Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CIN5

Protein Details
Accession I1CIN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-48DPEKNIPLKKTNRTSNRPVSQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
158-169KRRKVVGATKRK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 11.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
Amino Acid Sequences MKPKDAAKAANVNYNTARKWKQAYNNDPEKNIPLKKTNRTSNRPVSQLNGAHKEHLIKFFDEDVSATIQDATEDLIKSFAGLEIKKSRVAEFMKEECNLSLKVSGFDINMRRSRGWSAKGSAAIVETPSTKANSQTVVGAISAFGVVNLTMRESGNIKRRKVVGATKRKAPEDRISVPKGTTSGHYTQFISDTMDIMDEFPEMRGFHIIMDNAPIHVPSIIDPVIIRRGYIPVYLPPYSPELNPIEQFWAVLKSKVKRTKLSDIETLRSRIIEASEAIPVEHLQNFIQHSVNQFGNCLNKNPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.42
3 0.41
4 0.43
5 0.4
6 0.46
7 0.5
8 0.55
9 0.61
10 0.69
11 0.71
12 0.77
13 0.75
14 0.71
15 0.66
16 0.62
17 0.59
18 0.54
19 0.49
20 0.48
21 0.53
22 0.61
23 0.67
24 0.72
25 0.74
26 0.76
27 0.81
28 0.82
29 0.8
30 0.75
31 0.68
32 0.62
33 0.59
34 0.57
35 0.55
36 0.52
37 0.46
38 0.42
39 0.42
40 0.43
41 0.39
42 0.39
43 0.34
44 0.28
45 0.29
46 0.29
47 0.28
48 0.23
49 0.2
50 0.15
51 0.15
52 0.14
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.16
70 0.21
71 0.23
72 0.26
73 0.26
74 0.25
75 0.28
76 0.3
77 0.3
78 0.31
79 0.33
80 0.33
81 0.33
82 0.33
83 0.27
84 0.27
85 0.23
86 0.17
87 0.16
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.12
93 0.16
94 0.19
95 0.21
96 0.24
97 0.26
98 0.26
99 0.26
100 0.31
101 0.32
102 0.33
103 0.31
104 0.31
105 0.31
106 0.32
107 0.3
108 0.25
109 0.2
110 0.16
111 0.12
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.13
142 0.21
143 0.27
144 0.28
145 0.31
146 0.32
147 0.34
148 0.36
149 0.4
150 0.42
151 0.47
152 0.49
153 0.53
154 0.55
155 0.56
156 0.54
157 0.5
158 0.47
159 0.43
160 0.45
161 0.44
162 0.43
163 0.42
164 0.39
165 0.35
166 0.29
167 0.22
168 0.18
169 0.17
170 0.18
171 0.2
172 0.21
173 0.21
174 0.21
175 0.21
176 0.19
177 0.16
178 0.13
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.13
215 0.15
216 0.16
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.21
221 0.22
222 0.22
223 0.21
224 0.24
225 0.25
226 0.23
227 0.23
228 0.22
229 0.24
230 0.25
231 0.24
232 0.23
233 0.21
234 0.22
235 0.18
236 0.2
237 0.18
238 0.21
239 0.26
240 0.29
241 0.39
242 0.48
243 0.53
244 0.55
245 0.62
246 0.68
247 0.71
248 0.7
249 0.69
250 0.65
251 0.66
252 0.63
253 0.58
254 0.48
255 0.39
256 0.34
257 0.27
258 0.23
259 0.19
260 0.16
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.12
271 0.15
272 0.17
273 0.19
274 0.21
275 0.2
276 0.22
277 0.25
278 0.28
279 0.24
280 0.23
281 0.25
282 0.31
283 0.31