Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CCR9

Protein Details
Accession I1CCR9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-45SDDSEDKPSRRNGRRKIKIEYIEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-37RRNGRRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.333, cyto 5.5, cyto_pero 3.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
Amino Acid Sequences MLPDGLNIKPQKLNENMEPEDSDDSEDKPSRRNGRRKIKIEYIEDKNRRHITFSKLVSETGLVYTFTTTKLQPIVTKPEGKNLIQACLNTPDPEAATTDDTTTTTTTTAAAAAAVEKDTTTAKIAGEKKTEEPIATSYRQDSTTKREANPLSPQPVNHTTTSPQTNPRQPRKYPQYQQMPMPYNQRYLGYNGNLPPSNYPPYGQPPFYHQSYPGNTNNPSNYWQQQPPTSPAERPFQPQQQQQGEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.5
3 0.48
4 0.47
5 0.46
6 0.41
7 0.37
8 0.31
9 0.28
10 0.21
11 0.2
12 0.24
13 0.28
14 0.27
15 0.29
16 0.38
17 0.45
18 0.54
19 0.63
20 0.67
21 0.73
22 0.83
23 0.84
24 0.84
25 0.83
26 0.81
27 0.79
28 0.77
29 0.75
30 0.75
31 0.75
32 0.69
33 0.68
34 0.68
35 0.6
36 0.57
37 0.53
38 0.5
39 0.51
40 0.51
41 0.49
42 0.43
43 0.42
44 0.38
45 0.33
46 0.26
47 0.19
48 0.16
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.12
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.17
60 0.2
61 0.27
62 0.3
63 0.38
64 0.36
65 0.42
66 0.45
67 0.41
68 0.44
69 0.36
70 0.35
71 0.28
72 0.28
73 0.22
74 0.23
75 0.23
76 0.18
77 0.17
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.13
111 0.17
112 0.19
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.24
117 0.25
118 0.18
119 0.16
120 0.17
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.19
127 0.2
128 0.19
129 0.22
130 0.3
131 0.33
132 0.32
133 0.38
134 0.37
135 0.4
136 0.45
137 0.42
138 0.38
139 0.35
140 0.35
141 0.34
142 0.38
143 0.36
144 0.3
145 0.27
146 0.24
147 0.28
148 0.33
149 0.29
150 0.31
151 0.35
152 0.42
153 0.51
154 0.59
155 0.62
156 0.61
157 0.69
158 0.72
159 0.76
160 0.75
161 0.75
162 0.75
163 0.71
164 0.73
165 0.71
166 0.66
167 0.59
168 0.58
169 0.51
170 0.43
171 0.41
172 0.37
173 0.29
174 0.28
175 0.31
176 0.25
177 0.28
178 0.27
179 0.31
180 0.3
181 0.3
182 0.29
183 0.28
184 0.31
185 0.27
186 0.26
187 0.25
188 0.32
189 0.37
190 0.35
191 0.32
192 0.34
193 0.39
194 0.41
195 0.38
196 0.33
197 0.35
198 0.38
199 0.44
200 0.42
201 0.42
202 0.42
203 0.45
204 0.46
205 0.41
206 0.39
207 0.39
208 0.38
209 0.39
210 0.42
211 0.42
212 0.45
213 0.47
214 0.49
215 0.49
216 0.49
217 0.47
218 0.46
219 0.48
220 0.46
221 0.48
222 0.51
223 0.54
224 0.59
225 0.61
226 0.66