Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1C6A5

Protein Details
Accession I1C6A5    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-89VEETVQPKEKKKKRSLSTYEQDESHydrophilic
183-218VSKAVFKEKKEQNEKKRTNKMKAKKKMQQLQRKLDWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-79EKKKKR
189-208KEKKEQNEKKRTNKMKAKKK
280-283KRKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
Amino Acid Sequences MSTTRPSFASDPRMKLNEQTGKWFYVGEDNVSYEYDEKVGAWFPMLSKYDEQLMQAQASVYAIDGVEETVQPKEKKKKRSLSTYEQDESQKKPKHERITSVYITGLPQDVTADELKTTFSKCGVIMEDLETGEPKIKIYKDENNVPKGDALVSYFKEESVPLAIELLDEAELRPGKSATKMTVSKAVFKEKKEQNEKKRTNKMKAKKKMQQLQRKLDWVDDESGKRQEKFAKIVILKNMYTQEELDEDPTLLLELKEDVRDECEKLGEVTNVILYDIQRKRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.51
3 0.55
4 0.53
5 0.47
6 0.51
7 0.47
8 0.46
9 0.45
10 0.4
11 0.31
12 0.3
13 0.29
14 0.24
15 0.22
16 0.22
17 0.22
18 0.22
19 0.22
20 0.15
21 0.14
22 0.12
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.16
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.21
36 0.23
37 0.23
38 0.24
39 0.22
40 0.22
41 0.19
42 0.18
43 0.17
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.07
48 0.06
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.07
56 0.08
57 0.14
58 0.16
59 0.24
60 0.35
61 0.41
62 0.52
63 0.61
64 0.69
65 0.72
66 0.81
67 0.82
68 0.81
69 0.83
70 0.8
71 0.72
72 0.64
73 0.61
74 0.53
75 0.49
76 0.49
77 0.45
78 0.41
79 0.5
80 0.55
81 0.6
82 0.61
83 0.64
84 0.61
85 0.63
86 0.61
87 0.52
88 0.44
89 0.34
90 0.3
91 0.23
92 0.16
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.09
123 0.1
124 0.13
125 0.17
126 0.25
127 0.27
128 0.36
129 0.4
130 0.4
131 0.4
132 0.37
133 0.33
134 0.26
135 0.22
136 0.14
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.06
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.12
164 0.14
165 0.13
166 0.2
167 0.21
168 0.23
169 0.3
170 0.3
171 0.34
172 0.35
173 0.44
174 0.4
175 0.41
176 0.49
177 0.47
178 0.57
179 0.61
180 0.68
181 0.68
182 0.76
183 0.83
184 0.83
185 0.88
186 0.87
187 0.87
188 0.87
189 0.87
190 0.86
191 0.88
192 0.89
193 0.86
194 0.87
195 0.85
196 0.85
197 0.86
198 0.85
199 0.84
200 0.79
201 0.77
202 0.67
203 0.61
204 0.54
205 0.45
206 0.4
207 0.34
208 0.31
209 0.3
210 0.36
211 0.37
212 0.34
213 0.35
214 0.38
215 0.38
216 0.4
217 0.41
218 0.43
219 0.43
220 0.47
221 0.5
222 0.47
223 0.43
224 0.41
225 0.41
226 0.33
227 0.31
228 0.27
229 0.21
230 0.19
231 0.19
232 0.18
233 0.15
234 0.14
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.13
246 0.17
247 0.2
248 0.21
249 0.2
250 0.2
251 0.2
252 0.21
253 0.23
254 0.2
255 0.18
256 0.17
257 0.17
258 0.15
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.21
263 0.27