Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CMD0

Protein Details
Accession I1CMD0    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-74AYQSHKQQQQQQQNYHHHQQHydrophilic
282-309RTPLKVTKSMGKKKVAKRSKVKPFIKIVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-303KSMGKKKVAKRSKVK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005824  KOW  
IPR041991  KOW_RPL27  
IPR038655  L27e_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR001141  Ribosomal_L27e  
IPR018262  Ribosomal_L27e_CS  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01777  Ribosomal_L27e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01107  RIBOSOMAL_L27E  
CDD cd06090  KOW_RPL27  
Amino Acid Sequences MAEEDGDDLEEIVHDVPMKKRSRSEEPVDEKQTKSLKSSEDSIKASQKIQTTTQAYQSHKQQQQQQQNYHHHQQQQIPTSLTQLRGISNQPTNSIYLGELHWYTTDKDVQEPLRKTNLIEHLKEMSFFEIVFLEFNNEEYATYAKELFEKIINTLLLLLESSSKPTRNIINNTANIPRLGNTPMNFAFNPSMPYFPTPPVPPNIRMYSEMMMRGGMRGNSNNRPRLGFNQSSTAMVKFIKAGKVVVILQGRYAGKKAVVVRNHDEGTKERPYGYAVVAGVERTPLKVTKSMGKKKVAKRSKVKPFIKIVNYNHMMPTRYGLELEQIKGTISSETFKEPTQREDSKKVIKKLFEERYQTGKNKWFFSKLRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.12
3 0.18
4 0.26
5 0.32
6 0.36
7 0.42
8 0.49
9 0.57
10 0.62
11 0.66
12 0.68
13 0.71
14 0.76
15 0.77
16 0.74
17 0.65
18 0.63
19 0.61
20 0.52
21 0.47
22 0.43
23 0.39
24 0.38
25 0.45
26 0.45
27 0.45
28 0.47
29 0.48
30 0.51
31 0.48
32 0.47
33 0.44
34 0.41
35 0.38
36 0.38
37 0.41
38 0.4
39 0.4
40 0.46
41 0.49
42 0.49
43 0.51
44 0.56
45 0.58
46 0.58
47 0.61
48 0.62
49 0.65
50 0.72
51 0.75
52 0.75
53 0.74
54 0.79
55 0.8
56 0.79
57 0.75
58 0.7
59 0.66
60 0.65
61 0.64
62 0.61
63 0.57
64 0.51
65 0.45
66 0.44
67 0.41
68 0.35
69 0.3
70 0.24
71 0.22
72 0.23
73 0.25
74 0.25
75 0.27
76 0.27
77 0.26
78 0.26
79 0.26
80 0.23
81 0.22
82 0.16
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.14
92 0.17
93 0.15
94 0.17
95 0.21
96 0.26
97 0.33
98 0.34
99 0.35
100 0.37
101 0.37
102 0.36
103 0.38
104 0.43
105 0.4
106 0.39
107 0.37
108 0.36
109 0.35
110 0.35
111 0.29
112 0.2
113 0.15
114 0.14
115 0.11
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.2
154 0.25
155 0.29
156 0.34
157 0.38
158 0.39
159 0.41
160 0.41
161 0.35
162 0.29
163 0.25
164 0.18
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.13
169 0.16
170 0.17
171 0.19
172 0.18
173 0.18
174 0.16
175 0.14
176 0.17
177 0.13
178 0.13
179 0.11
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.16
184 0.15
185 0.16
186 0.2
187 0.23
188 0.23
189 0.27
190 0.28
191 0.27
192 0.28
193 0.28
194 0.25
195 0.23
196 0.21
197 0.16
198 0.14
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.13
205 0.18
206 0.26
207 0.32
208 0.36
209 0.36
210 0.37
211 0.38
212 0.4
213 0.42
214 0.38
215 0.33
216 0.34
217 0.33
218 0.33
219 0.32
220 0.26
221 0.2
222 0.16
223 0.15
224 0.12
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.13
230 0.15
231 0.15
232 0.18
233 0.17
234 0.15
235 0.15
236 0.19
237 0.19
238 0.17
239 0.18
240 0.14
241 0.12
242 0.16
243 0.22
244 0.25
245 0.29
246 0.34
247 0.38
248 0.42
249 0.43
250 0.39
251 0.35
252 0.31
253 0.33
254 0.32
255 0.29
256 0.24
257 0.23
258 0.25
259 0.25
260 0.22
261 0.19
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.09
270 0.11
271 0.12
272 0.14
273 0.18
274 0.2
275 0.27
276 0.38
277 0.47
278 0.52
279 0.6
280 0.67
281 0.72
282 0.8
283 0.81
284 0.81
285 0.81
286 0.84
287 0.86
288 0.87
289 0.84
290 0.81
291 0.8
292 0.79
293 0.77
294 0.76
295 0.69
296 0.68
297 0.66
298 0.59
299 0.55
300 0.49
301 0.42
302 0.33
303 0.33
304 0.25
305 0.22
306 0.22
307 0.18
308 0.22
309 0.24
310 0.25
311 0.22
312 0.2
313 0.2
314 0.19
315 0.2
316 0.15
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.18
321 0.19
322 0.21
323 0.29
324 0.29
325 0.34
326 0.41
327 0.47
328 0.49
329 0.55
330 0.61
331 0.64
332 0.71
333 0.73
334 0.71
335 0.68
336 0.68
337 0.72
338 0.73
339 0.71
340 0.7
341 0.66
342 0.68
343 0.71
344 0.69
345 0.66
346 0.65
347 0.63
348 0.61
349 0.62
350 0.62