Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CBF4

Protein Details
Accession I1CBF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-348LKLPPSKKQRGMKSKNQSESHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008626  Mediator_Med15_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF05397  Med15_fungi  
Amino Acid Sequences MALQQHMQQQQQQQQQQQYPVNMAQQSNTVSSLDVPTNNPMYTFNPQPITINQDMIIPASNRQQAFSQKQPVMMTQRPPATNITKSNVVFLVKQLDENVRKNKVNGPFIEDLSEQDKMTIKTYTQQMKLMYDKLDHLLPMFLLTTSNFEATRRIVLMKHMLEDQYNFLSQDKYIFNLENIFKLRDQFNGYFNWVKNTMGGNNYPLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLLQQQLLRQQLLIQQQQQMMQQSSQLLQLQQSQQRVDEKLMQSSPSQLPQQQMPLQHAHLSSSQPSNQIESDNMTNSVMSPAVTVKRNSIDLKLPPSKKQRGMKSKNQSESISKKVNSTNSNEPHMTQTTTAVNSDMSKDNFSIKNQYSLLMQQSVQHNLQQQEQVQSMPNEYTNMSLNITHQEANPVTSINKTDNTLDAINFDGYLKEGYKDETFGGVPDLNLPQLTMASDKKPTEEEDSMLSWIDSSNLDLGIDWDGDEFVKFDDNESEKVLDESGKLCAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.67
3 0.7
4 0.67
5 0.61
6 0.56
7 0.52
8 0.5
9 0.46
10 0.4
11 0.34
12 0.31
13 0.32
14 0.28
15 0.26
16 0.21
17 0.17
18 0.18
19 0.2
20 0.19
21 0.19
22 0.19
23 0.23
24 0.26
25 0.25
26 0.24
27 0.24
28 0.26
29 0.29
30 0.31
31 0.31
32 0.3
33 0.31
34 0.34
35 0.33
36 0.36
37 0.32
38 0.3
39 0.25
40 0.24
41 0.24
42 0.22
43 0.23
44 0.16
45 0.17
46 0.22
47 0.27
48 0.25
49 0.26
50 0.3
51 0.35
52 0.42
53 0.47
54 0.5
55 0.46
56 0.5
57 0.5
58 0.51
59 0.5
60 0.49
61 0.46
62 0.43
63 0.48
64 0.45
65 0.46
66 0.46
67 0.43
68 0.44
69 0.44
70 0.42
71 0.43
72 0.42
73 0.42
74 0.39
75 0.35
76 0.29
77 0.26
78 0.28
79 0.22
80 0.22
81 0.22
82 0.28
83 0.32
84 0.38
85 0.44
86 0.44
87 0.45
88 0.47
89 0.52
90 0.52
91 0.53
92 0.47
93 0.47
94 0.43
95 0.42
96 0.43
97 0.36
98 0.3
99 0.26
100 0.26
101 0.19
102 0.17
103 0.2
104 0.18
105 0.2
106 0.19
107 0.16
108 0.21
109 0.29
110 0.34
111 0.33
112 0.36
113 0.36
114 0.38
115 0.41
116 0.38
117 0.33
118 0.27
119 0.26
120 0.24
121 0.23
122 0.19
123 0.16
124 0.13
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.13
137 0.14
138 0.16
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.16
143 0.23
144 0.22
145 0.22
146 0.22
147 0.21
148 0.21
149 0.21
150 0.21
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.15
158 0.13
159 0.13
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.19
164 0.2
165 0.19
166 0.21
167 0.21
168 0.2
169 0.22
170 0.23
171 0.2
172 0.25
173 0.22
174 0.22
175 0.23
176 0.26
177 0.28
178 0.27
179 0.28
180 0.23
181 0.21
182 0.21
183 0.21
184 0.2
185 0.17
186 0.18
187 0.17
188 0.18
189 0.19
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.2
194 0.23
195 0.27
196 0.34
197 0.4
198 0.43
199 0.5
200 0.54
201 0.57
202 0.6
203 0.6
204 0.58
205 0.59
206 0.61
207 0.61
208 0.61
209 0.61
210 0.61
211 0.61
212 0.61
213 0.61
214 0.61
215 0.61
216 0.61
217 0.61
218 0.61
219 0.6
220 0.57
221 0.51
222 0.46
223 0.42
224 0.4
225 0.34
226 0.28
227 0.24
228 0.21
229 0.25
230 0.25
231 0.21
232 0.17
233 0.17
234 0.2
235 0.24
236 0.25
237 0.22
238 0.23
239 0.24
240 0.25
241 0.26
242 0.23
243 0.18
244 0.16
245 0.15
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.13
253 0.17
254 0.19
255 0.21
256 0.2
257 0.2
258 0.23
259 0.23
260 0.21
261 0.23
262 0.21
263 0.22
264 0.22
265 0.22
266 0.19
267 0.23
268 0.22
269 0.18
270 0.19
271 0.18
272 0.19
273 0.19
274 0.23
275 0.21
276 0.22
277 0.22
278 0.22
279 0.21
280 0.22
281 0.21
282 0.18
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.17
287 0.18
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.17
292 0.17
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.13
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.08
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.11
307 0.13
308 0.14
309 0.15
310 0.17
311 0.2
312 0.21
313 0.22
314 0.23
315 0.24
316 0.32
317 0.38
318 0.39
319 0.43
320 0.51
321 0.56
322 0.59
323 0.64
324 0.67
325 0.69
326 0.75
327 0.78
328 0.8
329 0.81
330 0.79
331 0.75
332 0.67
333 0.63
334 0.61
335 0.57
336 0.53
337 0.45
338 0.43
339 0.43
340 0.47
341 0.43
342 0.43
343 0.46
344 0.43
345 0.47
346 0.44
347 0.41
348 0.39
349 0.37
350 0.32
351 0.23
352 0.21
353 0.19
354 0.19
355 0.19
356 0.15
357 0.13
358 0.13
359 0.16
360 0.18
361 0.16
362 0.17
363 0.17
364 0.22
365 0.24
366 0.25
367 0.3
368 0.27
369 0.32
370 0.3
371 0.31
372 0.27
373 0.27
374 0.28
375 0.22
376 0.21
377 0.2
378 0.23
379 0.27
380 0.26
381 0.26
382 0.28
383 0.28
384 0.31
385 0.3
386 0.29
387 0.28
388 0.28
389 0.26
390 0.24
391 0.24
392 0.22
393 0.19
394 0.18
395 0.16
396 0.15
397 0.15
398 0.14
399 0.15
400 0.14
401 0.13
402 0.14
403 0.16
404 0.18
405 0.17
406 0.15
407 0.2
408 0.19
409 0.2
410 0.19
411 0.17
412 0.16
413 0.17
414 0.19
415 0.16
416 0.18
417 0.18
418 0.19
419 0.2
420 0.23
421 0.22
422 0.2
423 0.18
424 0.18
425 0.16
426 0.15
427 0.14
428 0.1
429 0.09
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.15
435 0.16
436 0.17
437 0.17
438 0.17
439 0.16
440 0.15
441 0.18
442 0.15
443 0.14
444 0.15
445 0.15
446 0.14
447 0.13
448 0.13
449 0.1
450 0.1
451 0.11
452 0.12
453 0.14
454 0.16
455 0.23
456 0.23
457 0.25
458 0.27
459 0.3
460 0.34
461 0.33
462 0.31
463 0.29
464 0.3
465 0.29
466 0.27
467 0.23
468 0.15
469 0.13
470 0.13
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.1
480 0.09
481 0.08
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.07
487 0.12
488 0.12
489 0.13
490 0.21
491 0.24
492 0.26
493 0.28
494 0.28
495 0.24
496 0.25
497 0.25
498 0.18
499 0.17
500 0.16