Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CTD9

Protein Details
Accession I1CTD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-126SYTNQKKRLKWCRDKTSWTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-53KEEKNIKARNRG
87-101RRLLRKIGFKSGIKK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 12.999, cyto_nucl 10.833, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MPKKVSNDKREAVKSGIRSGRTTMDISRTTGVSKWTINRIRKEEKNIKARNRGGRPVVLRQGLLRTDSDAQLFLRSLGYSISKRSVRRLLRKIGFKSGIKKYKPFISYTNQKKRLKWCRDKTSWTVEDWKSVIFSDETKINVWGADGIRYYWKQVDQPWRSFHVNQTMKHGGGSVMLWGCITSRGPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.54
3 0.54
4 0.47
5 0.44
6 0.43
7 0.42
8 0.39
9 0.37
10 0.31
11 0.31
12 0.31
13 0.31
14 0.3
15 0.26
16 0.25
17 0.24
18 0.24
19 0.2
20 0.22
21 0.23
22 0.31
23 0.39
24 0.45
25 0.51
26 0.56
27 0.63
28 0.65
29 0.72
30 0.72
31 0.73
32 0.76
33 0.77
34 0.77
35 0.78
36 0.79
37 0.79
38 0.75
39 0.73
40 0.66
41 0.63
42 0.59
43 0.56
44 0.54
45 0.46
46 0.4
47 0.34
48 0.34
49 0.28
50 0.26
51 0.19
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.1
66 0.09
67 0.11
68 0.16
69 0.2
70 0.21
71 0.25
72 0.33
73 0.38
74 0.47
75 0.52
76 0.55
77 0.57
78 0.64
79 0.62
80 0.59
81 0.56
82 0.49
83 0.5
84 0.5
85 0.52
86 0.46
87 0.47
88 0.43
89 0.45
90 0.45
91 0.41
92 0.36
93 0.35
94 0.43
95 0.51
96 0.59
97 0.62
98 0.64
99 0.66
100 0.72
101 0.75
102 0.77
103 0.77
104 0.76
105 0.77
106 0.8
107 0.82
108 0.77
109 0.75
110 0.66
111 0.58
112 0.55
113 0.46
114 0.42
115 0.36
116 0.31
117 0.22
118 0.2
119 0.19
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.13
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.17
136 0.17
137 0.19
138 0.19
139 0.21
140 0.22
141 0.29
142 0.4
143 0.42
144 0.48
145 0.5
146 0.53
147 0.56
148 0.54
149 0.52
150 0.53
151 0.52
152 0.47
153 0.51
154 0.5
155 0.45
156 0.43
157 0.38
158 0.27
159 0.22
160 0.21
161 0.17
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.12
167 0.13