Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CFU6

Protein Details
Accession I1CFU6    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-87IQAAKDEKKSRRPAKGERPTKDGRPRRGRQFDRHSGTBasic
212-241QRFQEKPRNDFRKNDRRGNRNNNRKAAKSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-79KDEKKSRRPAKGERPTKDGRPRRGR
193-205KAAAKKEKARKEK
217-236KPRNDFRKNDRRGNRNNNRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSTFSKNLFNVLAENDNTPVKVEAPAPVVVDKKNVSKLNKEEGKEHERTTIQAAKDEKKSRRPAKGERPTKDGRPRRGRQFDRHSGTGIVDSEKKVNQGWGKPGKAEAEGAKDTLKAADPDAPEQEAPATPVEAEEAVKTLDEYLAEKANKSLNIALPEARKANDADEAAFAGAVVHTKQELEEFYVSAKETKAAAKKEKARKEKVIVEIEQRFQEKPRNDFRKNDRRGNRNNNRKAAKSNLAAVNLQDAAAFPSLGASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.21
4 0.21
5 0.2
6 0.17
7 0.14
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.18
12 0.19
13 0.19
14 0.21
15 0.23
16 0.21
17 0.25
18 0.24
19 0.26
20 0.33
21 0.38
22 0.39
23 0.45
24 0.5
25 0.56
26 0.6
27 0.57
28 0.54
29 0.56
30 0.6
31 0.55
32 0.5
33 0.46
34 0.4
35 0.39
36 0.4
37 0.38
38 0.31
39 0.33
40 0.36
41 0.36
42 0.44
43 0.51
44 0.52
45 0.55
46 0.65
47 0.68
48 0.73
49 0.76
50 0.78
51 0.81
52 0.85
53 0.85
54 0.79
55 0.78
56 0.73
57 0.74
58 0.74
59 0.72
60 0.71
61 0.72
62 0.76
63 0.79
64 0.85
65 0.83
66 0.82
67 0.83
68 0.83
69 0.78
70 0.72
71 0.63
72 0.53
73 0.46
74 0.38
75 0.29
76 0.21
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.16
82 0.14
83 0.18
84 0.2
85 0.21
86 0.29
87 0.34
88 0.34
89 0.33
90 0.35
91 0.31
92 0.28
93 0.26
94 0.19
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.07
104 0.08
105 0.11
106 0.11
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.06
131 0.06
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.16
140 0.14
141 0.17
142 0.18
143 0.19
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.18
148 0.16
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.12
177 0.1
178 0.1
179 0.16
180 0.22
181 0.27
182 0.34
183 0.41
184 0.51
185 0.59
186 0.68
187 0.72
188 0.74
189 0.76
190 0.76
191 0.75
192 0.74
193 0.71
194 0.64
195 0.62
196 0.59
197 0.53
198 0.5
199 0.44
200 0.37
201 0.33
202 0.39
203 0.37
204 0.4
205 0.48
206 0.54
207 0.57
208 0.65
209 0.73
210 0.75
211 0.77
212 0.8
213 0.79
214 0.79
215 0.85
216 0.87
217 0.88
218 0.88
219 0.89
220 0.89
221 0.86
222 0.81
223 0.77
224 0.74
225 0.71
226 0.63
227 0.62
228 0.57
229 0.53
230 0.49
231 0.43
232 0.38
233 0.3
234 0.26
235 0.18
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.08