Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CCD1

Protein Details
Accession I1CCD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-164DTLEKEKVKRRRLNYEDRGKNTBasic
611-631EKYGTAWRKERKDSRFFSRRNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038279  Ndc10_dom2_sf  
IPR031872  NDC10_II  
IPR022210  TF_GCR1-like  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12550  GCR1_C  
PF16787  NDC10_II  
Amino Acid Sequences MNNQVNNGSSSTSNESVQRMVETSTAVHQSNQMVIAQNMVHRPVNTIKAYSAKQEEWKVWCREQGFEDGYTVSDKKLSFFLMEYVSKRGSKYRRNDDGTPVALGRESILAYVKAISDMYNKQKALGWNTNGVARGPLVKSFLDTLEKEKVKRRRLNYEDRGKNTLNDGYSKEELKKVSSFFFTEKNNIRGCRDRLCFLLSHAMLCRIQTTLSMEFADLFSLEVENQGLTECIALVATIAHGKTSQHGKIEYGSSLRHRDVEVCSIGALALYLFSRFHFENEEFPNFEKRENWYKTVVFKGDSPFKAIQYKAQHSTYVDVFKKVGIHTSKVTHANKKSALNMIAQENVSKVQQRMVGRWGTDKMVGRYVSSLPIETMKSLAGFNGQQHSNYFLPRAVIKPSLALQKLVFKDIEYWKERFNIGYDIQEDIAGPNFLNLLAHLRVILLQDSVVLKKKYPQYYLWNCEIFQTELYKNFEVEVLGSLEEEEAFLSNRQVQLAMPELASTLQAGFGAITSSLLSIKASNAAEFKKINQSFGDFFALGNAHFNSSENSGASFSTPLTAPTPTGQAQPAEHEETQVFYKMNRKIVSVTDVWREYSEGLGENPSVQYLEEKYGTAWRKERKDSRFFSRRNEIYNGIKRKAEEERISLEEAARMLEERRVQLNISLDKLRSYIKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.28
4 0.28
5 0.25
6 0.2
7 0.2
8 0.18
9 0.16
10 0.16
11 0.19
12 0.22
13 0.21
14 0.21
15 0.22
16 0.23
17 0.24
18 0.24
19 0.21
20 0.19
21 0.19
22 0.2
23 0.18
24 0.2
25 0.21
26 0.23
27 0.23
28 0.21
29 0.26
30 0.29
31 0.35
32 0.34
33 0.33
34 0.32
35 0.36
36 0.38
37 0.4
38 0.4
39 0.37
40 0.41
41 0.45
42 0.48
43 0.48
44 0.55
45 0.55
46 0.52
47 0.54
48 0.49
49 0.48
50 0.45
51 0.46
52 0.4
53 0.34
54 0.32
55 0.27
56 0.26
57 0.26
58 0.23
59 0.16
60 0.17
61 0.16
62 0.16
63 0.18
64 0.18
65 0.16
66 0.17
67 0.19
68 0.2
69 0.24
70 0.25
71 0.27
72 0.29
73 0.29
74 0.29
75 0.35
76 0.4
77 0.45
78 0.54
79 0.6
80 0.67
81 0.72
82 0.75
83 0.74
84 0.72
85 0.64
86 0.56
87 0.46
88 0.36
89 0.29
90 0.25
91 0.18
92 0.12
93 0.1
94 0.08
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.13
104 0.19
105 0.27
106 0.33
107 0.32
108 0.33
109 0.37
110 0.41
111 0.45
112 0.47
113 0.42
114 0.4
115 0.41
116 0.42
117 0.39
118 0.34
119 0.26
120 0.19
121 0.2
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.17
127 0.17
128 0.19
129 0.19
130 0.19
131 0.22
132 0.29
133 0.32
134 0.33
135 0.41
136 0.48
137 0.54
138 0.61
139 0.64
140 0.66
141 0.72
142 0.8
143 0.81
144 0.83
145 0.82
146 0.78
147 0.77
148 0.67
149 0.6
150 0.52
151 0.46
152 0.37
153 0.31
154 0.28
155 0.27
156 0.28
157 0.29
158 0.28
159 0.28
160 0.27
161 0.28
162 0.29
163 0.25
164 0.25
165 0.25
166 0.26
167 0.24
168 0.28
169 0.27
170 0.32
171 0.35
172 0.38
173 0.4
174 0.4
175 0.43
176 0.46
177 0.47
178 0.48
179 0.46
180 0.42
181 0.39
182 0.39
183 0.35
184 0.29
185 0.33
186 0.24
187 0.23
188 0.22
189 0.23
190 0.21
191 0.21
192 0.19
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.14
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.08
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.1
230 0.16
231 0.17
232 0.19
233 0.19
234 0.2
235 0.22
236 0.23
237 0.21
238 0.17
239 0.17
240 0.18
241 0.21
242 0.21
243 0.2
244 0.19
245 0.21
246 0.21
247 0.23
248 0.2
249 0.16
250 0.15
251 0.14
252 0.13
253 0.1
254 0.08
255 0.04
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.07
262 0.08
263 0.09
264 0.12
265 0.13
266 0.18
267 0.22
268 0.24
269 0.23
270 0.24
271 0.3
272 0.26
273 0.26
274 0.23
275 0.23
276 0.31
277 0.34
278 0.35
279 0.33
280 0.34
281 0.37
282 0.39
283 0.35
284 0.26
285 0.25
286 0.27
287 0.3
288 0.28
289 0.3
290 0.27
291 0.27
292 0.3
293 0.28
294 0.3
295 0.29
296 0.33
297 0.33
298 0.33
299 0.32
300 0.29
301 0.31
302 0.27
303 0.27
304 0.23
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.2
309 0.17
310 0.21
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.2
315 0.23
316 0.3
317 0.33
318 0.34
319 0.35
320 0.37
321 0.39
322 0.39
323 0.37
324 0.32
325 0.31
326 0.25
327 0.24
328 0.2
329 0.18
330 0.16
331 0.15
332 0.12
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.1
338 0.15
339 0.16
340 0.17
341 0.2
342 0.22
343 0.2
344 0.22
345 0.21
346 0.18
347 0.2
348 0.21
349 0.18
350 0.21
351 0.2
352 0.18
353 0.19
354 0.18
355 0.17
356 0.15
357 0.14
358 0.1
359 0.12
360 0.12
361 0.1
362 0.1
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.18
375 0.17
376 0.17
377 0.16
378 0.12
379 0.13
380 0.14
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.16
387 0.22
388 0.21
389 0.2
390 0.18
391 0.24
392 0.24
393 0.25
394 0.22
395 0.16
396 0.21
397 0.25
398 0.31
399 0.28
400 0.28
401 0.28
402 0.31
403 0.31
404 0.26
405 0.23
406 0.21
407 0.18
408 0.2
409 0.19
410 0.18
411 0.17
412 0.17
413 0.14
414 0.1
415 0.1
416 0.08
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.06
432 0.05
433 0.07
434 0.08
435 0.1
436 0.15
437 0.15
438 0.15
439 0.21
440 0.29
441 0.33
442 0.36
443 0.39
444 0.44
445 0.53
446 0.58
447 0.58
448 0.52
449 0.46
450 0.44
451 0.41
452 0.32
453 0.24
454 0.22
455 0.18
456 0.22
457 0.26
458 0.24
459 0.22
460 0.21
461 0.2
462 0.16
463 0.15
464 0.12
465 0.09
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.05
473 0.04
474 0.05
475 0.06
476 0.07
477 0.09
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.1
482 0.11
483 0.15
484 0.15
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.09
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.04
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.12
508 0.12
509 0.13
510 0.16
511 0.17
512 0.21
513 0.21
514 0.23
515 0.29
516 0.29
517 0.3
518 0.28
519 0.31
520 0.28
521 0.31
522 0.32
523 0.21
524 0.2
525 0.2
526 0.19
527 0.15
528 0.17
529 0.14
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.12
534 0.14
535 0.15
536 0.13
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.12
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.11
546 0.12
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.18
551 0.17
552 0.2
553 0.2
554 0.2
555 0.2
556 0.24
557 0.27
558 0.28
559 0.27
560 0.26
561 0.25
562 0.24
563 0.25
564 0.23
565 0.19
566 0.15
567 0.23
568 0.27
569 0.34
570 0.33
571 0.33
572 0.33
573 0.36
574 0.4
575 0.36
576 0.35
577 0.35
578 0.35
579 0.34
580 0.32
581 0.3
582 0.25
583 0.22
584 0.2
585 0.14
586 0.14
587 0.14
588 0.14
589 0.14
590 0.13
591 0.13
592 0.11
593 0.1
594 0.12
595 0.12
596 0.16
597 0.16
598 0.16
599 0.17
600 0.25
601 0.3
602 0.33
603 0.39
604 0.44
605 0.51
606 0.61
607 0.7
608 0.71
609 0.77
610 0.77
611 0.8
612 0.82
613 0.78
614 0.76
615 0.78
616 0.73
617 0.69
618 0.67
619 0.62
620 0.62
621 0.67
622 0.66
623 0.6
624 0.58
625 0.53
626 0.53
627 0.56
628 0.55
629 0.51
630 0.47
631 0.49
632 0.5
633 0.52
634 0.47
635 0.39
636 0.32
637 0.26
638 0.22
639 0.17
640 0.14
641 0.13
642 0.17
643 0.21
644 0.22
645 0.25
646 0.26
647 0.26
648 0.29
649 0.36
650 0.35
651 0.35
652 0.36
653 0.34
654 0.34
655 0.35