Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CTZ2

Protein Details
Accession I1CTZ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-214CEMPKESKKEKKVKKSEGSTEBasic
237-256KTVKKASKVKHVRRGVKEVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-208KKEKKVKK
233-263KKLFKTVKKASKVKHVRRGVKEVAKALRKGE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.833, nucl 12.5, cyto 11, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027267  AH/BAR_dom_sf  
IPR004148  BAR_dom  
IPR046982  BIN3/RVS161-like  
IPR002415  H/ACA_rnp_Nhp2-like  
IPR029064  L30e-like  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051666  P:actin cortical patch localization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03114  BAR  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51021  BAR  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
Amino Acid Sequences MDSTRAIIASQMRLLDMIEKIYGDSAFSNPVFAEYKRALENIERESKDNLDPAYQKTVMEPLARYVAYFPEVNEAIKRRNKKSLDYDTSRSKVRKLIDKPSEDPSRLSRAEQEANMARELYENLNTILISDLPRLIDLRVPYMDPIFEAFVKSQQKFAQTGYEQLEGMRGAIPQEGGDGRVDQVLQQMRELTICEMPKESKKEKKVKKSEGSTETLRFQSPIAHPLADDKLTKKLFKTVKKASKVKHVRRGVKEVAKALRKGEKGLVIIAGDISPLDVISHMPVLCEDSNVPYIFVPSKEQLGEASSTKRPTSVTMVVLGGKNKDTKAAEDYKELYDECFAQAKDLDEKLVY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.16
4 0.14
5 0.13
6 0.12
7 0.12
8 0.14
9 0.13
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.14
17 0.17
18 0.18
19 0.17
20 0.23
21 0.2
22 0.23
23 0.24
24 0.25
25 0.24
26 0.27
27 0.33
28 0.33
29 0.41
30 0.39
31 0.39
32 0.42
33 0.43
34 0.39
35 0.37
36 0.3
37 0.27
38 0.29
39 0.3
40 0.34
41 0.32
42 0.29
43 0.27
44 0.3
45 0.27
46 0.26
47 0.23
48 0.19
49 0.23
50 0.22
51 0.21
52 0.19
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.21
61 0.22
62 0.28
63 0.35
64 0.42
65 0.42
66 0.51
67 0.53
68 0.57
69 0.64
70 0.67
71 0.69
72 0.68
73 0.69
74 0.68
75 0.67
76 0.65
77 0.57
78 0.48
79 0.44
80 0.43
81 0.47
82 0.45
83 0.52
84 0.55
85 0.6
86 0.6
87 0.63
88 0.63
89 0.54
90 0.5
91 0.44
92 0.42
93 0.37
94 0.35
95 0.32
96 0.31
97 0.33
98 0.31
99 0.32
100 0.29
101 0.3
102 0.29
103 0.25
104 0.19
105 0.17
106 0.18
107 0.14
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.09
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.13
138 0.18
139 0.19
140 0.21
141 0.21
142 0.24
143 0.24
144 0.24
145 0.25
146 0.2
147 0.24
148 0.24
149 0.23
150 0.21
151 0.19
152 0.19
153 0.13
154 0.13
155 0.09
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.1
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.14
184 0.19
185 0.25
186 0.3
187 0.34
188 0.43
189 0.53
190 0.61
191 0.7
192 0.75
193 0.79
194 0.81
195 0.8
196 0.8
197 0.75
198 0.7
199 0.63
200 0.55
201 0.48
202 0.41
203 0.34
204 0.25
205 0.2
206 0.21
207 0.19
208 0.2
209 0.19
210 0.18
211 0.17
212 0.2
213 0.22
214 0.18
215 0.18
216 0.16
217 0.22
218 0.24
219 0.26
220 0.23
221 0.3
222 0.35
223 0.42
224 0.5
225 0.53
226 0.6
227 0.68
228 0.74
229 0.7
230 0.73
231 0.76
232 0.77
233 0.76
234 0.77
235 0.77
236 0.76
237 0.8
238 0.77
239 0.73
240 0.67
241 0.63
242 0.62
243 0.58
244 0.53
245 0.49
246 0.48
247 0.42
248 0.4
249 0.38
250 0.34
251 0.29
252 0.29
253 0.26
254 0.18
255 0.17
256 0.15
257 0.11
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.13
272 0.13
273 0.14
274 0.13
275 0.14
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.14
280 0.17
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.17
285 0.2
286 0.2
287 0.2
288 0.18
289 0.19
290 0.2
291 0.18
292 0.22
293 0.23
294 0.26
295 0.26
296 0.27
297 0.25
298 0.26
299 0.31
300 0.3
301 0.28
302 0.27
303 0.29
304 0.3
305 0.32
306 0.3
307 0.25
308 0.23
309 0.25
310 0.22
311 0.27
312 0.26
313 0.27
314 0.33
315 0.39
316 0.39
317 0.41
318 0.44
319 0.4
320 0.41
321 0.37
322 0.31
323 0.24
324 0.23
325 0.2
326 0.23
327 0.2
328 0.2
329 0.22
330 0.24
331 0.27
332 0.27