FuNGI

I1CQH0

Protein Details

Accession

I1CQH0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
74-142	NRHHSSRDRYHDRSRDNRDRRRRSRERRDRSPRHHRRDERDYRRRRRSISPRRSSRRRSANPVRHRDDE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
86-138	RSRDNRDRRRRSRERRDRSPRHHRRDERDYRRRRRSISPRRSSRRRSANPVRH

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12230 RRM1_U2AF65 cd12232 RRM3_U2AF65

Amino Acid Sequences

MSYGWSRDQTPVCYLDPSQQSAADFANSFLKSVGQELQGSSDNHYGHESQGRYSEYHGGDDYRRRDDRDMNRENRHHSSRDRYHDRSRDNRDRRRRSRERRDRSPRHHRRDERDYRRRRRSISPRRSSRRRSANPVRHRDDENIVPLSKRPRKLHNWDMAPAGMEGMTAQQVKMTGLFPLPGQVVGTRTPQSFQPPPVNNKFDDSRILAANTTATKQARRLYVGQIPPGLEEKPLADFFNATMHQLQMQDRTPVAAVQINHEKSYAFVEFQTAEQATACMAFDGIMFQGQQLKIRRPKDYQPPAEGDVSMQLPGLVSTNVPDTPNKIFIGGLPVYLNDDQVIELLKSFGDRKLIVQRASVGAKHIPPDYMSGPMLPANYVPVTSAKEDDATRVLQLMNMVTPEELEDDEEYQDIWEDIAEECAKFGNVLDMKIPKPQKDQEVPGCGLIFVRFETKDQTLDALRALAGRKFADRTVVATFIDEQNYLTDSF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.36
3	0.36
4	0.37
5	0.34
6	0.32
7	0.31
8	0.29
9	0.3
10	0.24
11	0.2
12	0.17
13	0.22
14	0.2
15	0.2
16	0.18
17	0.19
18	0.17
19	0.19
20	0.22
21	0.17
22	0.19
23	0.19
24	0.22
25	0.25
26	0.26
27	0.27
28	0.28
29	0.26
30	0.25
31	0.28
32	0.25
33	0.23
34	0.29
35	0.26
36	0.23
37	0.28
38	0.29
39	0.27
40	0.29
41	0.33
42	0.27
43	0.29
44	0.28
45	0.27
46	0.3
47	0.37
48	0.39
49	0.4
50	0.42
51	0.43
52	0.47
53	0.53
54	0.58
55	0.61
56	0.67
57	0.67
58	0.74
59	0.75
60	0.77
61	0.76
62	0.71
63	0.66
64	0.63
65	0.65
66	0.65
67	0.7
68	0.72
69	0.71
70	0.75
71	0.78
72	0.8
73	0.79
74	0.8
75	0.81
76	0.83
77	0.86
78	0.87
79	0.9
80	0.91
81	0.92
82	0.93
83	0.93
84	0.94
85	0.95
86	0.94
87	0.94
88	0.95
89	0.95
90	0.94
91	0.94
92	0.94
93	0.93
94	0.93
95	0.91
96	0.89
97	0.9
98	0.9
99	0.9
100	0.9
101	0.9
102	0.9
103	0.92
104	0.9
105	0.84
106	0.84
107	0.84
108	0.85
109	0.85
110	0.85
111	0.85
112	0.88
113	0.93
114	0.9
115	0.89
116	0.89
117	0.85
118	0.85
119	0.85
120	0.85
121	0.86
122	0.87
123	0.83
124	0.76
125	0.72
126	0.65
127	0.58
128	0.51
129	0.45
130	0.38
131	0.33
132	0.29
133	0.29
134	0.35
135	0.37
136	0.42
137	0.41
138	0.47
139	0.56
140	0.65
141	0.72
142	0.71
143	0.68
144	0.62
145	0.59
146	0.51
147	0.42
148	0.33
149	0.23
150	0.13
151	0.09
152	0.07
153	0.05
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.07
159	0.07
160	0.09
161	0.08
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.07
166	0.09
167	0.09
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.09
172	0.1
173	0.13
174	0.14
175	0.14
176	0.15
177	0.16
178	0.21
179	0.23
180	0.25
181	0.32
182	0.35
183	0.42
184	0.49
185	0.5
186	0.44
187	0.44
188	0.42
189	0.34
190	0.32
191	0.26
192	0.21
193	0.19
194	0.19
195	0.15
196	0.14
197	0.14
198	0.12
199	0.11
200	0.12
201	0.12
202	0.13
203	0.16
204	0.2
205	0.21
206	0.23
207	0.24
208	0.25
209	0.31
210	0.32
211	0.31
212	0.28
213	0.26
214	0.23
215	0.22
216	0.18
217	0.11
218	0.1
219	0.09
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.12
227	0.11
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.1
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.12
240	0.1
241	0.11
242	0.1
243	0.09
244	0.12
245	0.19
246	0.19
247	0.19
248	0.19
249	0.18
250	0.16
251	0.19
252	0.16
253	0.09
254	0.08
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.12
259	0.09
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.09
276	0.09
277	0.14
278	0.17
279	0.25
280	0.32
281	0.36
282	0.41
283	0.41
284	0.49
285	0.55
286	0.62
287	0.59
288	0.56
289	0.56
290	0.54
291	0.51
292	0.43
293	0.32
294	0.24
295	0.19
296	0.14
297	0.1
298	0.07
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.05
303	0.04
304	0.05
305	0.07
306	0.08
307	0.09
308	0.1
309	0.12
310	0.14
311	0.17
312	0.17
313	0.15
314	0.14
315	0.14
316	0.2
317	0.17
318	0.15
319	0.12
320	0.12
321	0.15
322	0.15
323	0.14
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.09
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.12
337	0.12
338	0.16
339	0.25
340	0.3
341	0.3
342	0.3
343	0.31
344	0.31
345	0.33
346	0.3
347	0.23
348	0.21
349	0.22
350	0.23
351	0.22
352	0.19
353	0.17
354	0.21
355	0.19
356	0.19
357	0.17
358	0.15
359	0.15
360	0.16
361	0.15
362	0.12
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.11
369	0.13
370	0.14
371	0.16
372	0.13
373	0.16
374	0.16
375	0.18
376	0.18
377	0.16
378	0.15
379	0.15
380	0.15
381	0.13
382	0.13
383	0.12
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.09
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.1
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.09
399	0.09
400	0.08
401	0.06
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.11
410	0.11
411	0.1
412	0.1
413	0.15
414	0.15
415	0.16
416	0.21
417	0.24
418	0.26
419	0.34
420	0.39
421	0.35
422	0.41
423	0.47
424	0.52
425	0.56
426	0.64
427	0.64
428	0.66
429	0.63
430	0.57
431	0.52
432	0.42
433	0.35
434	0.27
435	0.19
436	0.13
437	0.16
438	0.15
439	0.16
440	0.21
441	0.23
442	0.23
443	0.23
444	0.26
445	0.23
446	0.23
447	0.23
448	0.18
449	0.16
450	0.18
451	0.19
452	0.17
453	0.19
454	0.19
455	0.22
456	0.24
457	0.24
458	0.28
459	0.27
460	0.28
461	0.29
462	0.29
463	0.26
464	0.25
465	0.27
466	0.23
467	0.24
468	0.21
469	0.18
470	0.17

I1CQH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer