Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1C2D1

Protein Details
Accession I1C2D1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
364-395EQNRMRQNRGNSRQQFNRQRDYRQYNNNKVYHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MSNPKRNLSQEQKIFEIEERVHKLLTPNLRSKYTLYRKIPTYPKEQRQEFGTKTAEYFDTLATQLANNFTLNSNKQPTFEEDTILEDTEMSNNYNNNINMQDLAQLIASAVATAINNKPEKEQNNVRIPMPSTYNGERNAAVINLWIQEVERYLNFYDVPKTRWISYGVTLLRDRAQKWWNQLSQKNEESTTWEKFKVDLEYSFKPSYSEHAARDRLASIKQNRSVAEYVDEFQDVLLDLPRVSDDEALDRFVRGLKGDARIHVLTKEPRSLEEATRFAIAYDSAKQTGIFVSTNHHDRMPNDPMDLSVLVQQLHAMNIANNNHQPRERVHIRTNRNIICHWCKKSGHVIAECRTRLREIKEFEQNRMRQNRGNSRQQFNRQRDYRQYNNNKVYHADLIDFEPMLIKILYLNFPLVVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.47
3 0.43
4 0.36
5 0.37
6 0.39
7 0.38
8 0.36
9 0.36
10 0.37
11 0.38
12 0.44
13 0.43
14 0.46
15 0.49
16 0.52
17 0.52
18 0.53
19 0.57
20 0.58
21 0.6
22 0.58
23 0.6
24 0.61
25 0.68
26 0.73
27 0.68
28 0.68
29 0.68
30 0.72
31 0.75
32 0.74
33 0.68
34 0.65
35 0.68
36 0.6
37 0.56
38 0.5
39 0.41
40 0.38
41 0.38
42 0.32
43 0.25
44 0.24
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.15
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.13
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.18
58 0.21
59 0.26
60 0.31
61 0.31
62 0.32
63 0.33
64 0.38
65 0.41
66 0.38
67 0.34
68 0.27
69 0.3
70 0.3
71 0.28
72 0.21
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.15
88 0.16
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.07
101 0.09
102 0.14
103 0.16
104 0.16
105 0.2
106 0.26
107 0.29
108 0.34
109 0.42
110 0.45
111 0.53
112 0.54
113 0.52
114 0.48
115 0.47
116 0.42
117 0.36
118 0.3
119 0.25
120 0.26
121 0.3
122 0.28
123 0.28
124 0.26
125 0.23
126 0.21
127 0.16
128 0.13
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.16
145 0.17
146 0.19
147 0.22
148 0.23
149 0.23
150 0.25
151 0.26
152 0.23
153 0.22
154 0.27
155 0.23
156 0.25
157 0.24
158 0.23
159 0.24
160 0.25
161 0.24
162 0.23
163 0.26
164 0.26
165 0.33
166 0.39
167 0.4
168 0.45
169 0.48
170 0.48
171 0.51
172 0.5
173 0.45
174 0.38
175 0.33
176 0.32
177 0.32
178 0.3
179 0.25
180 0.23
181 0.22
182 0.22
183 0.24
184 0.21
185 0.19
186 0.18
187 0.21
188 0.23
189 0.27
190 0.27
191 0.25
192 0.22
193 0.21
194 0.21
195 0.23
196 0.23
197 0.21
198 0.26
199 0.28
200 0.27
201 0.28
202 0.26
203 0.2
204 0.19
205 0.24
206 0.24
207 0.29
208 0.32
209 0.34
210 0.34
211 0.36
212 0.34
213 0.28
214 0.24
215 0.19
216 0.16
217 0.14
218 0.14
219 0.1
220 0.09
221 0.08
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.06
233 0.09
234 0.1
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.09
242 0.11
243 0.13
244 0.19
245 0.2
246 0.21
247 0.24
248 0.25
249 0.25
250 0.23
251 0.25
252 0.24
253 0.25
254 0.28
255 0.24
256 0.24
257 0.28
258 0.3
259 0.29
260 0.29
261 0.27
262 0.24
263 0.25
264 0.23
265 0.19
266 0.17
267 0.14
268 0.1
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.11
278 0.09
279 0.12
280 0.16
281 0.2
282 0.21
283 0.22
284 0.22
285 0.23
286 0.3
287 0.32
288 0.29
289 0.26
290 0.25
291 0.23
292 0.24
293 0.23
294 0.16
295 0.14
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.08
304 0.08
305 0.13
306 0.15
307 0.18
308 0.22
309 0.25
310 0.27
311 0.28
312 0.3
313 0.28
314 0.35
315 0.38
316 0.41
317 0.47
318 0.53
319 0.6
320 0.67
321 0.73
322 0.67
323 0.63
324 0.59
325 0.58
326 0.59
327 0.61
328 0.56
329 0.55
330 0.52
331 0.53
332 0.6
333 0.59
334 0.57
335 0.55
336 0.57
337 0.57
338 0.64
339 0.61
340 0.54
341 0.49
342 0.45
343 0.44
344 0.44
345 0.45
346 0.43
347 0.49
348 0.57
349 0.58
350 0.61
351 0.65
352 0.63
353 0.64
354 0.66
355 0.63
356 0.58
357 0.65
358 0.69
359 0.68
360 0.74
361 0.73
362 0.74
363 0.79
364 0.84
365 0.85
366 0.82
367 0.84
368 0.79
369 0.79
370 0.81
371 0.8
372 0.78
373 0.79
374 0.81
375 0.81
376 0.85
377 0.8
378 0.71
379 0.65
380 0.6
381 0.53
382 0.44
383 0.35
384 0.27
385 0.26
386 0.26
387 0.23
388 0.19
389 0.16
390 0.14
391 0.15
392 0.13
393 0.1
394 0.11
395 0.14
396 0.17
397 0.16
398 0.17