Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1C2J9

Protein Details
Accession I1C2J9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-271RAATSQKKNSVRRRKPSSQENDKKVEKSEEKPKKTRKRRNNRKKQEEAVDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-186PGRRGR
223-264ATSQKKNSVRRRKPSSQENDKKVEKSEEKPKKTRKRRNNRKK
318-369KEAKKEDGVKAAKEAAEGVKEVKKEDGIKAAKEAAEGVKEVKKEDGVKAAKE
Subcellular Location(s) cyto 12, mito 11.5, mito_nucl 7.5, nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSETTVIKQTVFIANLSFKTKSKDLGNFLGAAGKVLKVFIVRQGRRSLGYGFASFSSLEEAEKAAKELSGKELDGREEDNKEISGSNQKENVDELPARDDSIKEKTKETAAKDVSTKEAPKDISTKDSSSKDQVNDEGSEPSASIFVANLPFRAGVSNLYSLFKNYNVTYAMIARQKSRNPGRRGRSKGYGFVELESVEEQQRVLKEFGTVELKGRPIHIRAATSQKKNSVRRRKPSSQENDKKVEKSEEKPKKTRKRRNNRKKQEEAVDSVKQAEEAVKEVKKEDGVSAAHTAAEAVKEVKKEDGIKAAKEATEGVKEAKKEDGVKAAKEAAEGVKEVKKEDGIKAAKEAAEGVKEVKKEDGVKAAKEAAEGVKEVKKEDGVKAAHTAAEAVKEVKKEDGIKAAKEAAEGVKEIKKEDGKDAAKAANQVVEVKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.29
4 0.29
5 0.25
6 0.31
7 0.33
8 0.35
9 0.39
10 0.44
11 0.46
12 0.5
13 0.5
14 0.44
15 0.42
16 0.41
17 0.33
18 0.27
19 0.21
20 0.15
21 0.13
22 0.12
23 0.13
24 0.1
25 0.11
26 0.18
27 0.29
28 0.3
29 0.35
30 0.41
31 0.43
32 0.44
33 0.46
34 0.39
35 0.34
36 0.36
37 0.31
38 0.27
39 0.25
40 0.24
41 0.21
42 0.19
43 0.17
44 0.13
45 0.12
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.22
59 0.23
60 0.24
61 0.25
62 0.26
63 0.25
64 0.24
65 0.25
66 0.23
67 0.21
68 0.2
69 0.19
70 0.18
71 0.24
72 0.24
73 0.27
74 0.3
75 0.3
76 0.3
77 0.32
78 0.3
79 0.26
80 0.24
81 0.21
82 0.21
83 0.2
84 0.21
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.25
89 0.31
90 0.29
91 0.3
92 0.32
93 0.38
94 0.43
95 0.43
96 0.44
97 0.4
98 0.41
99 0.42
100 0.41
101 0.38
102 0.37
103 0.35
104 0.27
105 0.29
106 0.27
107 0.27
108 0.3
109 0.28
110 0.29
111 0.31
112 0.31
113 0.33
114 0.35
115 0.36
116 0.36
117 0.39
118 0.35
119 0.34
120 0.33
121 0.3
122 0.28
123 0.26
124 0.23
125 0.18
126 0.16
127 0.14
128 0.12
129 0.09
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.1
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.14
151 0.14
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.17
159 0.18
160 0.19
161 0.2
162 0.23
163 0.25
164 0.34
165 0.43
166 0.48
167 0.52
168 0.6
169 0.66
170 0.71
171 0.76
172 0.73
173 0.72
174 0.65
175 0.64
176 0.58
177 0.54
178 0.45
179 0.37
180 0.32
181 0.23
182 0.22
183 0.15
184 0.13
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.14
200 0.15
201 0.14
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.18
206 0.18
207 0.17
208 0.19
209 0.29
210 0.34
211 0.36
212 0.37
213 0.4
214 0.47
215 0.54
216 0.63
217 0.64
218 0.67
219 0.73
220 0.8
221 0.81
222 0.81
223 0.82
224 0.82
225 0.82
226 0.82
227 0.78
228 0.76
229 0.7
230 0.63
231 0.55
232 0.52
233 0.45
234 0.42
235 0.47
236 0.5
237 0.55
238 0.62
239 0.71
240 0.74
241 0.81
242 0.86
243 0.86
244 0.88
245 0.92
246 0.94
247 0.95
248 0.96
249 0.95
250 0.93
251 0.89
252 0.86
253 0.79
254 0.73
255 0.67
256 0.58
257 0.48
258 0.4
259 0.32
260 0.23
261 0.19
262 0.15
263 0.1
264 0.1
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.16
269 0.17
270 0.17
271 0.17
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.15
276 0.16
277 0.15
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.15
290 0.17
291 0.19
292 0.26
293 0.26
294 0.26
295 0.28
296 0.29
297 0.26
298 0.24
299 0.24
300 0.17
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.21
308 0.22
309 0.22
310 0.24
311 0.3
312 0.3
313 0.3
314 0.31
315 0.31
316 0.28
317 0.25
318 0.25
319 0.17
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.18
326 0.18
327 0.2
328 0.21
329 0.23
330 0.29
331 0.28
332 0.28
333 0.3
334 0.31
335 0.28
336 0.25
337 0.25
338 0.18
339 0.16
340 0.16
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.18
345 0.18
346 0.2
347 0.22
348 0.24
349 0.31
350 0.31
351 0.32
352 0.33
353 0.34
354 0.3
355 0.27
356 0.26
357 0.18
358 0.16
359 0.15
360 0.16
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.2
366 0.22
367 0.24
368 0.29
369 0.27
370 0.29
371 0.31
372 0.31
373 0.27
374 0.24
375 0.23
376 0.16
377 0.17
378 0.15
379 0.14
380 0.15
381 0.15
382 0.16
383 0.15
384 0.17
385 0.17
386 0.19
387 0.26
388 0.26
389 0.26
390 0.28
391 0.3
392 0.27
393 0.25
394 0.25
395 0.18
396 0.17
397 0.17
398 0.19
399 0.2
400 0.21
401 0.22
402 0.28
403 0.31
404 0.32
405 0.37
406 0.43
407 0.42
408 0.44
409 0.47
410 0.44
411 0.42
412 0.42
413 0.37
414 0.31
415 0.29