Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1BXD3

Protein Details
Accession I1BXD3    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-125IARSNSPHKVPRKRSTKKSAKKQKSTSTSSQHydrophilic
136-158ALDVVEKKRRKRHSKKVEHSSVVBasic
235-261QVKSKEYSIKERKQKEEEKIKKDPVKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-118SPHKVPRKRSTKKSAKKQK
142-151KKRRKRHSKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTITTTEMKTTPVKLVMNEPINKVFIGNLPFKIKKESLVTFAETCGKILETIVIKKYRRPFVYGFITFETEQEAKRAAKELNKKELEGREVHVEIARSNSPHKVPRKRSTKKSAKKQKSTSTSSQEESTESNQESALDVVEKKRRKRHSKKVEHSSVVIFIANLPFATNEQELKELFIDYKVVSVHVVRTKNGRSRGYGFVEFENEEETKKVLENIKDAVLEDRFIYIKPSLASQVKSKEYSIKERKQKEEEKIKKDPVKNDSETFKNAVKKDNTMKDDVEKDKIKQVEQEKEGKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.34
3 0.39
4 0.43
5 0.44
6 0.44
7 0.41
8 0.4
9 0.38
10 0.32
11 0.25
12 0.21
13 0.23
14 0.23
15 0.25
16 0.31
17 0.34
18 0.35
19 0.41
20 0.37
21 0.37
22 0.41
23 0.39
24 0.37
25 0.38
26 0.4
27 0.34
28 0.35
29 0.36
30 0.29
31 0.26
32 0.22
33 0.19
34 0.15
35 0.14
36 0.17
37 0.15
38 0.18
39 0.24
40 0.3
41 0.3
42 0.37
43 0.45
44 0.49
45 0.48
46 0.5
47 0.47
48 0.48
49 0.57
50 0.53
51 0.47
52 0.4
53 0.41
54 0.36
55 0.33
56 0.29
57 0.21
58 0.19
59 0.17
60 0.19
61 0.16
62 0.17
63 0.2
64 0.18
65 0.25
66 0.35
67 0.41
68 0.48
69 0.49
70 0.49
71 0.51
72 0.52
73 0.48
74 0.4
75 0.35
76 0.3
77 0.29
78 0.28
79 0.24
80 0.2
81 0.17
82 0.18
83 0.17
84 0.13
85 0.15
86 0.18
87 0.2
88 0.27
89 0.37
90 0.43
91 0.51
92 0.6
93 0.7
94 0.75
95 0.81
96 0.85
97 0.87
98 0.86
99 0.88
100 0.9
101 0.89
102 0.9
103 0.89
104 0.87
105 0.84
106 0.81
107 0.77
108 0.73
109 0.66
110 0.57
111 0.5
112 0.41
113 0.34
114 0.29
115 0.24
116 0.19
117 0.16
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.1
127 0.17
128 0.22
129 0.27
130 0.35
131 0.45
132 0.55
133 0.65
134 0.73
135 0.77
136 0.84
137 0.89
138 0.91
139 0.88
140 0.79
141 0.69
142 0.59
143 0.48
144 0.37
145 0.27
146 0.17
147 0.1
148 0.08
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.12
173 0.16
174 0.18
175 0.18
176 0.23
177 0.28
178 0.34
179 0.41
180 0.39
181 0.38
182 0.41
183 0.46
184 0.46
185 0.43
186 0.38
187 0.32
188 0.32
189 0.28
190 0.24
191 0.2
192 0.15
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.14
199 0.16
200 0.18
201 0.2
202 0.21
203 0.23
204 0.22
205 0.23
206 0.22
207 0.17
208 0.16
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.14
214 0.11
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.18
219 0.21
220 0.24
221 0.26
222 0.33
223 0.35
224 0.36
225 0.36
226 0.38
227 0.4
228 0.49
229 0.54
230 0.56
231 0.62
232 0.68
233 0.75
234 0.77
235 0.8
236 0.8
237 0.81
238 0.81
239 0.8
240 0.81
241 0.82
242 0.81
243 0.8
244 0.78
245 0.74
246 0.73
247 0.69
248 0.66
249 0.62
250 0.58
251 0.55
252 0.51
253 0.49
254 0.47
255 0.44
256 0.48
257 0.45
258 0.49
259 0.55
260 0.6
261 0.59
262 0.56
263 0.57
264 0.55
265 0.59
266 0.56
267 0.54
268 0.49
269 0.47
270 0.51
271 0.51
272 0.47
273 0.46
274 0.51
275 0.53
276 0.54