Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CTC2

Protein Details
Accession I1CTC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MDDQTHKPHVKQKSGKKVERKKENKFANAKKSSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-33PHVKQKSGKKVERKKENKFANAKKSS
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012948  AARP2CN  
IPR039761  Bms1/Tsr1  
IPR037875  Bms1_N  
IPR030387  G_Bms1/Tsr1_dom  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF08142  AARP2CN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51714  G_BMS1  
CDD cd01882  BMS1  
Amino Acid Sequences MDDQTHKPHVKQKSGKKVERKKENKFANAKKSSNPKAFTFQSAGRAEKTVRRNHDLGEKKLHVPLVDRTPIEAPPVVIAVVGPPGSGKSTLIRSLVKRYTKHNLNEIKGPITVVSGKKRRLTFMECNNDLNSMIDVAKIADLVLLMIDASFGFEMETFEFLNILQSHGFPKVMGVLTHLDKFRNNKSLRATKKRLKDRFWTEIYQGAKLFYLSGIINGRYPNLEIQNLSRFISVMKFRPLVWRNTHPYVVADRIEDLTDPELVHRKPTCDRTVTLYGYLRGTNLKSGMRVHIPGAGDHLLSDVSVLPDPCPLPDKERKRLDEKHKLIYAPMSDVGGVMYDKDAVYINVPGHFTKKSAYAPSEEQGQEGDESDEIVPQGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.86
3 0.89
4 0.9
5 0.9
6 0.92
7 0.91
8 0.9
9 0.9
10 0.9
11 0.89
12 0.89
13 0.88
14 0.88
15 0.87
16 0.8
17 0.77
18 0.78
19 0.78
20 0.76
21 0.7
22 0.63
23 0.62
24 0.61
25 0.58
26 0.53
27 0.46
28 0.46
29 0.46
30 0.44
31 0.38
32 0.38
33 0.35
34 0.38
35 0.44
36 0.44
37 0.47
38 0.51
39 0.51
40 0.52
41 0.59
42 0.6
43 0.57
44 0.58
45 0.55
46 0.5
47 0.51
48 0.5
49 0.4
50 0.35
51 0.36
52 0.34
53 0.36
54 0.34
55 0.33
56 0.33
57 0.33
58 0.32
59 0.26
60 0.19
61 0.14
62 0.15
63 0.12
64 0.1
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.14
77 0.17
78 0.2
79 0.24
80 0.25
81 0.33
82 0.4
83 0.44
84 0.43
85 0.46
86 0.53
87 0.57
88 0.59
89 0.6
90 0.6
91 0.56
92 0.6
93 0.56
94 0.48
95 0.4
96 0.36
97 0.27
98 0.2
99 0.22
100 0.19
101 0.26
102 0.31
103 0.35
104 0.41
105 0.42
106 0.44
107 0.45
108 0.49
109 0.48
110 0.52
111 0.57
112 0.53
113 0.53
114 0.5
115 0.45
116 0.38
117 0.3
118 0.2
119 0.11
120 0.1
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.02
133 0.02
134 0.03
135 0.02
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.12
164 0.15
165 0.16
166 0.14
167 0.16
168 0.2
169 0.22
170 0.29
171 0.29
172 0.3
173 0.37
174 0.45
175 0.52
176 0.58
177 0.62
178 0.59
179 0.68
180 0.74
181 0.74
182 0.7
183 0.71
184 0.69
185 0.68
186 0.65
187 0.58
188 0.49
189 0.46
190 0.42
191 0.34
192 0.27
193 0.2
194 0.16
195 0.13
196 0.12
197 0.07
198 0.08
199 0.06
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.14
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.17
217 0.15
218 0.15
219 0.18
220 0.19
221 0.17
222 0.2
223 0.2
224 0.21
225 0.3
226 0.33
227 0.35
228 0.39
229 0.43
230 0.46
231 0.49
232 0.49
233 0.4
234 0.39
235 0.35
236 0.32
237 0.25
238 0.19
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.14
243 0.12
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.15
249 0.15
250 0.21
251 0.21
252 0.24
253 0.29
254 0.36
255 0.4
256 0.37
257 0.39
258 0.4
259 0.45
260 0.43
261 0.41
262 0.36
263 0.33
264 0.31
265 0.3
266 0.23
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.18
273 0.2
274 0.23
275 0.24
276 0.24
277 0.22
278 0.23
279 0.22
280 0.2
281 0.22
282 0.19
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.06
290 0.07
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.16
298 0.16
299 0.23
300 0.33
301 0.41
302 0.48
303 0.57
304 0.62
305 0.67
306 0.76
307 0.79
308 0.8
309 0.77
310 0.76
311 0.71
312 0.66
313 0.59
314 0.54
315 0.46
316 0.38
317 0.33
318 0.24
319 0.19
320 0.19
321 0.17
322 0.12
323 0.1
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.08
331 0.1
332 0.13
333 0.14
334 0.15
335 0.18
336 0.18
337 0.21
338 0.21
339 0.2
340 0.2
341 0.24
342 0.27
343 0.32
344 0.35
345 0.37
346 0.4
347 0.42
348 0.48
349 0.42
350 0.37
351 0.31
352 0.29
353 0.24
354 0.21
355 0.2
356 0.11
357 0.13
358 0.13
359 0.13