Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CST4

Protein Details
Accession I1CST4    Localization Confidence High Confidence Score 25.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-178KEYDDEKRKEKKRPEHKDDYESDAcidic
191-227YDDRSKDRYRSNRSRSPRYRSSRSRSPSSRRRRDEFDHydrophilic
231-274RYRGRSRDYKKYDDDRYKRDYRQERYARDRSRDRSRNRNKRSRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-170KRKEKKRPE
196-223KDRYRSNRSRSPRYRSSRSRSPSSRRRR
257-274ARDRSRDRSRNRNKRSRS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MNSDKKTFHEIVDEIYNEAPFIKGNQPSTAFCLLFKLWTLKLTIRQLENLVEHGDSPLVKKKSVLQLASKLTCSVSYIRAIGFLYLRYVCAPAQLWDWYQYYLEDDEEVAISSGLHPTKVTVGQLIRMLIIEPKFQGTMLPRIPIPIARDLEKKLKEYDDEKRKEKKRPEHKDDYESDRRDRYDDRSRDRYDDRSKDRYRSNRSRSPRYRSSRSRSPSSRRRRDEFDDYERYRGRSRDYKKYDDDRYKRDYRQERYARDRSRDRSRNRNKRSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.25
4 0.18
5 0.18
6 0.14
7 0.09
8 0.12
9 0.17
10 0.2
11 0.23
12 0.28
13 0.31
14 0.32
15 0.37
16 0.39
17 0.33
18 0.28
19 0.3
20 0.25
21 0.23
22 0.24
23 0.22
24 0.18
25 0.19
26 0.22
27 0.22
28 0.29
29 0.35
30 0.38
31 0.35
32 0.37
33 0.37
34 0.37
35 0.35
36 0.29
37 0.23
38 0.18
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.11
43 0.13
44 0.2
45 0.2
46 0.2
47 0.21
48 0.27
49 0.35
50 0.41
51 0.42
52 0.39
53 0.45
54 0.51
55 0.52
56 0.46
57 0.37
58 0.31
59 0.27
60 0.24
61 0.19
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.1
80 0.12
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.12
111 0.13
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.1
124 0.09
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.15
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.18
136 0.2
137 0.23
138 0.3
139 0.3
140 0.3
141 0.27
142 0.27
143 0.27
144 0.29
145 0.37
146 0.39
147 0.43
148 0.48
149 0.56
150 0.61
151 0.67
152 0.72
153 0.72
154 0.73
155 0.78
156 0.81
157 0.82
158 0.82
159 0.8
160 0.75
161 0.74
162 0.72
163 0.64
164 0.58
165 0.51
166 0.46
167 0.41
168 0.39
169 0.38
170 0.4
171 0.44
172 0.49
173 0.54
174 0.56
175 0.59
176 0.6
177 0.61
178 0.6
179 0.62
180 0.61
181 0.63
182 0.65
183 0.66
184 0.71
185 0.72
186 0.72
187 0.74
188 0.75
189 0.75
190 0.79
191 0.83
192 0.83
193 0.82
194 0.82
195 0.8
196 0.82
197 0.82
198 0.82
199 0.81
200 0.79
201 0.8
202 0.79
203 0.8
204 0.81
205 0.82
206 0.84
207 0.82
208 0.82
209 0.8
210 0.78
211 0.78
212 0.76
213 0.73
214 0.72
215 0.66
216 0.68
217 0.63
218 0.58
219 0.53
220 0.47
221 0.47
222 0.46
223 0.51
224 0.55
225 0.6
226 0.65
227 0.69
228 0.76
229 0.78
230 0.79
231 0.81
232 0.77
233 0.78
234 0.78
235 0.75
236 0.76
237 0.75
238 0.72
239 0.75
240 0.77
241 0.78
242 0.79
243 0.84
244 0.82
245 0.81
246 0.83
247 0.81
248 0.83
249 0.83
250 0.82
251 0.83
252 0.86
253 0.88
254 0.89