FuNGI

I1CL39

Protein Details

Accession

I1CL39

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
242-279	ANLHSKKTKAKDRKLEAAKKKIKRKSKSKEKAENFNFS	Hydrophilic
650-671	ESTILGPRKKTKQDYQQRMASI	Hydrophilic
711-731	QSVVSKSKRSLFEKQKQLRAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
246-272	SKKTKAKDRKLEAAKKKIKRKSKSKEK
556-565	KARRIGKRQL
678-701	REKFGSNKGKKDRGSTTNREKARN
718-719	KR
723-740	EKQKQLRAAITKQKKLKH

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MGKRNRAALLPTHLPQLQNLIKRDPKSYEAEFLQQWRHFQSTLSIFCLKPDEESKELSELVTFISQVAQCYTEITKDFPQQIVDLLQEHCMSLHPEVRKSLVQALILLRNKGILDNTRDKQLREMLYSHIVNDIKNSNAKVKNNKLNKTLQSFMFTMLESATTGNSDENAIAAKKSVDVCIDLYHKNVWNDAKTVNVIAEACFSPVTKISVTAVKFFLNSNEHNEEDEDDDDIPDLKKMQMANLHSKKTKAKDRKLEAAKKKIKRKSKSKEKAENFNFSALHLINDPQGFAEKLYSKLNTKEDRWEVRLMKMNLVSRVVGIHQLTILGFYPLLIKYLQPTQRDVTMVLVCAAQASHSLVPPDVLEPVLKAIANNFVTDRVANEVMAVGINGIREICVRQPLAIDATLLQDLTQYKQHRDKGVLMAARSLIALFREINPEMLLRKDRGKSASIRLKDGSVRAAQYGQLGNNVDALDGLELLDQEAKEDDWAEWEVEEDSEEESDEEGWINLPSDDEDFVNVALDDDEKEDNKEEDKEEDEKKKKVQYKLGENGEIIKARRIGKRQLKKMQEAEDRSEITDEQRQKLLEAVRAREAEEKVKQEAKLKLATTRILTPADFARLNELRTNKEIEVAQGKKRGFDEGQNESEVNESTILGPRKKTKQDYQQRMASIQEGREGREKFGSNKGKKDRGSTTNREKARNKNFMMIAHKQSVVSKSKRSLFEKQKQLRAAITKQKKLKH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.36
3	0.39
4	0.38
5	0.38
6	0.41
7	0.44
8	0.49
9	0.51
10	0.56
11	0.51
12	0.5
13	0.49
14	0.49
15	0.47
16	0.44
17	0.46
18	0.44
19	0.44
20	0.47
21	0.43
22	0.43
23	0.4
24	0.4
25	0.35
26	0.33
27	0.36
28	0.35
29	0.36
30	0.38
31	0.37
32	0.34
33	0.35
34	0.39
35	0.31
36	0.28
37	0.31
38	0.33
39	0.31
40	0.35
41	0.35
42	0.33
43	0.33
44	0.29
45	0.23
46	0.17
47	0.16
48	0.14
49	0.11
50	0.09
51	0.13
52	0.13
53	0.14
54	0.15
55	0.14
56	0.13
57	0.16
58	0.17
59	0.17
60	0.17
61	0.2
62	0.24
63	0.29
64	0.32
65	0.31
66	0.31
67	0.28
68	0.29
69	0.26
70	0.22
71	0.19
72	0.17
73	0.18
74	0.16
75	0.16
76	0.14
77	0.14
78	0.15
79	0.15
80	0.21
81	0.22
82	0.25
83	0.27
84	0.3
85	0.31
86	0.31
87	0.34
88	0.31
89	0.27
90	0.27
91	0.29
92	0.34
93	0.35
94	0.33
95	0.27
96	0.25
97	0.24
98	0.23
99	0.23
100	0.21
101	0.26
102	0.34
103	0.36
104	0.44
105	0.46
106	0.45
107	0.47
108	0.48
109	0.44
110	0.38
111	0.38
112	0.33
113	0.38
114	0.37
115	0.33
116	0.31
117	0.28
118	0.25
119	0.27
120	0.25
121	0.21
122	0.24
123	0.26
124	0.28
125	0.34
126	0.41
127	0.47
128	0.55
129	0.62
130	0.67
131	0.72
132	0.69
133	0.71
134	0.71
135	0.68
136	0.63
137	0.55
138	0.51
139	0.45
140	0.41
141	0.33
142	0.26
143	0.2
144	0.16
145	0.14
146	0.1
147	0.09
148	0.07
149	0.06
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.08
161	0.1
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.13
166	0.14
167	0.17
168	0.2
169	0.18
170	0.19
171	0.22
172	0.25
173	0.24
174	0.28
175	0.27
176	0.26
177	0.27
178	0.26
179	0.24
180	0.21
181	0.21
182	0.16
183	0.14
184	0.12
185	0.1
186	0.12
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.09
192	0.11
193	0.13
194	0.1
195	0.11
196	0.12
197	0.17
198	0.18
199	0.19
200	0.19
201	0.18
202	0.18
203	0.18
204	0.2
205	0.19
206	0.2
207	0.24
208	0.26
209	0.26
210	0.27
211	0.27
212	0.23
213	0.21
214	0.2
215	0.15
216	0.11
217	0.11
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.1
225	0.1
226	0.13
227	0.17
228	0.21
229	0.32
230	0.37
231	0.42
232	0.41
233	0.45
234	0.48
235	0.5
236	0.56
237	0.56
238	0.6
239	0.65
240	0.7
241	0.76
242	0.8
243	0.83
244	0.81
245	0.82
246	0.82
247	0.8
248	0.83
249	0.81
250	0.81
251	0.81
252	0.83
253	0.83
254	0.85
255	0.88
256	0.89
257	0.91
258	0.87
259	0.88
260	0.83
261	0.79
262	0.69
263	0.61
264	0.5
265	0.39
266	0.36
267	0.25
268	0.2
269	0.13
270	0.12
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.11
279	0.1
280	0.12
281	0.14
282	0.16
283	0.17
284	0.22
285	0.29
286	0.3
287	0.3
288	0.36
289	0.4
290	0.43
291	0.44
292	0.46
293	0.41
294	0.41
295	0.47
296	0.4
297	0.36
298	0.36
299	0.35
300	0.3
301	0.29
302	0.24
303	0.16
304	0.16
305	0.13
306	0.12
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.07
312	0.08
313	0.07
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.06
321	0.06
322	0.08
323	0.15
324	0.2
325	0.19
326	0.22
327	0.22
328	0.24
329	0.25
330	0.23
331	0.19
332	0.15
333	0.14
334	0.12
335	0.1
336	0.08
337	0.08
338	0.07
339	0.04
340	0.04
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.1
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.08
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.04
381	0.05
382	0.06
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.12
389	0.11
390	0.1
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.06
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.14
400	0.14
401	0.19
402	0.26
403	0.3
404	0.31
405	0.34
406	0.35
407	0.34
408	0.37
409	0.35
410	0.28
411	0.25
412	0.23
413	0.2
414	0.17
415	0.12
416	0.07
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.1
422	0.11
423	0.11
424	0.11
425	0.12
426	0.11
427	0.14
428	0.15
429	0.13
430	0.19
431	0.2
432	0.23
433	0.24
434	0.27
435	0.28
436	0.35
437	0.42
438	0.38
439	0.4
440	0.37
441	0.37
442	0.35
443	0.33
444	0.27
445	0.2
446	0.19
447	0.17
448	0.17
449	0.15
450	0.16
451	0.16
452	0.13
453	0.14
454	0.14
455	0.13
456	0.14
457	0.13
458	0.11
459	0.09
460	0.09
461	0.06
462	0.05
463	0.05
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.06
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.09
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.08
501	0.07
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.07
507	0.06
508	0.05
509	0.06
510	0.06
511	0.07
512	0.09
513	0.09
514	0.1
515	0.12
516	0.13
517	0.15
518	0.16
519	0.16
520	0.17
521	0.2
522	0.24
523	0.29
524	0.38
525	0.41
526	0.43
527	0.47
528	0.54
529	0.58
530	0.6
531	0.62
532	0.61
533	0.66
534	0.71
535	0.71
536	0.65
537	0.57
538	0.53
539	0.47
540	0.41
541	0.32
542	0.26
543	0.25
544	0.28
545	0.34
546	0.36
547	0.44
548	0.51
549	0.61
550	0.67
551	0.72
552	0.75
553	0.77
554	0.79
555	0.78
556	0.76
557	0.71
558	0.66
559	0.62
560	0.55
561	0.47
562	0.42
563	0.33
564	0.27
565	0.29
566	0.28
567	0.26
568	0.28
569	0.27
570	0.26
571	0.31
572	0.31
573	0.3
574	0.31
575	0.31
576	0.33
577	0.34
578	0.35
579	0.36
580	0.35
581	0.35
582	0.35
583	0.36
584	0.35
585	0.39
586	0.4
587	0.41
588	0.44
589	0.42
590	0.43
591	0.41
592	0.4
593	0.39
594	0.4
595	0.36
596	0.34
597	0.33
598	0.29
599	0.27
600	0.25
601	0.23
602	0.25
603	0.23
604	0.2
605	0.24
606	0.25
607	0.27
608	0.3
609	0.31
610	0.31
611	0.32
612	0.37
613	0.29
614	0.31
615	0.29
616	0.29
617	0.35
618	0.35
619	0.38
620	0.39
621	0.39
622	0.39
623	0.39
624	0.41
625	0.34
626	0.37
627	0.39
628	0.4
629	0.43
630	0.41
631	0.4
632	0.34
633	0.33
634	0.26
635	0.2
636	0.13
637	0.11
638	0.1
639	0.17
640	0.22
641	0.24
642	0.28
643	0.36
644	0.44
645	0.53
646	0.6
647	0.63
648	0.69
649	0.77
650	0.83
651	0.83
652	0.81
653	0.74
654	0.68
655	0.59
656	0.53
657	0.46
658	0.37
659	0.35
660	0.3
661	0.3
662	0.36
663	0.36
664	0.34
665	0.36
666	0.38
667	0.35
668	0.45
669	0.52
670	0.51
671	0.6
672	0.67
673	0.68
674	0.69
675	0.73
676	0.71
677	0.7
678	0.74
679	0.74
680	0.75
681	0.75
682	0.78
683	0.79
684	0.77
685	0.78
686	0.79
687	0.79
688	0.72
689	0.71
690	0.68
691	0.66
692	0.66
693	0.63
694	0.59
695	0.53
696	0.51
697	0.44
698	0.44
699	0.45
700	0.46
701	0.45
702	0.46
703	0.5
704	0.56
705	0.64
706	0.66
707	0.7
708	0.72
709	0.76
710	0.79
711	0.8
712	0.81
713	0.78
714	0.74
715	0.71
716	0.68
717	0.67
718	0.67
719	0.68
720	0.69

I1CL39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer