Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CH16

Protein Details
Accession I1CH16    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-127IFEKRRKTGRPRTLHDEHKNBasic
260-287IKCSLRLPQPPSNKKRKRRDGVGQMSKGHydrophilic
355-375FWSVVKSKVKRNKFLEKETLMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-278NKKRKRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
Amino Acid Sequences MNIQFLFENGKGSVVDEYGRPEPMDYIVDEEQFRLETLSSHTQYLAQLPLESEKRIDAMQLEKEDKVRFFKLLFERCLSAAAAAEQLGIHVRTAQKWAAQYEKDPDSIFEKRRKTGRPRTLHDEHKNAILECIDENPSIVLDEVMKKLKQVFTELKVSKTTLFDFVKQHCNLSLKKARLQPIDRNSEEKIQERLDWVRKWDKTDLDFTRNCVFLDESAFHINLKRSMAWSKKGAPAVVTVPKTRATTTTILGAISAEGVIKCSLRLPQPPSNKKRKRRDGVGQMSKGTVTGHYISFLKATMDEMDRYPHMKGHYLVMDNAPIHTSEDIAKYVEPRGYRCAYLPPYSPELNPIEQFWSVVKSKVKRNKFLEKETLMTRISEASNSLKLSDFKGIVRHSHKCLDRCRNGQAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.13
4 0.18
5 0.19
6 0.2
7 0.19
8 0.18
9 0.19
10 0.2
11 0.2
12 0.16
13 0.19
14 0.19
15 0.22
16 0.21
17 0.21
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.13
22 0.11
23 0.1
24 0.16
25 0.25
26 0.25
27 0.26
28 0.26
29 0.27
30 0.27
31 0.29
32 0.26
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.23
37 0.23
38 0.23
39 0.21
40 0.18
41 0.19
42 0.18
43 0.18
44 0.15
45 0.18
46 0.23
47 0.28
48 0.3
49 0.3
50 0.34
51 0.36
52 0.36
53 0.36
54 0.32
55 0.29
56 0.27
57 0.34
58 0.39
59 0.44
60 0.45
61 0.42
62 0.42
63 0.4
64 0.41
65 0.32
66 0.23
67 0.16
68 0.13
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.16
81 0.18
82 0.19
83 0.21
84 0.24
85 0.27
86 0.28
87 0.29
88 0.32
89 0.33
90 0.32
91 0.29
92 0.28
93 0.27
94 0.32
95 0.36
96 0.37
97 0.4
98 0.44
99 0.51
100 0.59
101 0.64
102 0.68
103 0.72
104 0.73
105 0.76
106 0.79
107 0.79
108 0.8
109 0.77
110 0.73
111 0.63
112 0.59
113 0.54
114 0.45
115 0.38
116 0.28
117 0.22
118 0.15
119 0.16
120 0.13
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.08
130 0.1
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.17
135 0.19
136 0.19
137 0.23
138 0.26
139 0.26
140 0.36
141 0.37
142 0.35
143 0.34
144 0.34
145 0.3
146 0.27
147 0.24
148 0.22
149 0.22
150 0.23
151 0.26
152 0.29
153 0.35
154 0.34
155 0.33
156 0.29
157 0.32
158 0.29
159 0.34
160 0.37
161 0.32
162 0.37
163 0.42
164 0.45
165 0.48
166 0.53
167 0.52
168 0.53
169 0.58
170 0.53
171 0.51
172 0.46
173 0.45
174 0.42
175 0.36
176 0.31
177 0.24
178 0.24
179 0.23
180 0.27
181 0.28
182 0.26
183 0.29
184 0.33
185 0.33
186 0.36
187 0.38
188 0.36
189 0.32
190 0.39
191 0.38
192 0.36
193 0.36
194 0.35
195 0.34
196 0.31
197 0.29
198 0.22
199 0.18
200 0.12
201 0.14
202 0.12
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.14
211 0.12
212 0.13
213 0.19
214 0.23
215 0.25
216 0.27
217 0.3
218 0.33
219 0.34
220 0.32
221 0.27
222 0.25
223 0.25
224 0.27
225 0.25
226 0.21
227 0.21
228 0.23
229 0.24
230 0.22
231 0.2
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.2
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.14
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.1
251 0.13
252 0.19
253 0.25
254 0.33
255 0.44
256 0.55
257 0.63
258 0.71
259 0.78
260 0.82
261 0.86
262 0.89
263 0.87
264 0.87
265 0.88
266 0.88
267 0.89
268 0.88
269 0.8
270 0.7
271 0.61
272 0.51
273 0.41
274 0.3
275 0.2
276 0.13
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.1
285 0.08
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.18
297 0.21
298 0.21
299 0.23
300 0.26
301 0.26
302 0.27
303 0.25
304 0.27
305 0.23
306 0.22
307 0.18
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.17
319 0.19
320 0.19
321 0.19
322 0.25
323 0.27
324 0.28
325 0.27
326 0.33
327 0.35
328 0.38
329 0.39
330 0.37
331 0.4
332 0.4
333 0.39
334 0.36
335 0.35
336 0.34
337 0.31
338 0.28
339 0.26
340 0.24
341 0.25
342 0.2
343 0.21
344 0.19
345 0.24
346 0.29
347 0.32
348 0.42
349 0.51
350 0.59
351 0.64
352 0.71
353 0.77
354 0.78
355 0.81
356 0.81
357 0.75
358 0.71
359 0.64
360 0.6
361 0.5
362 0.42
363 0.34
364 0.28
365 0.25
366 0.21
367 0.21
368 0.2
369 0.23
370 0.23
371 0.24
372 0.24
373 0.24
374 0.26
375 0.29
376 0.27
377 0.25
378 0.31
379 0.33
380 0.38
381 0.45
382 0.48
383 0.47
384 0.54
385 0.6
386 0.61
387 0.68
388 0.71
389 0.73
390 0.73