0.54
169	0.5
170	0.44
171	0.38
172	0.32
173	0.33
174	0.39
175	0.42
176	0.46
177	0.47
178	0.45
179	0.43
180	0.43
181	0.36
182	0.28
183	0.24
184	0.21
185	0.18
186	0.2
187	0.19
188	0.17
189	0.17
190	0.16
191	0.16
192	0.12
193	0.08
194	0.06
195	0.08
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.11
219	0.17
220	0.17
221	0.22
222	0.26
223	0.36
224	0.41
225	0.49
226	0.56
227	0.61
228	0.67
229	0.72
230	0.73
231	0.64
232	0.67
233	0.6
234	0.55
235	0.46
236	0.4
237	0.32
238	0.29
239	0.29
240	0.2
241	0.17
242	0.17
243	0.21
244	0.22
245	0.27
246	0.31
247	0.37
248	0.46
249	0.55
250	0.59
251	0.58
252	0.61
253	0.59
254	0.56
255	0.55
256	0.53
257	0.51
258	0.43
259	0.41
260	0.37
261	0.35
262	0.36
263	0.32
264	0.28
265	0.22
266	0.19
267	0.16
268	0.17
269	0.22
270	0.2
271	0.18
272	0.17
273	0.19
274	0.2
275	0.21
276	0.31
277	0.31
278	0.38
279	0.4
280	0.44
281	0.47
282	0.48
283	0.48
284	0.43
285	0.39
286	0.29
287	0.3
288	0.31
289	0.31
290	0.35
291	0.34
292	0.32
293	0.34
294	0.34
295	0.31
296	0.26
297	0.21
298	0.18
299	0.19
300	0.15
301	0.12
302	0.11
303	0.11
304	0.1
305	0.09
306	0.06
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.09
329	0.15
330	0.2
331	0.22
332	0.27
333	0.35
334	0.42
335	0.51
336	0.59
337	0.58
338	0.61
339	0.6
340	0.59
341	0.56
342	0.5
343	0.42
344	0.35
345	0.3
346	0.21
347	0.23
348	0.18
349	0.12
350	0.11
351	0.09
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.06
360	0.07
361	0.14
362	0.2
363	0.23
364	0.29
365	0.34
366	0.38
367	0.41
368	0.41
369	0.41
370	0.44
371	0.51
372	0.49
373	0.54
374	0.55
375	0.52
376	0.52
377	0.45
378	0.39
379	0.32
380	0.33
381	0.27
382	0.21
383	0.22
384	0.21
385	0.2
386	0.18
387	0.16
388	0.11
389	0.07
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.19
405	0.23
406	0.29
407	0.36
408	0.43
409	0.46
410	0.46
411	0.46
412	0.44
413	0.48
414	0.51
415	0.56
416	0.53
417	0.56
418	0.6
419	0.65
420	0.67
421	0.64
422	0.62
423	0.58
424	0.62
425	0.57
426	0.55
427	0.5
428	0.43
429	0.44
430	0.36
431	0.37
432	0.35
433	0.36
434	0.44
435	0.48
436	0.54
437	0.56
438	0.63
439	0.64
440	0.68
441	0.72
442	0.69
443	0.72
444	0.73
445	0.71
446	0.72
447	0.67
448	0.62
449	0.62
450	0.61
451	0.55
452	0.52
453	0.48
454	0.44
455	0.43
456	0.39
457	0.36
458	0.38
459	0.42
460	0.43
461	0.45
462	0.43
463	0.44
464	0.52
465	0.53
466	0.55
467	0.56
468	0.57
469	0.58
470	0.62
471	0.61
472	0.53
473	0.54
474	0.49
475	0.44
476	0.4
477	0.41
478	0.45
479	0.51
480	0.6
481	0.61
482	0.65
483	0.67
484	0.73
485	0.73
486	0.72
487	0.74
488	0.71
489	0.66
490	0.61
491	0.59
492	0.53
493	0.46
494	0.42
495	0.35
496	0.32
497	0.34
498	0.34
499	0.38
500	0.44
501	0.53
502	0.54
503	0.52
504	0.51
505	0.49
506	0.54
507	0.58
508	0.59
509	0.55
510	0.52
511	0.51
512	0.51
513	0.47
514	0.42
515	0.33
516	0.34
517	0.37
518	0.37
519	0.41
520	0.43
521	0.49
522	0.53
523	0.6
524	0.6
525	0.57
526	0.55
527	0.54
528	0.49
529	0.44
530	0.38
531	0.32
532	0.23
533	0.17
534	0.14
535	0.11
536	0.11
537	0.1
538	0.09
539	0.11
540	0.12
541	0.18
542	0.19
543	0.21
544	0.28
545	0.33
546	0.38
547	0.4
548	0.44
549	0.43
550	0.45
551	0.48
552	0.51
553	0.5
554	0.52
555	0.57
556	0.61
557	0.61
558	0.69
559	0.76
560	0.77
561	0.82
562	0.85
563	0.85
564	0.85
565	0.84
566	0.82
567	0.74
568	0.72
569	0.7
570	0.64
571	0.55
572	0.52
573	0.5
574	0.43
575	0.45
576	0.46
577	0.39
578	0.37
579	0.42
580	0.45
581	0.52
582	0.57
583	0.53
584	0.5
585	0.52
586	0.5
587	0.44
588	0.38
589	0.3
590	0.29
591	0.3
592	0.32
593	0.33
594	0.34

I1CCG0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer