Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CGM1

Protein Details
Accession I1CGM1    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
436-465KKDPNSVHVKKPKEKKKRTPLLPKNMDPNVBasic
473-498LPKQERSTFRMKGKNKKAANKGPQGAHydrophilic
536-558KPTTVSTNKSSSKKKKGKGKSKWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
437-455KDPNSVHVKKPKEKKKRTP
482-493RMKGKNKKAANK
546-558SSKKKKGKGKSKW
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.499, cyto 6.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSYEKIYCYYRTNQFVPAMELLEQVKSTNKDSSLLYLEAQILYSQGQFKQSVQVYESLLKTLDKKDVLYDEIQVNLLAAKAGLLFSTNEQDTSAVKESSEDLYEVAYNTASVYLARGEISKAQEQLQLAQKQCMEKSNHMSEEEQEEELAVIATQLGYTYQLQGRTTEAIKIYHSVLNSKDVSVVTVASNNIVSVEQTKDLDEVAKTLKLATSKEVDAKLKGYQKRVILMNESLLHLYSKKVSSATFHQHKASKAIEELKKYAERRPSSLAIHFATIQLQLLESQHAAALQTLQHYLAAAQKQDQYRPALVALLVWLYQQTGQSELAMETLDKAASVWKTDAAFTTTHTPTSIIKQTAAFKLKASRFEEAVADYEQLVKEDPTDAQAVAGLIAAYAQVDPAKAEQYGNALPEIALNHLDIDTLEKVVPGVKRGYVKKDPNSVHVKKPKEKKKRTPLLPKNMDPNVQPDPERWLPKQERSTFRMKGKNKKAANKGPQGAAVEGGGIGGTGSANISGVKKSNSTEQPAAAAVVESVPKPTTVSTNKSSSKKKKGKGKSKW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.49
3 0.48
4 0.42
5 0.35
6 0.29
7 0.28
8 0.24
9 0.21
10 0.19
11 0.15
12 0.19
13 0.2
14 0.23
15 0.26
16 0.26
17 0.27
18 0.28
19 0.32
20 0.31
21 0.29
22 0.26
23 0.23
24 0.24
25 0.21
26 0.21
27 0.15
28 0.11
29 0.11
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.18
34 0.19
35 0.19
36 0.27
37 0.29
38 0.3
39 0.29
40 0.3
41 0.3
42 0.34
43 0.33
44 0.26
45 0.24
46 0.23
47 0.24
48 0.25
49 0.28
50 0.24
51 0.24
52 0.28
53 0.3
54 0.32
55 0.29
56 0.3
57 0.25
58 0.24
59 0.24
60 0.19
61 0.16
62 0.13
63 0.11
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.06
71 0.07
72 0.08
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.14
79 0.19
80 0.21
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.18
85 0.19
86 0.2
87 0.14
88 0.11
89 0.12
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.09
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.13
106 0.17
107 0.2
108 0.2
109 0.22
110 0.24
111 0.24
112 0.28
113 0.33
114 0.34
115 0.32
116 0.34
117 0.35
118 0.35
119 0.36
120 0.37
121 0.34
122 0.34
123 0.41
124 0.44
125 0.44
126 0.43
127 0.43
128 0.37
129 0.38
130 0.34
131 0.26
132 0.19
133 0.16
134 0.14
135 0.14
136 0.12
137 0.06
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.05
145 0.06
146 0.09
147 0.11
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.18
155 0.18
156 0.16
157 0.17
158 0.18
159 0.19
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.21
165 0.2
166 0.19
167 0.18
168 0.16
169 0.17
170 0.14
171 0.14
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.16
201 0.19
202 0.22
203 0.22
204 0.21
205 0.22
206 0.25
207 0.29
208 0.32
209 0.32
210 0.34
211 0.34
212 0.37
213 0.39
214 0.35
215 0.31
216 0.28
217 0.27
218 0.23
219 0.22
220 0.18
221 0.15
222 0.13
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.13
231 0.18
232 0.27
233 0.3
234 0.31
235 0.34
236 0.37
237 0.38
238 0.39
239 0.34
240 0.26
241 0.24
242 0.3
243 0.29
244 0.28
245 0.29
246 0.28
247 0.32
248 0.32
249 0.34
250 0.34
251 0.33
252 0.33
253 0.37
254 0.37
255 0.34
256 0.34
257 0.33
258 0.25
259 0.24
260 0.21
261 0.17
262 0.14
263 0.12
264 0.1
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.11
288 0.15
289 0.17
290 0.18
291 0.2
292 0.2
293 0.19
294 0.19
295 0.18
296 0.14
297 0.12
298 0.11
299 0.08
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.06
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.13
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.18
333 0.16
334 0.16
335 0.16
336 0.16
337 0.16
338 0.21
339 0.25
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.25
344 0.31
345 0.33
346 0.29
347 0.25
348 0.32
349 0.34
350 0.39
351 0.38
352 0.34
353 0.31
354 0.32
355 0.31
356 0.24
357 0.23
358 0.17
359 0.14
360 0.12
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.07
376 0.07
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.06
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.12
393 0.14
394 0.14
395 0.13
396 0.12
397 0.11
398 0.12
399 0.12
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.13
414 0.14
415 0.13
416 0.14
417 0.17
418 0.24
419 0.29
420 0.37
421 0.43
422 0.5
423 0.55
424 0.62
425 0.61
426 0.62
427 0.68
428 0.65
429 0.65
430 0.65
431 0.67
432 0.67
433 0.75
434 0.78
435 0.79
436 0.85
437 0.86
438 0.89
439 0.91
440 0.93
441 0.94
442 0.94
443 0.94
444 0.92
445 0.85
446 0.83
447 0.76
448 0.68
449 0.58
450 0.53
451 0.47
452 0.41
453 0.37
454 0.3
455 0.34
456 0.38
457 0.43
458 0.38
459 0.43
460 0.47
461 0.55
462 0.64
463 0.65
464 0.66
465 0.65
466 0.72
467 0.7
468 0.72
469 0.73
470 0.71
471 0.73
472 0.76
473 0.81
474 0.8
475 0.82
476 0.84
477 0.85
478 0.86
479 0.85
480 0.8
481 0.72
482 0.68
483 0.61
484 0.5
485 0.4
486 0.3
487 0.2
488 0.15
489 0.12
490 0.08
491 0.05
492 0.04
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.04
499 0.06
500 0.08
501 0.1
502 0.13
503 0.15
504 0.18
505 0.2
506 0.29
507 0.34
508 0.4
509 0.42
510 0.4
511 0.39
512 0.38
513 0.36
514 0.27
515 0.21
516 0.13
517 0.12
518 0.12
519 0.1
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.13
524 0.14
525 0.21
526 0.27
527 0.33
528 0.37
529 0.45
530 0.53
531 0.61
532 0.7
533 0.72
534 0.77
535 0.8
536 0.83
537 0.85
538 0.88