Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CCS3

Protein Details
Accession I1CCS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-71WYRFDNCIVYKKKRSNNKHVRLSFSKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00018  EF_HAND_1  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MSQYPQHRGLKADAAELPLLTLLSTQQLLLCSKAFSHLHKAATVGWYRFDNCIVYKKKRSNNKHVRLSFSKIELLDQNTTGQLNQTELGEWAMKKFNLDQPLTQQTISNILKNAETLYSNINVVNNGKSLKTTRYPQLDDEIVKFVTDMNNNNLPVNRDSILRYVRHIAQVKYRIPEKEISFSSGWLTKLFKRIGVKCRPMHGESASVDITSENIQNELRKIEGLLEPYDPVDIMNFDETGLYYQQPPRRTICYESLVGLKKTYVKKLDVAFGRQNRKIALLLDNASVHKIRIPLNNIKLIFLPANTTSKLQALDAGIIANFKAHFRAQQYDRALCLYISKKLDNLDVHKMDQAQAMFSLANAWLKVKPETIKNCWKHTKILAFKERTICDFEPVEYPTSALPLEEEIIAELNGMLPGFLRNFDNKVTDVSQLSLGTDESKMIVCYTTSTINNEETAEGNVDETEENDNTEQDEQRFDIVECKRRLREAYETILMYEASLNDLDCKLHRRIRMRLAGSCAELNKSKEQTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.29
4 0.25
5 0.17
6 0.15
7 0.11
8 0.09
9 0.07
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.13
15 0.14
16 0.16
17 0.16
18 0.14
19 0.15
20 0.21
21 0.23
22 0.24
23 0.32
24 0.36
25 0.37
26 0.37
27 0.38
28 0.34
29 0.37
30 0.39
31 0.31
32 0.29
33 0.29
34 0.31
35 0.31
36 0.29
37 0.26
38 0.23
39 0.32
40 0.37
41 0.43
42 0.51
43 0.59
44 0.66
45 0.74
46 0.81
47 0.83
48 0.86
49 0.88
50 0.89
51 0.85
52 0.85
53 0.8
54 0.77
55 0.71
56 0.62
57 0.56
58 0.45
59 0.43
60 0.39
61 0.37
62 0.32
63 0.28
64 0.26
65 0.23
66 0.23
67 0.2
68 0.18
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.15
79 0.18
80 0.18
81 0.19
82 0.23
83 0.26
84 0.31
85 0.33
86 0.32
87 0.35
88 0.42
89 0.42
90 0.38
91 0.34
92 0.26
93 0.34
94 0.33
95 0.29
96 0.24
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.23
101 0.15
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.15
116 0.17
117 0.21
118 0.25
119 0.29
120 0.35
121 0.42
122 0.44
123 0.44
124 0.46
125 0.45
126 0.41
127 0.38
128 0.33
129 0.25
130 0.22
131 0.2
132 0.16
133 0.16
134 0.17
135 0.18
136 0.2
137 0.25
138 0.25
139 0.27
140 0.27
141 0.27
142 0.25
143 0.25
144 0.21
145 0.18
146 0.19
147 0.23
148 0.26
149 0.24
150 0.25
151 0.26
152 0.27
153 0.33
154 0.36
155 0.33
156 0.36
157 0.43
158 0.44
159 0.44
160 0.46
161 0.4
162 0.38
163 0.42
164 0.36
165 0.35
166 0.33
167 0.33
168 0.29
169 0.28
170 0.28
171 0.24
172 0.22
173 0.18
174 0.19
175 0.17
176 0.24
177 0.24
178 0.26
179 0.3
180 0.37
181 0.44
182 0.51
183 0.57
184 0.53
185 0.58
186 0.59
187 0.53
188 0.5
189 0.42
190 0.36
191 0.28
192 0.29
193 0.23
194 0.18
195 0.17
196 0.13
197 0.12
198 0.09
199 0.1
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.07
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.13
232 0.17
233 0.2
234 0.22
235 0.24
236 0.27
237 0.29
238 0.31
239 0.31
240 0.31
241 0.29
242 0.27
243 0.3
244 0.28
245 0.26
246 0.22
247 0.18
248 0.2
249 0.22
250 0.25
251 0.23
252 0.22
253 0.26
254 0.28
255 0.33
256 0.29
257 0.31
258 0.33
259 0.37
260 0.41
261 0.39
262 0.38
263 0.33
264 0.32
265 0.29
266 0.24
267 0.2
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.17
272 0.16
273 0.16
274 0.14
275 0.11
276 0.1
277 0.12
278 0.14
279 0.18
280 0.23
281 0.29
282 0.32
283 0.38
284 0.36
285 0.34
286 0.31
287 0.28
288 0.23
289 0.16
290 0.15
291 0.11
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.07
312 0.1
313 0.13
314 0.21
315 0.22
316 0.3
317 0.34
318 0.33
319 0.34
320 0.32
321 0.29
322 0.22
323 0.24
324 0.19
325 0.2
326 0.22
327 0.21
328 0.22
329 0.22
330 0.27
331 0.26
332 0.28
333 0.31
334 0.3
335 0.31
336 0.31
337 0.3
338 0.26
339 0.26
340 0.21
341 0.13
342 0.12
343 0.11
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.09
351 0.1
352 0.12
353 0.13
354 0.16
355 0.18
356 0.25
357 0.32
358 0.38
359 0.47
360 0.5
361 0.58
362 0.63
363 0.62
364 0.59
365 0.59
366 0.61
367 0.59
368 0.64
369 0.65
370 0.6
371 0.63
372 0.64
373 0.59
374 0.51
375 0.5
376 0.41
377 0.36
378 0.32
379 0.29
380 0.25
381 0.26
382 0.26
383 0.19
384 0.19
385 0.15
386 0.15
387 0.14
388 0.1
389 0.09
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.06
405 0.06
406 0.08
407 0.1
408 0.12
409 0.14
410 0.16
411 0.19
412 0.18
413 0.21
414 0.22
415 0.22
416 0.21
417 0.2
418 0.21
419 0.18
420 0.18
421 0.14
422 0.13
423 0.12
424 0.11
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.1
433 0.12
434 0.17
435 0.17
436 0.2
437 0.22
438 0.23
439 0.24
440 0.22
441 0.21
442 0.17
443 0.17
444 0.15
445 0.13
446 0.12
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.1
451 0.13
452 0.11
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.14
457 0.18
458 0.2
459 0.17
460 0.2
461 0.18
462 0.19
463 0.21
464 0.2
465 0.24
466 0.28
467 0.37
468 0.39
469 0.46
470 0.48
471 0.52
472 0.55
473 0.53
474 0.55
475 0.52
476 0.54
477 0.52
478 0.49
479 0.44
480 0.41
481 0.35
482 0.26
483 0.21
484 0.14
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.13
491 0.15
492 0.2
493 0.26
494 0.32
495 0.4
496 0.45
497 0.54
498 0.62
499 0.69
500 0.7
501 0.68
502 0.69
503 0.65
504 0.6
505 0.55
506 0.46
507 0.41
508 0.41
509 0.39
510 0.4