Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1C540

Protein Details
Accession I1C540    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
914-934IDQYGKTSSGKRNRKQRDSIVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 8.5, mito 4, plas 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045967  DUF5923  
IPR010378  TRAPPC13  
Pfam View protein in Pfam  
PF19343  DUF5923  
PF06159  DUF974  
Amino Acid Sequences MSTQTSTPRSGTTAAIPQDDHLPHLLSLKVMRLSRPQFATTLPVFYESTEASPLVDGLDSLNISDLTACHPIQPSDIQIRDFGLSQMLKLPSAFGNIYLGETFSTLVSINNESPIPVHQVTTKIELQTSSQRFLLADQPPLNDLSPGANSDITVSHEIKELGVHILVCSVQYIGDDGRVFLEAQLQNVSAGPMFLERMKFEPSEHFGFESLNGRMDSEKTVFEDQFIHPQDVRQYLYMLSPHHADRISRTTNALGKLDIVWRSAMGDMGRLQTSQLTRKAPLLEDIEIQPFWVQQDAEVKVVLETPFRLGIRVTNHSNENMKLVLSAIKTKMGSVLLSGLGSRQLGELGPGQSTETELEFFPLTPGLQRVFSPSPQSFLSFSSFCFGKQMAAIFLTTNSNYYYDCPQRVPLTEDHIQPTVRRLSEQYERRRSEEHLKSLACEEKAAMTEMLSLLRQGMLPNNQQISTIISNILSSRVIESQPVSKDGQLILKEIQDLLIIIQKALILKNSDELLQSMMYHIKRVTDLQKNAEFTLGTLGLLKVISFCLFDYRFINLLNQILLTVQTIFTKDKPNSNRESIVLAPQIRLSNYKCQKTKMHDVTPSAPYSDTNVDIMACLENIFTTVKEHPQYHSSLNSLFQILIIWTHSVSREVSFPDNLNEHLELVVQETKEVFERWTGGLLLDPLLNESSTLAHLIREDSQLIDLYVKTRGLVIQSFQDFDLSSWSQLVMELKEPKADPCRQTITRFVERAQGLLEAFKNDEIFKEISEKVYSIHQHLWNDKTILKPHLLDDFKMTLLPALIEQIKYVPLPRLVIQENEQYEMVIDNMIIPGDTLMPEAIELKVDDYLRFYPKSDSGSTSVQGLFLHLHGIQTWIEDANFWYKRKTGLLDITDSGIASVHMDGLSLSIRLSGIDQYGKTSSGKRNRKQRDSIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.3
4 0.29
5 0.34
6 0.32
7 0.29
8 0.24
9 0.23
10 0.21
11 0.24
12 0.23
13 0.18
14 0.19
15 0.22
16 0.26
17 0.26
18 0.29
19 0.35
20 0.39
21 0.45
22 0.47
23 0.44
24 0.39
25 0.39
26 0.43
27 0.35
28 0.33
29 0.26
30 0.25
31 0.24
32 0.23
33 0.24
34 0.18
35 0.18
36 0.17
37 0.16
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.11
42 0.1
43 0.08
44 0.07
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.09
53 0.11
54 0.15
55 0.15
56 0.17
57 0.19
58 0.2
59 0.22
60 0.24
61 0.26
62 0.3
63 0.33
64 0.31
65 0.29
66 0.31
67 0.29
68 0.27
69 0.22
70 0.2
71 0.17
72 0.17
73 0.22
74 0.22
75 0.21
76 0.2
77 0.22
78 0.16
79 0.2
80 0.2
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.14
86 0.14
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.1
95 0.13
96 0.13
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.16
102 0.2
103 0.18
104 0.18
105 0.19
106 0.23
107 0.26
108 0.31
109 0.32
110 0.26
111 0.27
112 0.26
113 0.28
114 0.33
115 0.34
116 0.31
117 0.28
118 0.28
119 0.27
120 0.28
121 0.32
122 0.26
123 0.29
124 0.28
125 0.29
126 0.29
127 0.31
128 0.29
129 0.21
130 0.19
131 0.14
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.17
141 0.17
142 0.16
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.15
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.07
160 0.07
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.18
169 0.15
170 0.16
171 0.17
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.13
185 0.17
186 0.17
187 0.18
188 0.22
189 0.26
190 0.28
191 0.28
192 0.27
193 0.24
194 0.24
195 0.24
196 0.23
197 0.18
198 0.17
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.19
204 0.16
205 0.16
206 0.17
207 0.21
208 0.2
209 0.2
210 0.22
211 0.2
212 0.27
213 0.28
214 0.28
215 0.24
216 0.26
217 0.29
218 0.29
219 0.29
220 0.21
221 0.2
222 0.18
223 0.2
224 0.21
225 0.18
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.19
230 0.19
231 0.18
232 0.2
233 0.27
234 0.28
235 0.27
236 0.28
237 0.29
238 0.32
239 0.34
240 0.3
241 0.22
242 0.2
243 0.2
244 0.22
245 0.19
246 0.16
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.13
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.12
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.14
260 0.17
261 0.2
262 0.24
263 0.25
264 0.25
265 0.29
266 0.31
267 0.28
268 0.3
269 0.27
270 0.23
271 0.23
272 0.23
273 0.22
274 0.19
275 0.19
276 0.14
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.08
281 0.08
282 0.14
283 0.15
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.14
288 0.16
289 0.15
290 0.1
291 0.09
292 0.1
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.11
297 0.14
298 0.19
299 0.23
300 0.25
301 0.25
302 0.26
303 0.29
304 0.31
305 0.28
306 0.24
307 0.2
308 0.16
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.11
313 0.14
314 0.13
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.17
319 0.14
320 0.13
321 0.1
322 0.11
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.07
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.09
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.15
357 0.16
358 0.18
359 0.23
360 0.21
361 0.23
362 0.23
363 0.24
364 0.19
365 0.19
366 0.21
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.15
371 0.13
372 0.14
373 0.12
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.1
389 0.15
390 0.17
391 0.19
392 0.19
393 0.21
394 0.22
395 0.23
396 0.24
397 0.2
398 0.23
399 0.25
400 0.26
401 0.26
402 0.26
403 0.25
404 0.22
405 0.24
406 0.22
407 0.18
408 0.17
409 0.16
410 0.19
411 0.28
412 0.36
413 0.42
414 0.48
415 0.5
416 0.51
417 0.52
418 0.51
419 0.53
420 0.51
421 0.46
422 0.42
423 0.4
424 0.38
425 0.39
426 0.38
427 0.28
428 0.21
429 0.16
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.1
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.05
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.07
445 0.1
446 0.12
447 0.15
448 0.16
449 0.16
450 0.16
451 0.16
452 0.17
453 0.14
454 0.13
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.12
468 0.13
469 0.16
470 0.15
471 0.14
472 0.15
473 0.15
474 0.18
475 0.14
476 0.15
477 0.13
478 0.13
479 0.13
480 0.12
481 0.11
482 0.07
483 0.07
484 0.05
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.07
494 0.08
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.08
503 0.07
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.15
511 0.22
512 0.25
513 0.28
514 0.32
515 0.36
516 0.36
517 0.36
518 0.33
519 0.26
520 0.18
521 0.18
522 0.12
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.04
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.09
535 0.1
536 0.11
537 0.13
538 0.14
539 0.15
540 0.15
541 0.16
542 0.12
543 0.13
544 0.11
545 0.1
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.06
553 0.07
554 0.09
555 0.11
556 0.18
557 0.19
558 0.27
559 0.32
560 0.37
561 0.41
562 0.43
563 0.43
564 0.37
565 0.39
566 0.32
567 0.3
568 0.28
569 0.23
570 0.19
571 0.2
572 0.2
573 0.17
574 0.2
575 0.19
576 0.26
577 0.32
578 0.39
579 0.4
580 0.43
581 0.49
582 0.53
583 0.61
584 0.59
585 0.59
586 0.56
587 0.58
588 0.57
589 0.55
590 0.48
591 0.38
592 0.3
593 0.23
594 0.22
595 0.2
596 0.16
597 0.12
598 0.12
599 0.11
600 0.11
601 0.11
602 0.08
603 0.06
604 0.05
605 0.05
606 0.04
607 0.05
608 0.06
609 0.05
610 0.08
611 0.1
612 0.14
613 0.18
614 0.19
615 0.2
616 0.23
617 0.26
618 0.26
619 0.26
620 0.23
621 0.21
622 0.21
623 0.2
624 0.17
625 0.14
626 0.12
627 0.1
628 0.08
629 0.08
630 0.07
631 0.07
632 0.06
633 0.07
634 0.08
635 0.09
636 0.09
637 0.1
638 0.11
639 0.13
640 0.15
641 0.16
642 0.17
643 0.18
644 0.19
645 0.19
646 0.19
647 0.17
648 0.15
649 0.13
650 0.13
651 0.1
652 0.11
653 0.13
654 0.1
655 0.1
656 0.1
657 0.11
658 0.12
659 0.13
660 0.11
661 0.09
662 0.12
663 0.12
664 0.13
665 0.13
666 0.11
667 0.11
668 0.11
669 0.11
670 0.09
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.08
680 0.07
681 0.07
682 0.08
683 0.1
684 0.12
685 0.12
686 0.13
687 0.12
688 0.12
689 0.12
690 0.12
691 0.12
692 0.1
693 0.1
694 0.11
695 0.11
696 0.1
697 0.1
698 0.11
699 0.12
700 0.13
701 0.13
702 0.17
703 0.18
704 0.19
705 0.19
706 0.18
707 0.16
708 0.15
709 0.19
710 0.14
711 0.14
712 0.13
713 0.13
714 0.12
715 0.13
716 0.15
717 0.11
718 0.15
719 0.19
720 0.19
721 0.23
722 0.23
723 0.26
724 0.32
725 0.37
726 0.35
727 0.37
728 0.44
729 0.45
730 0.48
731 0.52
732 0.53
733 0.54
734 0.53
735 0.48
736 0.48
737 0.44
738 0.41
739 0.33
740 0.27
741 0.19
742 0.2
743 0.2
744 0.14
745 0.14
746 0.15
747 0.15
748 0.13
749 0.14
750 0.15
751 0.14
752 0.14
753 0.18
754 0.18
755 0.19
756 0.2
757 0.2
758 0.17
759 0.23
760 0.24
761 0.24
762 0.3
763 0.32
764 0.36
765 0.41
766 0.43
767 0.4
768 0.4
769 0.38
770 0.37
771 0.37
772 0.36
773 0.33
774 0.32
775 0.3
776 0.37
777 0.36
778 0.32
779 0.32
780 0.3
781 0.27
782 0.26
783 0.24
784 0.15
785 0.14
786 0.14
787 0.09
788 0.11
789 0.12
790 0.12
791 0.12
792 0.13
793 0.14
794 0.14
795 0.16
796 0.16
797 0.17
798 0.19
799 0.21
800 0.26
801 0.27
802 0.3
803 0.31
804 0.34
805 0.34
806 0.34
807 0.31
808 0.25
809 0.23
810 0.2
811 0.17
812 0.1
813 0.08
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.05
819 0.05
820 0.06
821 0.06
822 0.06
823 0.06
824 0.06
825 0.07
826 0.08
827 0.07
828 0.08
829 0.08
830 0.08
831 0.12
832 0.13
833 0.13
834 0.16
835 0.2
836 0.24
837 0.25
838 0.25
839 0.26
840 0.3
841 0.35
842 0.34
843 0.34
844 0.33
845 0.36
846 0.35
847 0.33
848 0.3
849 0.26
850 0.22
851 0.2
852 0.16
853 0.13
854 0.15
855 0.11
856 0.12
857 0.11
858 0.13
859 0.12
860 0.11
861 0.12
862 0.11
863 0.11
864 0.11
865 0.13
866 0.2
867 0.25
868 0.25
869 0.27
870 0.28
871 0.32
872 0.36
873 0.38
874 0.36
875 0.4
876 0.44
877 0.45
878 0.44
879 0.43
880 0.38
881 0.34
882 0.26
883 0.17
884 0.13
885 0.09
886 0.08
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.08
892 0.09
893 0.08
894 0.08
895 0.07
896 0.08
897 0.08
898 0.1
899 0.1
900 0.13
901 0.17
902 0.17
903 0.2
904 0.22
905 0.24
906 0.25
907 0.3
908 0.36
909 0.43
910 0.53
911 0.59
912 0.68
913 0.77
914 0.85