FuNGI

I1BU21

Protein Details

Accession

I1BU21

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
714-741	LLKKQLEQVKNQSKKDKKFNPTNMSDSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MRGHDLFVAVGSTIRVLNLTEFKDAWTIVAKEAFEKNVEVSNSWFTLIPYKLLNTPQIDFSIESLTPSINGRLLSVTGAHSLVIVCLPRQGFGDISLSKKEIDCRTLDVGRKYYSKSEILKVDWHPLSESKGHLVVLSSDSILRIFNVGVDIEEPEQSFDLSPVESKSGLKSHRGFSFEDDDMNGYEDAVTFSLGGVSHEQSGWEPFTIHYALRNGHMYALCPVIPFGSAIHKRHLDNLSILVEAKYQKTKNAPLQDTRTLSRLFKLQKQWLQHLIESAKVGRKVSPTSNDTLSVISNTTSFSLPLRRQGPFMINHQHSLLNIAQVTDILYIYTEPIHLLALAFSNGQVENHILTSETDAQWQMPAKNKEEWHKELETLLSHRDFLPTAILYESIDLKAKSSLPSQSMRLVSDPHYPDTYYIYHASGVAAIDMSKWLEAPKQVCRRAEDGKTDTSGDLKRWLSEKTTSDVRHLINTAPLSDAFAPIVGLFVITNFYLSYTLISMTFDYKLVYSDLNIRRDIEPSEKLSRAVKDQLKGITSTENEPAYESILSLPAFEKPKELNNLPKQSKIVIPSELADSKEVVINEETLRFFSKSAEKVRRETRELGKAAVKIKERISLQQKEFEKQVDSVKDIYERYQKYFSPEAKKIQEKVLKDITSRHAKLRLRMDEQLRLVMLSCQPGLSKEENEWIEKLQTLSDKINGTSGYASRIDLLKKQLEQVKNQSKKDKKFNPTNMSDSQRESILNVLKGQNESIDQAKKRIENLERKMQTITL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.08
4	0.13
5	0.18
6	0.2
7	0.22
8	0.22
9	0.24
10	0.25
11	0.24
12	0.21
13	0.22
14	0.21
15	0.2
16	0.24
17	0.23
18	0.24
19	0.27
20	0.28
21	0.23
22	0.23
23	0.22
24	0.24
25	0.25
26	0.22
27	0.23
28	0.25
29	0.24
30	0.24
31	0.23
32	0.18
33	0.24
34	0.24
35	0.23
36	0.2
37	0.22
38	0.25
39	0.28
40	0.33
41	0.3
42	0.31
43	0.31
44	0.3
45	0.3
46	0.27
47	0.25
48	0.23
49	0.19
50	0.18
51	0.17
52	0.15
53	0.14
54	0.15
55	0.16
56	0.13
57	0.14
58	0.14
59	0.14
60	0.14
61	0.14
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.13
66	0.12
67	0.11
68	0.1
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.08
73	0.12
74	0.13
75	0.13
76	0.15
77	0.16
78	0.14
79	0.15
80	0.22
81	0.2
82	0.23
83	0.24
84	0.24
85	0.24
86	0.25
87	0.3
88	0.28
89	0.3
90	0.29
91	0.31
92	0.36
93	0.41
94	0.45
95	0.44
96	0.44
97	0.44
98	0.46
99	0.44
100	0.43
101	0.42
102	0.43
103	0.42
104	0.43
105	0.44
106	0.43
107	0.47
108	0.44
109	0.48
110	0.42
111	0.38
112	0.34
113	0.31
114	0.33
115	0.29
116	0.28
117	0.22
118	0.23
119	0.22
120	0.2
121	0.19
122	0.16
123	0.15
124	0.14
125	0.12
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.1
130	0.09
131	0.08
132	0.07
133	0.07
134	0.08
135	0.07
136	0.07
137	0.08
138	0.09
139	0.09
140	0.1
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.09
147	0.09
148	0.08
149	0.09
150	0.09
151	0.11
152	0.11
153	0.12
154	0.15
155	0.2
156	0.22
157	0.28
158	0.31
159	0.35
160	0.39
161	0.4
162	0.39
163	0.37
164	0.41
165	0.34
166	0.31
167	0.26
168	0.22
169	0.2
170	0.21
171	0.16
172	0.1
173	0.09
174	0.08
175	0.08
176	0.07
177	0.07
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.06
182	0.07
183	0.08
184	0.09
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.1
194	0.13
195	0.14
196	0.13
197	0.14
198	0.16
199	0.16
200	0.18
201	0.2
202	0.17
203	0.19
204	0.19
205	0.17
206	0.16
207	0.17
208	0.14
209	0.12
210	0.12
211	0.09
212	0.09
213	0.08
214	0.07
215	0.15
216	0.21
217	0.23
218	0.28
219	0.31
220	0.32
221	0.38
222	0.4
223	0.33
224	0.28
225	0.3
226	0.25
227	0.22
228	0.22
229	0.15
230	0.15
231	0.15
232	0.16
233	0.19
234	0.18
235	0.22
236	0.26
237	0.33
238	0.39
239	0.47
240	0.49
241	0.49
242	0.55
243	0.57
244	0.55
245	0.5
246	0.45
247	0.38
248	0.34
249	0.3
250	0.3
251	0.28
252	0.31
253	0.38
254	0.42
255	0.45
256	0.49
257	0.52
258	0.53
259	0.52
260	0.45
261	0.42
262	0.34
263	0.31
264	0.28
265	0.25
266	0.21
267	0.2
268	0.21
269	0.18
270	0.2
271	0.23
272	0.26
273	0.3
274	0.29
275	0.31
276	0.32
277	0.3
278	0.28
279	0.25
280	0.21
281	0.15
282	0.12
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.14
291	0.15
292	0.21
293	0.25
294	0.24
295	0.25
296	0.27
297	0.3
298	0.26
299	0.31
300	0.33
301	0.3
302	0.31
303	0.31
304	0.29
305	0.24
306	0.25
307	0.2
308	0.13
309	0.12
310	0.11
311	0.1
312	0.09
313	0.1
314	0.07
315	0.06
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.05
330	0.05
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.08
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.1
348	0.12
349	0.13
350	0.13
351	0.18
352	0.21
353	0.23
354	0.28
355	0.3
356	0.36
357	0.41
358	0.42
359	0.4
360	0.38
361	0.35
362	0.31
363	0.29
364	0.23
365	0.18
366	0.17
367	0.12
368	0.12
369	0.12
370	0.12
371	0.11
372	0.1
373	0.1
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.09
386	0.1
387	0.1
388	0.12
389	0.14
390	0.15
391	0.18
392	0.19
393	0.22
394	0.22
395	0.21
396	0.2
397	0.19
398	0.18
399	0.23
400	0.24
401	0.21
402	0.21
403	0.2
404	0.2
405	0.21
406	0.2
407	0.15
408	0.14
409	0.13
410	0.12
411	0.12
412	0.12
413	0.09
414	0.08
415	0.06
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.06
425	0.09
426	0.12
427	0.2
428	0.29
429	0.34
430	0.36
431	0.38
432	0.41
433	0.44
434	0.46
435	0.44
436	0.38
437	0.36
438	0.35
439	0.33
440	0.28
441	0.26
442	0.23
443	0.17
444	0.2
445	0.18
446	0.19
447	0.19
448	0.2
449	0.19
450	0.23
451	0.25
452	0.23
453	0.29
454	0.29
455	0.3
456	0.33
457	0.31
458	0.28
459	0.27
460	0.23
461	0.2
462	0.19
463	0.17
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.12
468	0.12
469	0.08
470	0.08
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.04
475	0.04
476	0.03
477	0.03
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.07
490	0.07
491	0.08
492	0.09
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.08
500	0.17
501	0.23
502	0.25
503	0.26
504	0.27
505	0.27
506	0.28
507	0.3
508	0.25
509	0.23
510	0.25
511	0.3
512	0.29
513	0.29
514	0.31
515	0.31
516	0.3
517	0.35
518	0.34
519	0.31
520	0.34
521	0.35
522	0.33
523	0.32
524	0.29
525	0.25
526	0.22
527	0.22
528	0.22
529	0.2
530	0.18
531	0.19
532	0.18
533	0.15
534	0.14
535	0.12
536	0.08
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.1
541	0.13
542	0.16
543	0.16
544	0.18
545	0.18
546	0.24
547	0.3
548	0.33
549	0.38
550	0.45
551	0.55
552	0.54
553	0.56
554	0.51
555	0.47
556	0.47
557	0.41
558	0.35
559	0.26
560	0.25
561	0.23
562	0.26
563	0.25
564	0.23
565	0.19
566	0.17
567	0.15
568	0.17
569	0.16
570	0.13
571	0.12
572	0.13
573	0.13
574	0.15
575	0.15
576	0.14
577	0.17
578	0.15
579	0.15
580	0.17
581	0.23
582	0.26
583	0.36
584	0.44
585	0.45
586	0.52
587	0.61
588	0.64
589	0.63
590	0.64
591	0.62
592	0.62
593	0.59
594	0.56
595	0.51
596	0.48
597	0.47
598	0.46
599	0.41
600	0.36
601	0.37
602	0.39
603	0.37
604	0.41
605	0.46
606	0.49
607	0.48
608	0.52
609	0.53
610	0.5
611	0.51
612	0.45
613	0.38
614	0.32
615	0.36
616	0.31
617	0.31
618	0.29
619	0.28
620	0.29
621	0.27
622	0.3
623	0.32
624	0.32
625	0.34
626	0.37
627	0.37
628	0.4
629	0.47
630	0.5
631	0.5
632	0.53
633	0.56
634	0.6
635	0.66
636	0.62
637	0.63
638	0.62
639	0.55
640	0.57
641	0.57
642	0.51
643	0.46
644	0.49
645	0.48
646	0.52
647	0.52
648	0.5
649	0.5
650	0.51
651	0.58
652	0.61
653	0.61
654	0.57
655	0.62
656	0.62
657	0.61
658	0.58
659	0.54
660	0.44
661	0.36
662	0.3
663	0.26
664	0.23
665	0.18
666	0.17
667	0.15
668	0.15
669	0.16
670	0.21
671	0.21
672	0.21
673	0.2
674	0.28
675	0.3
676	0.32
677	0.31
678	0.28
679	0.26
680	0.26
681	0.24
682	0.2
683	0.21
684	0.22
685	0.23
686	0.26
687	0.26
688	0.25
689	0.28
690	0.25
691	0.23
692	0.23
693	0.21
694	0.2
695	0.19
696	0.19
697	0.18
698	0.21
699	0.23
700	0.24
701	0.3
702	0.32
703	0.32
704	0.39
705	0.45
706	0.47
707	0.52
708	0.58
709	0.63
710	0.66
711	0.71
712	0.75
713	0.77
714	0.81
715	0.84
716	0.83
717	0.83
718	0.85
719	0.89
720	0.88
721	0.85
722	0.82
723	0.79
724	0.75
725	0.68
726	0.61
727	0.53
728	0.45
729	0.38
730	0.33
731	0.32
732	0.31
733	0.3
734	0.3
735	0.31
736	0.32
737	0.33
738	0.33
739	0.28
740	0.23
741	0.24
742	0.27
743	0.32
744	0.31
745	0.35
746	0.41
747	0.42
748	0.44
749	0.5
750	0.53
751	0.55
752	0.61
753	0.67
754	0.63
755	0.62

I1BU21

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer