FuNGI

I1CJ87

Protein Details

Accession

I1CJ87

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-26	KKVTQNFCRNRCQWRNDQIKQLQS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 9, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom IPR026960 RVT-Znf
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1 PF13966 zf-RVT
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MVKKVTQNFCRNRCQWRNDQIKQLQSQRNDIFRRYSDNSTCLNILLPEVENKLAKLQTEIVEIDILRAGKRWIENNEKSAGYLKRTAESRNIKRNITKLVHPETGLECLDIKAKLDAASNFYSTLYSAEPIDHHDLESMLNTIDKQVSPSDAKHIIRSISFDDILDGSRRTPHKSSPVMDGLPYEILHLIIGHPSCKSLVLEFYNDAINKALFPKSWQQTCLVLLPKTGSLTSLSNWRPISLINTDCKVFTRIMNSRIMGISSKLITRFQSGFMHNRFIGDHGFACRLIMENASKSSPISESLGVILDQTNAYDRIHPEYLCKVLNRFGFPNKFIKCIHDLFFGNSISVNVNGSLSDSIQQLRGLRQGDSISPILFNLAIEPFLLSILHNEIIDGYCLKARRFNSDLQLTAPRPVKLLAYADDILIFINSKEEFLELQERLKATSSILDTQLWFTNDQRTIFHKETIRKLESSVNIHSQRQLSVYGRAHIANTLILSKLWHFLRITSLPKSFYNKVSSIVYQFVAHNLFPRIARTTLEQPKNKGGVSLLNVEVQQKIFQFRYINPLLLNCRQRIPDFLYKMLIFTLQSSFDAPSHVIPLIFKHSRSYSNMKGLHPLIPMFSALDSCPRLSTENDLTISSQTSLLIPFKDICEEDPQEKFKFSKFLQAQKAYHFFEQDFLSNGIQFKSRQHCGSPNILQKIKNAVLTGNLIFKPYFGSLLSAEQQDLELDNEEHPTESNINFDPFIQQMIYEDINITALKNSQLKTMFSFNSNSQITNISPNNWKAFISSPMHHIPRNVWYRLLHKKLSTRANLHRIIPAKVDDDYCQLCKLPETEQHMLFTCIQKQDLWNAAFKKYLSNPKDPNCSSIFEDLSTLRLSKYYILHYHDKFTIYDFFATVIQFIWKAHWQQFFEQTPVVDEIVINQIQKEPLKLSAYNSLC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.8
3	0.8
4	0.84
5	0.8
6	0.84
7	0.8
8	0.79
9	0.79
10	0.79
11	0.76
12	0.69
13	0.72
14	0.68
15	0.7
16	0.66
17	0.62
18	0.59
19	0.54
20	0.58
21	0.54
22	0.56
23	0.52
24	0.52
25	0.51
26	0.47
27	0.45
28	0.37
29	0.33
30	0.25
31	0.2
32	0.18
33	0.16
34	0.15
35	0.17
36	0.2
37	0.19
38	0.19
39	0.23
40	0.22
41	0.22
42	0.22
43	0.24
44	0.23
45	0.26
46	0.25
47	0.22
48	0.22
49	0.21
50	0.19
51	0.18
52	0.16
53	0.13
54	0.14
55	0.14
56	0.16
57	0.21
58	0.26
59	0.32
60	0.42
61	0.47
62	0.5
63	0.53
64	0.49
65	0.46
66	0.47
67	0.42
68	0.37
69	0.38
70	0.35
71	0.36
72	0.39
73	0.41
74	0.44
75	0.51
76	0.56
77	0.6
78	0.64
79	0.63
80	0.67
81	0.69
82	0.68
83	0.62
84	0.59
85	0.58
86	0.6
87	0.57
88	0.52
89	0.49
90	0.42
91	0.41
92	0.34
93	0.26
94	0.19
95	0.17
96	0.2
97	0.17
98	0.16
99	0.13
100	0.14
101	0.15
102	0.19
103	0.19
104	0.21
105	0.24
106	0.23
107	0.23
108	0.21
109	0.2
110	0.16
111	0.16
112	0.12
113	0.11
114	0.1
115	0.11
116	0.11
117	0.16
118	0.22
119	0.2
120	0.2
121	0.19
122	0.19
123	0.18
124	0.19
125	0.15
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.1
130	0.12
131	0.12
132	0.13
133	0.13
134	0.17
135	0.2
136	0.21
137	0.26
138	0.31
139	0.32
140	0.33
141	0.35
142	0.32
143	0.3
144	0.32
145	0.29
146	0.25
147	0.25
148	0.21
149	0.2
150	0.18
151	0.19
152	0.18
153	0.16
154	0.12
155	0.19
156	0.21
157	0.25
158	0.28
159	0.33
160	0.4
161	0.46
162	0.48
163	0.49
164	0.52
165	0.47
166	0.44
167	0.39
168	0.31
169	0.26
170	0.23
171	0.16
172	0.11
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.07
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.11
183	0.13
184	0.13
185	0.11
186	0.15
187	0.17
188	0.2
189	0.2
190	0.2
191	0.23
192	0.22
193	0.21
194	0.17
195	0.15
196	0.13
197	0.15
198	0.15
199	0.12
200	0.16
201	0.24
202	0.31
203	0.34
204	0.34
205	0.34
206	0.35
207	0.37
208	0.39
209	0.34
210	0.27
211	0.25
212	0.25
213	0.23
214	0.22
215	0.19
216	0.15
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.21
221	0.21
222	0.25
223	0.25
224	0.25
225	0.23
226	0.22
227	0.25
228	0.22
229	0.25
230	0.23
231	0.25
232	0.25
233	0.25
234	0.26
235	0.24
236	0.2
237	0.17
238	0.23
239	0.26
240	0.29
241	0.33
242	0.32
243	0.31
244	0.31
245	0.3
246	0.22
247	0.18
248	0.16
249	0.13
250	0.15
251	0.14
252	0.16
253	0.16
254	0.19
255	0.19
256	0.2
257	0.24
258	0.26
259	0.32
260	0.33
261	0.36
262	0.32
263	0.31
264	0.29
265	0.25
266	0.23
267	0.17
268	0.16
269	0.13
270	0.14
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.11
275	0.1
276	0.11
277	0.11
278	0.12
279	0.14
280	0.14
281	0.14
282	0.13
283	0.14
284	0.12
285	0.12
286	0.13
287	0.12
288	0.11
289	0.12
290	0.12
291	0.11
292	0.1
293	0.09
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.11
301	0.12
302	0.16
303	0.19
304	0.19
305	0.19
306	0.21
307	0.24
308	0.23
309	0.23
310	0.19
311	0.23
312	0.26
313	0.26
314	0.26
315	0.31
316	0.33
317	0.34
318	0.41
319	0.37
320	0.38
321	0.35
322	0.36
323	0.34
324	0.33
325	0.33
326	0.29
327	0.28
328	0.27
329	0.29
330	0.26
331	0.21
332	0.17
333	0.16
334	0.12
335	0.11
336	0.1
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.11
348	0.11
349	0.12
350	0.16
351	0.15
352	0.15
353	0.16
354	0.16
355	0.16
356	0.18
357	0.17
358	0.13
359	0.12
360	0.11
361	0.1
362	0.09
363	0.08
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.05
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.07
384	0.09
385	0.09
386	0.14
387	0.15
388	0.21
389	0.24
390	0.27
391	0.31
392	0.33
393	0.33
394	0.3
395	0.35
396	0.29
397	0.31
398	0.31
399	0.24
400	0.22
401	0.22
402	0.2
403	0.16
404	0.17
405	0.13
406	0.14
407	0.14
408	0.14
409	0.13
410	0.13
411	0.11
412	0.09
413	0.08
414	0.04
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.12
423	0.1
424	0.11
425	0.13
426	0.13
427	0.13
428	0.14
429	0.12
430	0.08
431	0.11
432	0.12
433	0.12
434	0.13
435	0.13
436	0.13
437	0.14
438	0.16
439	0.14
440	0.13
441	0.12
442	0.16
443	0.18
444	0.18
445	0.18
446	0.2
447	0.26
448	0.27
449	0.3
450	0.29
451	0.32
452	0.38
453	0.43
454	0.41
455	0.34
456	0.35
457	0.35
458	0.34
459	0.32
460	0.29
461	0.29
462	0.29
463	0.29
464	0.3
465	0.26
466	0.24
467	0.21
468	0.21
469	0.15
470	0.2
471	0.2
472	0.19
473	0.2
474	0.19
475	0.18
476	0.16
477	0.15
478	0.09
479	0.08
480	0.07
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.11
486	0.1
487	0.12
488	0.12
489	0.12
490	0.17
491	0.2
492	0.23
493	0.22
494	0.24
495	0.24
496	0.26
497	0.31
498	0.29
499	0.29
500	0.3
501	0.27
502	0.28
503	0.27
504	0.26
505	0.22
506	0.21
507	0.18
508	0.15
509	0.14
510	0.13
511	0.13
512	0.12
513	0.12
514	0.11
515	0.12
516	0.11
517	0.13
518	0.14
519	0.13
520	0.14
521	0.15
522	0.24
523	0.32
524	0.4
525	0.41
526	0.41
527	0.46
528	0.47
529	0.43
530	0.35
531	0.26
532	0.22
533	0.22
534	0.22
535	0.17
536	0.16
537	0.17
538	0.17
539	0.17
540	0.13
541	0.12
542	0.1
543	0.12
544	0.12
545	0.14
546	0.15
547	0.16
548	0.23
549	0.23
550	0.23
551	0.2
552	0.22
553	0.24
554	0.29
555	0.31
556	0.25
557	0.27
558	0.27
559	0.28
560	0.29
561	0.31
562	0.33
563	0.32
564	0.32
565	0.32
566	0.3
567	0.3
568	0.26
569	0.2
570	0.12
571	0.11
572	0.11
573	0.08
574	0.09
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.11
579	0.1
580	0.09
581	0.1
582	0.1
583	0.09
584	0.08
585	0.1
586	0.16
587	0.17
588	0.17
589	0.19
590	0.21
591	0.24
592	0.3
593	0.35
594	0.33
595	0.4
596	0.44
597	0.41
598	0.44
599	0.42
600	0.39
601	0.34
602	0.29
603	0.21
604	0.17
605	0.16
606	0.12
607	0.1
608	0.08
609	0.07
610	0.11
611	0.11
612	0.11
613	0.12
614	0.12
615	0.14
616	0.14
617	0.2
618	0.19
619	0.22
620	0.22
621	0.22
622	0.22
623	0.21
624	0.21
625	0.16
626	0.13
627	0.09
628	0.09
629	0.1
630	0.1
631	0.1
632	0.1
633	0.11
634	0.11
635	0.13
636	0.13
637	0.13
638	0.18
639	0.2
640	0.22
641	0.25
642	0.29
643	0.28
644	0.29
645	0.29
646	0.24
647	0.29
648	0.26
649	0.32
650	0.34
651	0.41
652	0.48
653	0.55
654	0.54
655	0.54
656	0.59
657	0.52
658	0.47
659	0.41
660	0.32
661	0.27
662	0.27
663	0.22
664	0.19
665	0.17
666	0.16
667	0.16
668	0.17
669	0.15
670	0.15
671	0.16
672	0.2
673	0.25
674	0.29
675	0.3
676	0.32
677	0.38
678	0.4
679	0.47
680	0.49
681	0.49
682	0.52
683	0.54
684	0.51
685	0.47
686	0.51
687	0.45
688	0.39
689	0.31
690	0.24
691	0.23
692	0.25
693	0.23
694	0.2
695	0.18
696	0.18
697	0.17
698	0.16
699	0.17
700	0.15
701	0.15
702	0.1
703	0.12
704	0.12
705	0.15
706	0.18
707	0.16
708	0.15
709	0.14
710	0.14
711	0.12
712	0.12
713	0.09
714	0.09
715	0.09
716	0.1
717	0.11
718	0.11
719	0.11
720	0.11
721	0.12
722	0.12
723	0.12
724	0.14
725	0.14
726	0.16
727	0.16
728	0.16
729	0.16
730	0.14
731	0.15
732	0.12
733	0.1
734	0.1
735	0.13
736	0.13
737	0.11
738	0.11
739	0.1
740	0.11
741	0.11
742	0.1
743	0.08
744	0.09
745	0.12
746	0.16
747	0.17
748	0.21
749	0.24
750	0.25
751	0.27
752	0.33
753	0.3
754	0.28
755	0.31
756	0.27
757	0.33
758	0.32
759	0.29
760	0.24
761	0.25
762	0.23
763	0.28
764	0.28
765	0.24
766	0.29
767	0.33
768	0.35
769	0.33
770	0.32
771	0.27
772	0.28
773	0.31
774	0.31
775	0.28
776	0.31
777	0.38
778	0.41
779	0.4
780	0.39
781	0.35
782	0.39
783	0.45
784	0.4
785	0.37
786	0.37
787	0.44
788	0.53
789	0.56
790	0.52
791	0.5
792	0.56
793	0.6
794	0.66
795	0.65
796	0.63
797	0.66
798	0.7
799	0.69
800	0.63
801	0.62
802	0.56
803	0.5
804	0.45
805	0.38
806	0.32
807	0.29
808	0.29
809	0.24
810	0.26
811	0.28
812	0.26
813	0.25
814	0.23
815	0.21
816	0.22
817	0.22
818	0.22
819	0.25
820	0.32
821	0.37
822	0.37
823	0.39
824	0.38
825	0.4
826	0.38
827	0.35
828	0.32
829	0.29
830	0.28
831	0.27
832	0.28
833	0.32
834	0.36
835	0.34
836	0.35
837	0.35
838	0.36
839	0.37
840	0.36
841	0.36
842	0.36
843	0.45
844	0.44
845	0.51
846	0.58
847	0.63
848	0.73
849	0.67
850	0.64
851	0.56
852	0.54
853	0.48
854	0.45
855	0.39
856	0.29
857	0.3
858	0.26
859	0.25
860	0.23
861	0.2
862	0.14
863	0.14
864	0.15
865	0.17
866	0.2
867	0.25
868	0.29
869	0.35
870	0.44
871	0.45
872	0.49
873	0.47
874	0.45
875	0.39
876	0.36
877	0.36
878	0.3
879	0.29
880	0.24
881	0.22
882	0.22
883	0.21
884	0.18
885	0.13
886	0.12
887	0.12
888	0.12
889	0.15
890	0.19
891	0.24
892	0.31
893	0.37
894	0.39
895	0.43
896	0.52
897	0.51
898	0.49
899	0.46
900	0.39
901	0.36
902	0.34
903	0.29
904	0.2
905	0.17
906	0.16
907	0.19
908	0.21
909	0.17
910	0.16
911	0.19
912	0.23
913	0.25
914	0.25
915	0.22
916	0.26
917	0.31
918	0.32
919	0.33

I1CJ87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer