Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CJX6

Protein Details
Accession I1CJX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
569-590LDTFLNKAKKGKRTREDEDDYAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASLSSLLPKPRQSLASSSSAPQLEKQINQIITKATSHRIPPYGQRQNFRPRLPEDFGNGGAFPEIHIAQFPLDMGRKDKSGAERKGGALTLQVDADGNVKYDAIARQGHSDDRIIHSSFKDMVPLKERKDVDVDKLAMDRPSEEEVQSVAEKTRLALERIVNSKVQAAKPKNVVSTSGGTNKDPTYIRYTPAHTGDGFNSGAKQRIIRMVDAPIDPMEPPSHLHKKVPRGPPSPPAPVMHSPPRKLTAKEQAEWIIPPCISNWKNTKGYTIPLDKRLAADGRGLQELTINDNFAKFSEALYAADRHAREEVRQRNLMQQKLAQKKKEAEEEKLRQLAQKAREERAGFKPSSNSSEPPSNANRPTAASLIADYDSSEESGSDRSESEDESPVKRREGKDSDEEEARERDQVRRDLQKKRQRELRMSNMGTEAKARHLAREQGRDISEKIALGLAKPTLSKESMFDARLFNQTEGIGSGFKDEDAYSTYDKPLFNQSSTSIYRYRGENHESEVLGSTNAEDLENAIRQDKFGTRKGFQGAEGGASSSGPVEFERETLGKPKNTDKDVFGLDTFLNKAKKGKRTREDEDDYASDEDRRRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.45
4 0.43
5 0.41
6 0.42
7 0.4
8 0.38
9 0.33
10 0.36
11 0.34
12 0.34
13 0.37
14 0.39
15 0.4
16 0.4
17 0.4
18 0.35
19 0.33
20 0.34
21 0.32
22 0.29
23 0.3
24 0.33
25 0.38
26 0.38
27 0.39
28 0.46
29 0.53
30 0.6
31 0.61
32 0.63
33 0.65
34 0.73
35 0.78
36 0.73
37 0.69
38 0.63
39 0.65
40 0.64
41 0.6
42 0.54
43 0.49
44 0.46
45 0.4
46 0.35
47 0.27
48 0.23
49 0.18
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.1
59 0.12
60 0.15
61 0.16
62 0.19
63 0.21
64 0.21
65 0.23
66 0.27
67 0.33
68 0.4
69 0.43
70 0.46
71 0.47
72 0.48
73 0.49
74 0.45
75 0.35
76 0.28
77 0.25
78 0.2
79 0.16
80 0.15
81 0.12
82 0.11
83 0.13
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.11
90 0.12
91 0.14
92 0.17
93 0.17
94 0.21
95 0.23
96 0.25
97 0.24
98 0.25
99 0.24
100 0.25
101 0.28
102 0.26
103 0.26
104 0.25
105 0.26
106 0.26
107 0.23
108 0.25
109 0.24
110 0.27
111 0.32
112 0.38
113 0.38
114 0.44
115 0.44
116 0.4
117 0.45
118 0.43
119 0.41
120 0.43
121 0.4
122 0.33
123 0.34
124 0.34
125 0.27
126 0.25
127 0.2
128 0.16
129 0.18
130 0.18
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.17
135 0.16
136 0.14
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.21
145 0.24
146 0.29
147 0.32
148 0.34
149 0.27
150 0.26
151 0.28
152 0.29
153 0.29
154 0.33
155 0.34
156 0.38
157 0.43
158 0.46
159 0.44
160 0.4
161 0.39
162 0.33
163 0.32
164 0.3
165 0.31
166 0.29
167 0.27
168 0.29
169 0.26
170 0.27
171 0.25
172 0.24
173 0.25
174 0.25
175 0.28
176 0.29
177 0.32
178 0.32
179 0.34
180 0.33
181 0.26
182 0.26
183 0.24
184 0.23
185 0.21
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.2
194 0.21
195 0.2
196 0.21
197 0.21
198 0.23
199 0.23
200 0.22
201 0.16
202 0.15
203 0.13
204 0.13
205 0.11
206 0.08
207 0.1
208 0.17
209 0.24
210 0.25
211 0.3
212 0.34
213 0.44
214 0.52
215 0.59
216 0.6
217 0.57
218 0.59
219 0.62
220 0.62
221 0.57
222 0.5
223 0.43
224 0.39
225 0.38
226 0.4
227 0.41
228 0.41
229 0.38
230 0.39
231 0.43
232 0.4
233 0.4
234 0.41
235 0.42
236 0.42
237 0.41
238 0.41
239 0.38
240 0.35
241 0.34
242 0.28
243 0.2
244 0.14
245 0.13
246 0.11
247 0.18
248 0.18
249 0.22
250 0.26
251 0.31
252 0.35
253 0.35
254 0.38
255 0.31
256 0.33
257 0.33
258 0.36
259 0.33
260 0.33
261 0.34
262 0.31
263 0.3
264 0.3
265 0.26
266 0.18
267 0.17
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.12
273 0.13
274 0.12
275 0.14
276 0.12
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.1
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.22
298 0.29
299 0.31
300 0.34
301 0.34
302 0.4
303 0.45
304 0.44
305 0.37
306 0.35
307 0.39
308 0.46
309 0.51
310 0.45
311 0.44
312 0.47
313 0.49
314 0.54
315 0.48
316 0.45
317 0.49
318 0.52
319 0.52
320 0.5
321 0.46
322 0.38
323 0.39
324 0.38
325 0.35
326 0.38
327 0.37
328 0.36
329 0.41
330 0.41
331 0.41
332 0.43
333 0.42
334 0.34
335 0.32
336 0.33
337 0.3
338 0.35
339 0.32
340 0.27
341 0.25
342 0.3
343 0.29
344 0.3
345 0.33
346 0.33
347 0.32
348 0.32
349 0.3
350 0.25
351 0.27
352 0.23
353 0.18
354 0.13
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.09
359 0.07
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.05
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.12
374 0.17
375 0.18
376 0.21
377 0.28
378 0.28
379 0.31
380 0.36
381 0.35
382 0.39
383 0.42
384 0.44
385 0.46
386 0.48
387 0.48
388 0.45
389 0.44
390 0.38
391 0.34
392 0.3
393 0.25
394 0.23
395 0.24
396 0.27
397 0.32
398 0.35
399 0.44
400 0.5
401 0.57
402 0.66
403 0.7
404 0.73
405 0.75
406 0.78
407 0.75
408 0.78
409 0.77
410 0.77
411 0.77
412 0.69
413 0.63
414 0.58
415 0.51
416 0.41
417 0.35
418 0.26
419 0.18
420 0.24
421 0.23
422 0.22
423 0.26
424 0.33
425 0.37
426 0.44
427 0.44
428 0.42
429 0.44
430 0.43
431 0.4
432 0.34
433 0.28
434 0.2
435 0.18
436 0.15
437 0.14
438 0.12
439 0.13
440 0.11
441 0.11
442 0.11
443 0.12
444 0.13
445 0.15
446 0.15
447 0.14
448 0.19
449 0.23
450 0.24
451 0.24
452 0.24
453 0.25
454 0.29
455 0.3
456 0.25
457 0.22
458 0.2
459 0.19
460 0.17
461 0.16
462 0.11
463 0.09
464 0.11
465 0.09
466 0.09
467 0.1
468 0.09
469 0.09
470 0.11
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.19
475 0.21
476 0.22
477 0.22
478 0.3
479 0.3
480 0.28
481 0.28
482 0.28
483 0.31
484 0.34
485 0.35
486 0.29
487 0.29
488 0.31
489 0.32
490 0.35
491 0.35
492 0.38
493 0.37
494 0.38
495 0.4
496 0.37
497 0.35
498 0.31
499 0.25
500 0.19
501 0.17
502 0.13
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.07
507 0.08
508 0.11
509 0.13
510 0.14
511 0.16
512 0.15
513 0.16
514 0.2
515 0.24
516 0.27
517 0.33
518 0.39
519 0.37
520 0.43
521 0.48
522 0.46
523 0.4
524 0.39
525 0.32
526 0.27
527 0.26
528 0.21
529 0.16
530 0.14
531 0.14
532 0.09
533 0.09
534 0.07
535 0.07
536 0.09
537 0.1
538 0.1
539 0.15
540 0.15
541 0.18
542 0.25
543 0.31
544 0.33
545 0.36
546 0.46
547 0.49
548 0.54
549 0.55
550 0.51
551 0.5
552 0.49
553 0.48
554 0.39
555 0.33
556 0.27
557 0.26
558 0.26
559 0.26
560 0.24
561 0.23
562 0.32
563 0.37
564 0.47
565 0.55
566 0.64
567 0.68
568 0.75
569 0.81
570 0.83
571 0.83
572 0.77
573 0.73
574 0.64
575 0.58
576 0.5
577 0.43
578 0.38
579 0.36