Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CCB2

Protein Details
Accession I1CCB2    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-304FGNEQSTKGRKRTRASKKNKGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-304ERRKADGKHSIKTANSSRKRKTLFGNEQSTKGRKRTRASKKNKGF
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MGVEESLSLPYTPTGNSVAEASVGSAKRIIIKMLEGYNEAWDMYVDGTAYVMNQHISRLHGLKPFEVMFNRKVNDLKDYTKSMRQIEFNEETINVEKLKTVIEKFNNTTLPEVREQILETQRKDNEYFVKRHRILNNPFPIGSTVMIKNIEGKKSKTDSKYIGPFTVHNHTKNGNYVLTDLTGSLFDRNVPTSQIKLVSNDTNKTNDNKDIYEVQAIINHREIAPSKFEYLTTWVGYPGEQTWQKQSTFQDTDAIKKYWERRKADGKHSIKTANSSRKRKTLFGNEQSTKGRKRTRASKKNKGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.14
6 0.13
7 0.13
8 0.12
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.2
15 0.21
16 0.21
17 0.16
18 0.18
19 0.22
20 0.23
21 0.24
22 0.21
23 0.21
24 0.21
25 0.2
26 0.17
27 0.13
28 0.1
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.06
33 0.05
34 0.06
35 0.05
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.09
42 0.1
43 0.12
44 0.16
45 0.18
46 0.21
47 0.25
48 0.26
49 0.25
50 0.28
51 0.27
52 0.26
53 0.27
54 0.28
55 0.28
56 0.33
57 0.33
58 0.32
59 0.34
60 0.31
61 0.34
62 0.34
63 0.33
64 0.32
65 0.37
66 0.38
67 0.41
68 0.44
69 0.42
70 0.41
71 0.4
72 0.39
73 0.4
74 0.4
75 0.35
76 0.32
77 0.27
78 0.25
79 0.23
80 0.22
81 0.15
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.19
89 0.23
90 0.27
91 0.29
92 0.34
93 0.34
94 0.32
95 0.32
96 0.28
97 0.27
98 0.24
99 0.23
100 0.19
101 0.18
102 0.18
103 0.2
104 0.25
105 0.26
106 0.27
107 0.3
108 0.31
109 0.33
110 0.33
111 0.31
112 0.32
113 0.33
114 0.36
115 0.36
116 0.45
117 0.45
118 0.5
119 0.52
120 0.53
121 0.54
122 0.58
123 0.58
124 0.5
125 0.48
126 0.42
127 0.37
128 0.29
129 0.24
130 0.17
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.16
136 0.17
137 0.21
138 0.21
139 0.22
140 0.26
141 0.29
142 0.36
143 0.32
144 0.34
145 0.34
146 0.37
147 0.42
148 0.38
149 0.36
150 0.31
151 0.3
152 0.29
153 0.34
154 0.31
155 0.26
156 0.27
157 0.27
158 0.27
159 0.29
160 0.28
161 0.2
162 0.17
163 0.17
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.09
176 0.09
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.15
181 0.18
182 0.17
183 0.18
184 0.21
185 0.24
186 0.26
187 0.27
188 0.28
189 0.28
190 0.29
191 0.3
192 0.3
193 0.29
194 0.28
195 0.26
196 0.27
197 0.26
198 0.26
199 0.24
200 0.21
201 0.17
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.14
208 0.16
209 0.18
210 0.16
211 0.2
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.2
217 0.22
218 0.23
219 0.2
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.16
224 0.16
225 0.12
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.25
230 0.29
231 0.3
232 0.33
233 0.35
234 0.37
235 0.38
236 0.37
237 0.37
238 0.34
239 0.4
240 0.41
241 0.38
242 0.31
243 0.33
244 0.42
245 0.44
246 0.52
247 0.51
248 0.55
249 0.65
250 0.72
251 0.76
252 0.78
253 0.74
254 0.72
255 0.71
256 0.68
257 0.59
258 0.58
259 0.58
260 0.58
261 0.63
262 0.66
263 0.68
264 0.72
265 0.75
266 0.73
267 0.73
268 0.73
269 0.74
270 0.74
271 0.77
272 0.71
273 0.72
274 0.74
275 0.71
276 0.67
277 0.65
278 0.64
279 0.62
280 0.69
281 0.74
282 0.78
283 0.82
284 0.86