Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CT05

Protein Details
Accession I1CT05    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-76SKLNKEASKDEKKSRRPAKGERPTKDGRPRRGRQFDRHSGTBasic
179-198KETKTVSKKTEKSRKEKVIVHydrophilic
202-234QRFQEKPRNDFRKNDRRGNRNNNRKSNKTNIAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-68LNKEASKDEKKSRRPAKGERPTKDGRPRRGR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSTYSKNLFDVLAENDNTPVKVEAPAPVVVDKKNVSKLNKEASKDEKKSRRPAKGERPTKDGRPRRGRQFDRHSGTGIVDSEKKVNQGWGKPGKSEAESAKDTLNPADPDAPEQDAPATPAEPEEVVKTLDEYLAEKASKALNVALPEARKANDADESAFAGAVVHQKKEIEEFFVSTKETKTVSKKTEKSRKEKVIVDIEQRFQEKPRNDFRKNDRRGNRNNNRKSNKTNIAAVNLQDAAAFPSLGASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.24
4 0.23
5 0.21
6 0.17
7 0.13
8 0.14
9 0.15
10 0.16
11 0.18
12 0.19
13 0.19
14 0.21
15 0.23
16 0.21
17 0.25
18 0.24
19 0.26
20 0.33
21 0.38
22 0.39
23 0.43
24 0.49
25 0.55
26 0.59
27 0.57
28 0.55
29 0.58
30 0.65
31 0.65
32 0.68
33 0.68
34 0.7
35 0.78
36 0.81
37 0.81
38 0.79
39 0.83
40 0.84
41 0.85
42 0.87
43 0.8
44 0.79
45 0.74
46 0.75
47 0.75
48 0.73
49 0.72
50 0.73
51 0.77
52 0.8
53 0.85
54 0.84
55 0.83
56 0.84
57 0.83
58 0.79
59 0.73
60 0.64
61 0.54
62 0.47
63 0.39
64 0.29
65 0.22
66 0.17
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.15
72 0.19
73 0.21
74 0.22
75 0.3
76 0.36
77 0.37
78 0.36
79 0.38
80 0.35
81 0.32
82 0.33
83 0.26
84 0.23
85 0.23
86 0.23
87 0.22
88 0.2
89 0.2
90 0.17
91 0.18
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.1
148 0.07
149 0.07
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.17
157 0.17
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.16
165 0.16
166 0.14
167 0.15
168 0.18
169 0.24
170 0.31
171 0.38
172 0.47
173 0.53
174 0.62
175 0.71
176 0.75
177 0.77
178 0.8
179 0.81
180 0.78
181 0.76
182 0.73
183 0.72
184 0.67
185 0.67
186 0.61
187 0.54
188 0.51
189 0.48
190 0.41
191 0.35
192 0.39
193 0.37
194 0.4
195 0.48
196 0.54
197 0.57
198 0.65
199 0.73
200 0.75
201 0.77
202 0.8
203 0.79
204 0.79
205 0.85
206 0.87
207 0.87
208 0.88
209 0.9
210 0.91
211 0.9
212 0.89
213 0.86
214 0.84
215 0.83
216 0.76
217 0.74
218 0.66
219 0.63
220 0.58
221 0.51
222 0.44
223 0.35
224 0.3
225 0.22
226 0.19
227 0.15
228 0.13
229 0.12
230 0.08