FuNGI

I1CF80

Protein Details

Accession

I1CF80

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
558-588	QEQKRQKIESDKPKNARSKRFLKNREAKVVE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
567-582	SDKPKNARSKRFLKNR

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007109 Brix IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR039770 Rpf2 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0019843 F:rRNA binding GO:0000470 P:maturation of LSU-rRNA GO:0000027 P:ribosomal large subunit assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04427 Brix PF13041 PPR_2 PF13812 PPR_3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50833 BRIX PS51375 PPR

Amino Acid Sequences

MFEDTVIQLDPWEAYNQKKKVDASQLTVQDYVEIAIYVKRHCRSYNTAVSHLQTILRDINTQMQFNPELNQAFLRVCNMLMHFYIRSKNLKNAKLVFDGLMVSGRWEGYLEEHSVSVTTILNGIQTLGTRADAYQIVNRLLQHKQMPAHERVYVTLIYTLHRFGDIKGCRYYFAQMKQQGLPVSESLYRAMIQACIDANDSQEILNLFNEMKKQNVEPSIATYTMVLKALNNEKDPNKKNKKLMDQIFEDLMASGADLNVSVFTAMGWDPLQALEEQKRLEVPLRTRDYNACLSHLLKMNRSEEAVNLYRNMAQTGTEMDRFTYGIVMDALLKDDGQSPKVVYDIYDEMIHHGIKPDNVIYTTLLSACGKEKNVDRAISYMEEMATFGLKPNIHNCNSFLTALSMSSKTFYSIRKMRNIWLLMRHIGIQADTRSYNIYLSACYNIMRLERARGREYYQEPQEDDMGLPKMGPCRYMIQSYRAMKEEANPLAQPDFATYTILIKSLAYTGYTRLAMQIYEDAKMDRVKLNVSAYNEIMRGLERSGKMSDIMSICLSQKQEQKRQKIESDKPKNARSKRFLKNREAKVVENPKNTLIIKGSTTSQIINDALKDLYALKRPNAVHFSKKNEIKPFEDEPKLEFFSTKNDCALMVVGTHSKKRPHNLVFIRMFNHQLLDMYEFGIEKAECMGSIPGPKCSLGLKPLMIFNGEKFDSDSTYKHLKNYFLDFFNGEQTTAINLAGLEHVISITATPDDRILFRTYSVQMKKSGLKTYFSAQARHVVSGCQDSQGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.34
3	0.38
4	0.41
5	0.46
6	0.47
7	0.51
8	0.59
9	0.56
10	0.54
11	0.58
12	0.59
13	0.56
14	0.54
15	0.45
16	0.35
17	0.3
18	0.24
19	0.15
20	0.1
21	0.08
22	0.1
23	0.12
24	0.15
25	0.23
26	0.26
27	0.3
28	0.33
29	0.39
30	0.46
31	0.53
32	0.59
33	0.57
34	0.59
35	0.58
36	0.57
37	0.53
38	0.45
39	0.38
40	0.29
41	0.26
42	0.25
43	0.23
44	0.22
45	0.21
46	0.29
47	0.29
48	0.3
49	0.27
50	0.28
51	0.29
52	0.28
53	0.3
54	0.25
55	0.23
56	0.23
57	0.23
58	0.2
59	0.2
60	0.19
61	0.19
62	0.15
63	0.14
64	0.16
65	0.16
66	0.17
67	0.17
68	0.19
69	0.19
70	0.21
71	0.26
72	0.28
73	0.34
74	0.35
75	0.44
76	0.5
77	0.53
78	0.58
79	0.59
80	0.59
81	0.56
82	0.53
83	0.45
84	0.37
85	0.31
86	0.24
87	0.2
88	0.14
89	0.12
90	0.11
91	0.1
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.1
96	0.13
97	0.14
98	0.14
99	0.14
100	0.14
101	0.14
102	0.13
103	0.12
104	0.09
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.08
109	0.07
110	0.08
111	0.07
112	0.07
113	0.09
114	0.09
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.12
119	0.12
120	0.14
121	0.16
122	0.19
123	0.2
124	0.21
125	0.23
126	0.24
127	0.24
128	0.28
129	0.28
130	0.3
131	0.32
132	0.38
133	0.42
134	0.44
135	0.45
136	0.42
137	0.39
138	0.35
139	0.34
140	0.27
141	0.21
142	0.2
143	0.17
144	0.16
145	0.16
146	0.16
147	0.13
148	0.15
149	0.14
150	0.12
151	0.22
152	0.24
153	0.27
154	0.32
155	0.32
156	0.31
157	0.32
158	0.37
159	0.34
160	0.36
161	0.41
162	0.4
163	0.44
164	0.44
165	0.46
166	0.43
167	0.37
168	0.33
169	0.24
170	0.23
171	0.21
172	0.19
173	0.17
174	0.16
175	0.14
176	0.14
177	0.14
178	0.12
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.11
183	0.12
184	0.11
185	0.12
186	0.11
187	0.11
188	0.09
189	0.11
190	0.1
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.14
197	0.13
198	0.15
199	0.16
200	0.17
201	0.21
202	0.24
203	0.25
204	0.22
205	0.26
206	0.26
207	0.25
208	0.23
209	0.18
210	0.17
211	0.16
212	0.16
213	0.11
214	0.09
215	0.14
216	0.21
217	0.23
218	0.24
219	0.27
220	0.32
221	0.42
222	0.48
223	0.54
224	0.57
225	0.62
226	0.67
227	0.71
228	0.76
229	0.76
230	0.76
231	0.72
232	0.66
233	0.6
234	0.53
235	0.45
236	0.35
237	0.25
238	0.18
239	0.11
240	0.07
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.06
260	0.09
261	0.11
262	0.13
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.14
267	0.18
268	0.21
269	0.22
270	0.29
271	0.34
272	0.35
273	0.37
274	0.38
275	0.38
276	0.4
277	0.36
278	0.28
279	0.25
280	0.25
281	0.27
282	0.31
283	0.28
284	0.24
285	0.28
286	0.28
287	0.26
288	0.27
289	0.23
290	0.18
291	0.22
292	0.21
293	0.18
294	0.17
295	0.17
296	0.17
297	0.17
298	0.17
299	0.11
300	0.09
301	0.09
302	0.12
303	0.13
304	0.13
305	0.12
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.12
310	0.09
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.11
329	0.07
330	0.09
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.1
335	0.11
336	0.13
337	0.12
338	0.09
339	0.1
340	0.1
341	0.09
342	0.11
343	0.1
344	0.09
345	0.1
346	0.1
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.1
357	0.12
358	0.15
359	0.21
360	0.24
361	0.24
362	0.23
363	0.22
364	0.23
365	0.21
366	0.18
367	0.12
368	0.09
369	0.08
370	0.07
371	0.06
372	0.05
373	0.04
374	0.05
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.13
379	0.19
380	0.2
381	0.21
382	0.22
383	0.22
384	0.23
385	0.23
386	0.18
387	0.14
388	0.12
389	0.12
390	0.12
391	0.09
392	0.08
393	0.09
394	0.08
395	0.09
396	0.11
397	0.12
398	0.18
399	0.24
400	0.29
401	0.35
402	0.36
403	0.38
404	0.42
405	0.43
406	0.38
407	0.36
408	0.34
409	0.28
410	0.27
411	0.25
412	0.18
413	0.16
414	0.15
415	0.12
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.1
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.09
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.11
434	0.1
435	0.16
436	0.19
437	0.23
438	0.25
439	0.25
440	0.27
441	0.32
442	0.36
443	0.36
444	0.37
445	0.35
446	0.33
447	0.33
448	0.31
449	0.24
450	0.2
451	0.16
452	0.13
453	0.1
454	0.1
455	0.09
456	0.13
457	0.13
458	0.13
459	0.12
460	0.16
461	0.18
462	0.24
463	0.25
464	0.25
465	0.33
466	0.36
467	0.36
468	0.33
469	0.32
470	0.27
471	0.29
472	0.31
473	0.25
474	0.23
475	0.2
476	0.2
477	0.19
478	0.19
479	0.16
480	0.1
481	0.11
482	0.09
483	0.1
484	0.09
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.09
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.08
493	0.07
494	0.07
495	0.09
496	0.11
497	0.11
498	0.11
499	0.11
500	0.11
501	0.1
502	0.1
503	0.14
504	0.12
505	0.13
506	0.13
507	0.12
508	0.14
509	0.15
510	0.16
511	0.13
512	0.13
513	0.14
514	0.16
515	0.19
516	0.21
517	0.23
518	0.23
519	0.22
520	0.22
521	0.21
522	0.19
523	0.16
524	0.13
525	0.11
526	0.1
527	0.14
528	0.13
529	0.15
530	0.16
531	0.16
532	0.16
533	0.15
534	0.18
535	0.14
536	0.15
537	0.13
538	0.14
539	0.14
540	0.16
541	0.18
542	0.18
543	0.24
544	0.32
545	0.41
546	0.48
547	0.57
548	0.62
549	0.67
550	0.7
551	0.73
552	0.75
553	0.76
554	0.78
555	0.78
556	0.77
557	0.79
558	0.81
559	0.79
560	0.79
561	0.76
562	0.76
563	0.77
564	0.81
565	0.81
566	0.82
567	0.84
568	0.81
569	0.83
570	0.76
571	0.68
572	0.67
573	0.7
574	0.66
575	0.6
576	0.55
577	0.46
578	0.47
579	0.45
580	0.37
581	0.29
582	0.23
583	0.21
584	0.2
585	0.21
586	0.18
587	0.19
588	0.17
589	0.15
590	0.16
591	0.15
592	0.15
593	0.14
594	0.13
595	0.12
596	0.11
597	0.11
598	0.1
599	0.13
600	0.19
601	0.2
602	0.2
603	0.27
604	0.29
605	0.34
606	0.39
607	0.4
608	0.43
609	0.47
610	0.54
611	0.56
612	0.62
613	0.63
614	0.65
615	0.65
616	0.6
617	0.6
618	0.59
619	0.57
620	0.55
621	0.49
622	0.43
623	0.43
624	0.41
625	0.35
626	0.29
627	0.22
628	0.27
629	0.31
630	0.3
631	0.26
632	0.24
633	0.23
634	0.23
635	0.23
636	0.15
637	0.1
638	0.1
639	0.15
640	0.17
641	0.21
642	0.25
643	0.31
644	0.37
645	0.44
646	0.52
647	0.52
648	0.61
649	0.63
650	0.69
651	0.67
652	0.65
653	0.6
654	0.52
655	0.49
656	0.39
657	0.34
658	0.24
659	0.19
660	0.17
661	0.17
662	0.15
663	0.13
664	0.13
665	0.12
666	0.12
667	0.13
668	0.11
669	0.09
670	0.1
671	0.1
672	0.09
673	0.11
674	0.12
675	0.11
676	0.19
677	0.2
678	0.22
679	0.23
680	0.24
681	0.23
682	0.24
683	0.25
684	0.22
685	0.25
686	0.25
687	0.25
688	0.27
689	0.27
690	0.27
691	0.25
692	0.22
693	0.24
694	0.22
695	0.21
696	0.2
697	0.21
698	0.22
699	0.24
700	0.24
701	0.23
702	0.31
703	0.33
704	0.36
705	0.39
706	0.4
707	0.43
708	0.49
709	0.49
710	0.42
711	0.43
712	0.39
713	0.37
714	0.38
715	0.33
716	0.26
717	0.2
718	0.18
719	0.17
720	0.16
721	0.15
722	0.09
723	0.08
724	0.09
725	0.09
726	0.08
727	0.07
728	0.06
729	0.06
730	0.06
731	0.06
732	0.05
733	0.06
734	0.08
735	0.08
736	0.08
737	0.1
738	0.12
739	0.13
740	0.16
741	0.19
742	0.18
743	0.19
744	0.24
745	0.26
746	0.34
747	0.39
748	0.39
749	0.4
750	0.45
751	0.51
752	0.51
753	0.56
754	0.5
755	0.48
756	0.48
757	0.48
758	0.52
759	0.47
760	0.45
761	0.38
762	0.43
763	0.41
764	0.41
765	0.37
766	0.3
767	0.3
768	0.33
769	0.32

I1CF80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer