Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CJC5

Protein Details
Accession I1CJC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-269VIESMPKRIKQCIKNNRRWADYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-52GKKVRAVTVRRILRKAGLGAIEKPKKPLLSAKNIRKR
Subcellular Location(s) nucl 19, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 11.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MSSAAKVAKELEKDIGKKVRAVTVRRILRKAGLGAIEKPKKPLLSAKNIRKRLSWCMAHKDWTIDDWKRVIWSDETKINRFNSDGRTWAWIRSGESLKSHHVKMTVKHGGGSIMLWSAITYAGVGWMCKINGNMDKELYREILEDELERTIEFSIDKLGFERHQVIFQHDNDPKHTSKLLKEYLKDQSYSILEWPAQSPDLNPIENMWSLLKRRLNDYETAPKGMNELYERVTKVWYDLMKPEECQKVIESMPKRIKQCIKNNRRWADY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.48
3 0.44
4 0.45
5 0.45
6 0.46
7 0.46
8 0.49
9 0.51
10 0.53
11 0.61
12 0.64
13 0.64
14 0.58
15 0.55
16 0.55
17 0.47
18 0.41
19 0.37
20 0.33
21 0.36
22 0.44
23 0.47
24 0.43
25 0.45
26 0.44
27 0.4
28 0.4
29 0.43
30 0.42
31 0.46
32 0.55
33 0.63
34 0.69
35 0.75
36 0.75
37 0.71
38 0.67
39 0.65
40 0.64
41 0.61
42 0.57
43 0.59
44 0.6
45 0.6
46 0.56
47 0.5
48 0.42
49 0.36
50 0.37
51 0.3
52 0.3
53 0.27
54 0.26
55 0.24
56 0.25
57 0.24
58 0.21
59 0.24
60 0.25
61 0.3
62 0.34
63 0.35
64 0.39
65 0.38
66 0.34
67 0.31
68 0.31
69 0.3
70 0.28
71 0.28
72 0.24
73 0.28
74 0.28
75 0.27
76 0.26
77 0.21
78 0.21
79 0.24
80 0.26
81 0.22
82 0.23
83 0.25
84 0.27
85 0.29
86 0.28
87 0.24
88 0.26
89 0.27
90 0.27
91 0.34
92 0.35
93 0.31
94 0.31
95 0.3
96 0.26
97 0.23
98 0.21
99 0.12
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.09
118 0.14
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.15
126 0.11
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.12
148 0.16
149 0.13
150 0.17
151 0.18
152 0.22
153 0.25
154 0.26
155 0.32
156 0.32
157 0.33
158 0.32
159 0.36
160 0.32
161 0.3
162 0.31
163 0.26
164 0.26
165 0.33
166 0.38
167 0.38
168 0.39
169 0.41
170 0.47
171 0.46
172 0.43
173 0.35
174 0.32
175 0.28
176 0.28
177 0.24
178 0.17
179 0.15
180 0.15
181 0.16
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.17
187 0.19
188 0.18
189 0.17
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.14
195 0.15
196 0.17
197 0.24
198 0.27
199 0.26
200 0.31
201 0.36
202 0.37
203 0.38
204 0.42
205 0.46
206 0.44
207 0.46
208 0.41
209 0.34
210 0.33
211 0.3
212 0.26
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.22
217 0.23
218 0.23
219 0.24
220 0.21
221 0.2
222 0.23
223 0.23
224 0.21
225 0.26
226 0.3
227 0.31
228 0.32
229 0.38
230 0.38
231 0.37
232 0.36
233 0.32
234 0.31
235 0.31
236 0.39
237 0.36
238 0.39
239 0.49
240 0.53
241 0.55
242 0.59
243 0.66
244 0.67
245 0.74
246 0.75
247 0.77
248 0.81
249 0.89