Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CFC2

Protein Details
Accession I1CFC2    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MASIKQPKKRHIRRGGPELEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-13KKRHIR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR006590  RNA_pol_Rpb4/RPC9_core  
IPR045222  Rpb4-like  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MASIKQPKKRHIRRGGPELEDATNLNLGEEFSGAQCLYLSEVKVILDVQDSKGTEVQNRASTNAVLAKTLEYVRNFSRYNTIDSVREVRQIMGKNLTQFEVAQMANLCCEEAEEAKALIPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.87
3 0.8
4 0.73
5 0.65
6 0.55
7 0.45
8 0.36
9 0.27
10 0.21
11 0.17
12 0.13
13 0.1
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.05
19 0.07
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.09
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.14
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.18
48 0.17
49 0.16
50 0.17
51 0.15
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.14
58 0.11
59 0.14
60 0.15
61 0.2
62 0.21
63 0.2
64 0.26
65 0.25
66 0.29
67 0.29
68 0.29
69 0.26
70 0.28
71 0.32
72 0.25
73 0.27
74 0.23
75 0.21
76 0.24
77 0.26
78 0.26
79 0.27
80 0.28
81 0.28
82 0.28
83 0.28
84 0.24
85 0.21
86 0.19
87 0.18
88 0.16
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.12