Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CHJ4

Protein Details
Accession I1CHJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-172SAQRRHNRIHREIKKNKDEQBasic
257-284ETQPREFAKCRRCRKAKYCSKSCQSKAWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01753  zf-MYND  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50865  ZF_MYND_2  
Amino Acid Sequences MREPNFSFPSQNRATICITSALYDRRALDCTATLPLVNSLTHLAYLTSTSPRIREILCLDGGLERLVRILLSASSRVDRLTSWKWTLAFQSIVNIGVRGTEQIRTKVVDAGVIPFILNILNNKTLKQKGNHHPSASHKPSLRRSTFPYVKIDSAQRRHNRIHREIKKNKDEQVFRREEDILLCLQLLAYLSKYAHIRELFHTAYSKDVFSVVEQFCNRIQPSPIQYWAGVIMRNACRKDETRGGLRRCANLSCRKWETQPREFAKCRRCRKAKYCSKSCQSKAWADGHRWWCIERHTSTLSTGIPTTHSVDTATATATTTTTATTTTTTTINNTSSGSNNNNEIHLPSRNSITSSISIEQGTESSNETSDNRTILMGVHMEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.36
3 0.35
4 0.3
5 0.27
6 0.23
7 0.27
8 0.26
9 0.25
10 0.27
11 0.28
12 0.26
13 0.28
14 0.27
15 0.25
16 0.22
17 0.22
18 0.21
19 0.2
20 0.17
21 0.16
22 0.17
23 0.16
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.1
31 0.09
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.19
39 0.22
40 0.21
41 0.24
42 0.24
43 0.26
44 0.25
45 0.24
46 0.23
47 0.21
48 0.21
49 0.16
50 0.13
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.1
59 0.11
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.19
67 0.22
68 0.27
69 0.28
70 0.31
71 0.32
72 0.33
73 0.35
74 0.31
75 0.28
76 0.21
77 0.22
78 0.19
79 0.2
80 0.18
81 0.15
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.12
88 0.15
89 0.17
90 0.19
91 0.2
92 0.21
93 0.23
94 0.22
95 0.19
96 0.17
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.09
102 0.09
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.09
107 0.14
108 0.15
109 0.17
110 0.22
111 0.28
112 0.33
113 0.37
114 0.44
115 0.49
116 0.59
117 0.63
118 0.59
119 0.58
120 0.6
121 0.65
122 0.59
123 0.55
124 0.48
125 0.5
126 0.57
127 0.62
128 0.58
129 0.51
130 0.53
131 0.58
132 0.6
133 0.56
134 0.53
135 0.46
136 0.44
137 0.42
138 0.43
139 0.4
140 0.4
141 0.46
142 0.47
143 0.49
144 0.55
145 0.59
146 0.6
147 0.61
148 0.67
149 0.68
150 0.73
151 0.76
152 0.79
153 0.81
154 0.78
155 0.75
156 0.72
157 0.69
158 0.64
159 0.66
160 0.6
161 0.51
162 0.5
163 0.43
164 0.36
165 0.3
166 0.24
167 0.15
168 0.11
169 0.1
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.2
189 0.16
190 0.18
191 0.17
192 0.15
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.16
198 0.13
199 0.17
200 0.17
201 0.18
202 0.18
203 0.22
204 0.22
205 0.16
206 0.17
207 0.18
208 0.22
209 0.23
210 0.25
211 0.22
212 0.22
213 0.2
214 0.21
215 0.18
216 0.14
217 0.12
218 0.15
219 0.19
220 0.23
221 0.24
222 0.22
223 0.25
224 0.26
225 0.31
226 0.33
227 0.33
228 0.37
229 0.45
230 0.47
231 0.51
232 0.52
233 0.5
234 0.45
235 0.44
236 0.42
237 0.44
238 0.44
239 0.45
240 0.47
241 0.46
242 0.5
243 0.57
244 0.58
245 0.56
246 0.62
247 0.6
248 0.63
249 0.66
250 0.68
251 0.69
252 0.7
253 0.72
254 0.73
255 0.77
256 0.78
257 0.83
258 0.86
259 0.86
260 0.87
261 0.87
262 0.86
263 0.86
264 0.86
265 0.8
266 0.77
267 0.72
268 0.67
269 0.63
270 0.61
271 0.56
272 0.5
273 0.56
274 0.52
275 0.5
276 0.45
277 0.41
278 0.36
279 0.36
280 0.39
281 0.32
282 0.33
283 0.32
284 0.32
285 0.32
286 0.32
287 0.28
288 0.23
289 0.21
290 0.16
291 0.15
292 0.16
293 0.18
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.14
300 0.13
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.15
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.19
323 0.23
324 0.25
325 0.24
326 0.28
327 0.28
328 0.28
329 0.27
330 0.28
331 0.26
332 0.28
333 0.29
334 0.26
335 0.29
336 0.29
337 0.3
338 0.29
339 0.29
340 0.27
341 0.28
342 0.28
343 0.25
344 0.24
345 0.23
346 0.21
347 0.18
348 0.16
349 0.12
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.15
354 0.16
355 0.2
356 0.21
357 0.21
358 0.19
359 0.18
360 0.18
361 0.16
362 0.18