FuNGI

I1C2G9

Protein Details

Accession

I1C2G9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
88-109	QSNPRFERARRISDRKVRLRAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
297-316	GRPLKSIRARLKGKEGRLRG

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto 8, cyto_pero 7.833, pero 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3
CDD	cd02733 RNAP_II_RPB1_N

Amino Acid Sequences

MSVSKIEFPELYEEGTQKPRVGGLLDPRMGTIDRNYKCQTCGEGMAECPGHFGHIDLAKPVFHIGFLTKIKKILECVCFHCSKLKVDQSNPRFERARRISDRKVRLRAVWDIAKTKMTCEGGDEEDGLEEKEEFNSGKRKSNHGGCGYKQPLIRKDGLKLYAQFRSSPGDDSGNEGKQQLTAAKVLQILKNIPDQDIRDMGLSEEYARPEWMMITVLPVPPPQVRPSIQMDGTSKGEDDLTHKLSDILKANANVKRCESEGAPVHVVNEFEQLLQFHIATYMDNDIAGQPQALQKSGRPLKSIRARLKGKEGRLRGNLMGKRVDFSARTVITGDPNLALDQVGVPRSIARNLTYPEIVTPYNIDKLQQLVRNGPLEHPGAKYVIRDNGERIDLRYRKRAGEIPLQYGYRVERHINDDDVVIFNRQPSLHKMSMMGHRVKVMPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNLHVPQSLETRAEVTEICMVPKQIVSPQSNKPVMGIVQDTLCGIRKFTLRDCFLSKDLVMNIVMWVPSWDGYIPPPAILKPKPLWSGKQILSMVIPKGINCQTFHSTHPDGETTLISPGDTRVIIENGELICGIVCKKTVGTANGGLIHTIMNELGPRVSKRLPERYSACCKSTWLLQNGFSIWYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.31
3	0.32
4	0.27
5	0.27
6	0.26
7	0.25
8	0.25
9	0.26
10	0.29
11	0.36
12	0.37
13	0.36
14	0.35
15	0.36
16	0.34
17	0.31
18	0.29
19	0.3
20	0.3
21	0.37
22	0.41
23	0.42
24	0.43
25	0.45
26	0.41
27	0.36
28	0.38
29	0.33
30	0.31
31	0.29
32	0.32
33	0.3
34	0.25
35	0.23
36	0.18
37	0.16
38	0.14
39	0.14
40	0.15
41	0.17
42	0.18
43	0.19
44	0.2
45	0.19
46	0.2
47	0.21
48	0.15
49	0.11
50	0.12
51	0.11
52	0.18
53	0.24
54	0.28
55	0.28
56	0.31
57	0.33
58	0.33
59	0.37
60	0.37
61	0.38
62	0.39
63	0.42
64	0.45
65	0.45
66	0.44
67	0.46
68	0.41
69	0.38
70	0.43
71	0.47
72	0.48
73	0.55
74	0.64
75	0.64
76	0.71
77	0.69
78	0.66
79	0.62
80	0.57
81	0.6
82	0.57
83	0.61
84	0.6
85	0.67
86	0.71
87	0.75
88	0.84
89	0.82
90	0.83
91	0.76
92	0.71
93	0.68
94	0.64
95	0.61
96	0.56
97	0.51
98	0.46
99	0.44
100	0.45
101	0.4
102	0.35
103	0.34
104	0.3
105	0.25
106	0.25
107	0.27
108	0.23
109	0.24
110	0.23
111	0.17
112	0.16
113	0.16
114	0.13
115	0.1
116	0.08
117	0.07
118	0.07
119	0.08
120	0.08
121	0.12
122	0.2
123	0.22
124	0.31
125	0.34
126	0.4
127	0.46
128	0.54
129	0.58
130	0.59
131	0.63
132	0.56
133	0.64
134	0.6
135	0.56
136	0.51
137	0.5
138	0.46
139	0.45
140	0.49
141	0.41
142	0.43
143	0.45
144	0.45
145	0.43
146	0.42
147	0.41
148	0.4
149	0.39
150	0.35
151	0.3
152	0.32
153	0.29
154	0.27
155	0.25
156	0.23
157	0.22
158	0.27
159	0.3
160	0.26
161	0.26
162	0.24
163	0.22
164	0.19
165	0.2
166	0.15
167	0.12
168	0.12
169	0.12
170	0.13
171	0.17
172	0.19
173	0.19
174	0.2
175	0.2
176	0.2
177	0.24
178	0.23
179	0.21
180	0.21
181	0.21
182	0.22
183	0.22
184	0.21
185	0.17
186	0.16
187	0.15
188	0.12
189	0.11
190	0.1
191	0.1
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.11
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.08
200	0.06
201	0.08
202	0.1
203	0.1
204	0.11
205	0.11
206	0.12
207	0.14
208	0.16
209	0.16
210	0.19
211	0.19
212	0.23
213	0.29
214	0.31
215	0.29
216	0.31
217	0.3
218	0.29
219	0.29
220	0.25
221	0.19
222	0.15
223	0.15
224	0.12
225	0.13
226	0.15
227	0.16
228	0.16
229	0.16
230	0.18
231	0.18
232	0.22
233	0.21
234	0.19
235	0.19
236	0.21
237	0.26
238	0.27
239	0.29
240	0.26
241	0.25
242	0.25
243	0.23
244	0.23
245	0.18
246	0.21
247	0.22
248	0.24
249	0.24
250	0.22
251	0.22
252	0.21
253	0.2
254	0.15
255	0.13
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.05
276	0.05
277	0.07
278	0.08
279	0.09
280	0.09
281	0.1
282	0.19
283	0.25
284	0.26
285	0.26
286	0.27
287	0.35
288	0.43
289	0.51
290	0.48
291	0.52
292	0.55
293	0.54
294	0.64
295	0.6
296	0.58
297	0.57
298	0.53
299	0.5
300	0.49
301	0.49
302	0.41
303	0.43
304	0.38
305	0.33
306	0.33
307	0.26
308	0.24
309	0.22
310	0.22
311	0.14
312	0.14
313	0.17
314	0.15
315	0.15
316	0.15
317	0.15
318	0.14
319	0.14
320	0.13
321	0.07
322	0.08
323	0.07
324	0.06
325	0.06
326	0.04
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.05
332	0.07
333	0.08
334	0.09
335	0.1
336	0.1
337	0.13
338	0.14
339	0.16
340	0.15
341	0.15
342	0.14
343	0.15
344	0.14
345	0.1
346	0.11
347	0.1
348	0.13
349	0.13
350	0.13
351	0.11
352	0.14
353	0.18
354	0.2
355	0.2
356	0.19
357	0.22
358	0.24
359	0.24
360	0.22
361	0.21
362	0.19
363	0.19
364	0.17
365	0.16
366	0.14
367	0.14
368	0.15
369	0.14
370	0.17
371	0.18
372	0.18
373	0.19
374	0.2
375	0.22
376	0.21
377	0.21
378	0.25
379	0.28
380	0.31
381	0.37
382	0.37
383	0.36
384	0.39
385	0.42
386	0.38
387	0.43
388	0.42
389	0.39
390	0.4
391	0.39
392	0.35
393	0.31
394	0.27
395	0.2
396	0.19
397	0.17
398	0.16
399	0.21
400	0.23
401	0.23
402	0.22
403	0.2
404	0.18
405	0.18
406	0.16
407	0.12
408	0.1
409	0.09
410	0.11
411	0.11
412	0.12
413	0.16
414	0.23
415	0.23
416	0.24
417	0.25
418	0.27
419	0.34
420	0.39
421	0.36
422	0.29
423	0.3
424	0.3
425	0.29
426	0.27
427	0.22
428	0.19
429	0.2
430	0.24
431	0.24
432	0.25
433	0.25
434	0.24
435	0.23
436	0.2
437	0.19
438	0.19
439	0.18
440	0.17
441	0.17
442	0.16
443	0.16
444	0.15
445	0.13
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.09
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.06
457	0.08
458	0.1
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.12
463	0.12
464	0.13
465	0.12
466	0.11
467	0.15
468	0.14
469	0.15
470	0.15
471	0.15
472	0.15
473	0.15
474	0.15
475	0.13
476	0.2
477	0.23
478	0.28
479	0.34
480	0.42
481	0.43
482	0.42
483	0.38
484	0.34
485	0.3
486	0.27
487	0.22
488	0.15
489	0.13
490	0.13
491	0.13
492	0.12
493	0.15
494	0.13
495	0.12
496	0.15
497	0.18
498	0.21
499	0.28
500	0.35
501	0.35
502	0.39
503	0.42
504	0.43
505	0.41
506	0.4
507	0.34
508	0.29
509	0.26
510	0.23
511	0.2
512	0.16
513	0.15
514	0.13
515	0.12
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.09
524	0.14
525	0.14
526	0.14
527	0.15
528	0.16
529	0.23
530	0.24
531	0.29
532	0.28
533	0.36
534	0.42
535	0.45
536	0.48
537	0.47
538	0.54
539	0.5
540	0.53
541	0.46
542	0.4
543	0.39
544	0.38
545	0.33
546	0.28
547	0.26
548	0.19
549	0.25
550	0.28
551	0.28
552	0.26
553	0.31
554	0.31
555	0.33
556	0.35
557	0.37
558	0.35
559	0.33
560	0.34
561	0.3
562	0.26
563	0.26
564	0.24
565	0.17
566	0.17
567	0.15
568	0.12
569	0.12
570	0.12
571	0.13
572	0.12
573	0.12
574	0.13
575	0.14
576	0.14
577	0.14
578	0.17
579	0.14
580	0.14
581	0.13
582	0.1
583	0.09
584	0.1
585	0.11
586	0.08
587	0.09
588	0.1
589	0.1
590	0.15
591	0.21
592	0.22
593	0.27
594	0.28
595	0.31
596	0.34
597	0.34
598	0.3
599	0.24
600	0.22
601	0.16
602	0.14
603	0.1
604	0.07
605	0.07
606	0.08
607	0.1
608	0.14
609	0.16
610	0.21
611	0.25
612	0.31
613	0.39
614	0.49
615	0.5
616	0.55
617	0.58
618	0.62
619	0.69
620	0.67
621	0.61
622	0.51
623	0.51
624	0.45
625	0.49
626	0.49
627	0.46
628	0.44
629	0.45
630	0.48
631	0.46

I1C2G9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer