FuNGI

I1CUD6

Protein Details

Accession

I1CUD6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
181-200	TKAISKLSRIRKNRTLKPTF	Hydrophilic
638-657	MLKTAKKRFLQQSLEKRQQS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 9, cyto 4, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MRIRQDLSLDSNHKLVSLSFQINASIPQLPRHPRIIWNLGKLKDRNNHEAYLRRFQELSQPLLQYHEKHDYPINNRHYAVDYIEKLNADLCQAIYTSLDDSCGRVSHSTGPLRDFWTDKLQEAYDYRELCYRKWRKAYGLNKLHYWLKHQEARATLRRLIAQRRRETWTTFCKQMASEEYTKAISKLSRIRKNRTLKPTFSTPEGPQHAAEIMASYLETTFSDCPFTRDDINLAIRSLPVKKAPGIDHLRNEMLQPISHLLAPILFHLFHMCWAWSYVPQTWRIAQVIPIYKKGSSSDPGKYRPISLTTIFRKILERCIQHFPQADGPPLDIAQGGFRESRSALDQVLCLAEISHVLRTHYHVKPVLAFLDIKSAYDTVNRSFVWDTLSRYFSSPMLHLLRCLFDDVQIEILLSNTTSRRFHPKTGVLQGSILSPYLYSVFINQLPAQLRPQAITTDMSPLETIPLLNCLLYADDVVLIAERTTMTDLLRVPFKPGGYLDPDELIRRNSSKALATMNVLKSIVRPQLEYGLAINRFTNTQLKSIEDVQDTCIRTIYGARGKTSTKVMLHLAKLPLMADRVHILQAQFLYRSLHLPDDALLCRLIPHIRHIRGHQWFLLSKTLLWQSLPSTGEELDKHMLKTAKKRFLQQSLEKRQQSGHYKLLSSCRRSVSLDPILWLPMSYAERSRCIRWRLGWLPGGKPHPCPKHPTFKFTRRHAITCLNMHQRLYMPKTITDPLSFLLNMLPSRPSVPSNLALSWSQRWPVICSILHELDQLQHITVIPITYPHGQKLLEWLKRFL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.23
3	0.21
4	0.24
5	0.24
6	0.23
7	0.24
8	0.24
9	0.25
10	0.25
11	0.22
12	0.21
13	0.2
14	0.23
15	0.3
16	0.36
17	0.4
18	0.45
19	0.45
20	0.46
21	0.54
22	0.59
23	0.58
24	0.6
25	0.64
26	0.63
27	0.68
28	0.65
29	0.65
30	0.63
31	0.64
32	0.64
33	0.61
34	0.6
35	0.58
36	0.63
37	0.61
38	0.63
39	0.58
40	0.52
41	0.48
42	0.43
43	0.48
44	0.43
45	0.42
46	0.37
47	0.36
48	0.34
49	0.39
50	0.41
51	0.34
52	0.35
53	0.38
54	0.33
55	0.35
56	0.41
57	0.44
58	0.48
59	0.55
60	0.56
61	0.52
62	0.53
63	0.52
64	0.49
65	0.43
66	0.39
67	0.37
68	0.32
69	0.3
70	0.31
71	0.29
72	0.26
73	0.25
74	0.22
75	0.16
76	0.14
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.09
85	0.12
86	0.11
87	0.12
88	0.13
89	0.13
90	0.14
91	0.14
92	0.16
93	0.21
94	0.28
95	0.33
96	0.33
97	0.36
98	0.37
99	0.39
100	0.39
101	0.34
102	0.3
103	0.34
104	0.33
105	0.31
106	0.32
107	0.3
108	0.3
109	0.3
110	0.33
111	0.29
112	0.28
113	0.28
114	0.3
115	0.31
116	0.3
117	0.39
118	0.41
119	0.45
120	0.52
121	0.56
122	0.59
123	0.68
124	0.75
125	0.75
126	0.77
127	0.71
128	0.65
129	0.64
130	0.61
131	0.52
132	0.48
133	0.44
134	0.42
135	0.45
136	0.45
137	0.46
138	0.46
139	0.53
140	0.55
141	0.53
142	0.48
143	0.45
144	0.48
145	0.49
146	0.54
147	0.55
148	0.56
149	0.59
150	0.61
151	0.64
152	0.63
153	0.61
154	0.59
155	0.6
156	0.56
157	0.52
158	0.48
159	0.43
160	0.4
161	0.4
162	0.38
163	0.34
164	0.32
165	0.29
166	0.29
167	0.29
168	0.29
169	0.25
170	0.22
171	0.17
172	0.2
173	0.27
174	0.36
175	0.44
176	0.51
177	0.6
178	0.67
179	0.75
180	0.79
181	0.81
182	0.79
183	0.73
184	0.72
185	0.72
186	0.65
187	0.59
188	0.55
189	0.47
190	0.48
191	0.47
192	0.43
193	0.35
194	0.33
195	0.28
196	0.23
197	0.21
198	0.12
199	0.08
200	0.06
201	0.06
202	0.05
203	0.04
204	0.05
205	0.05
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.13
210	0.13
211	0.15
212	0.17
213	0.19
214	0.19
215	0.18
216	0.19
217	0.2
218	0.23
219	0.22
220	0.2
221	0.18
222	0.17
223	0.18
224	0.19
225	0.16
226	0.16
227	0.17
228	0.19
229	0.23
230	0.24
231	0.31
232	0.37
233	0.39
234	0.4
235	0.41
236	0.41
237	0.36
238	0.34
239	0.29
240	0.22
241	0.17
242	0.15
243	0.14
244	0.13
245	0.13
246	0.13
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.1
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.1
262	0.11
263	0.13
264	0.17
265	0.18
266	0.21
267	0.22
268	0.22
269	0.24
270	0.23
271	0.21
272	0.19
273	0.22
274	0.28
275	0.28
276	0.3
277	0.29
278	0.28
279	0.28
280	0.28
281	0.25
282	0.22
283	0.25
284	0.29
285	0.33
286	0.37
287	0.4
288	0.39
289	0.38
290	0.35
291	0.34
292	0.3
293	0.26
294	0.31
295	0.3
296	0.35
297	0.33
298	0.32
299	0.33
300	0.3
301	0.36
302	0.35
303	0.34
304	0.33
305	0.4
306	0.4
307	0.41
308	0.41
309	0.35
310	0.35
311	0.34
312	0.32
313	0.25
314	0.24
315	0.2
316	0.18
317	0.16
318	0.09
319	0.07
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.08
327	0.09
328	0.1
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.1
334	0.1
335	0.09
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.09
345	0.13
346	0.2
347	0.2
348	0.24
349	0.23
350	0.23
351	0.24
352	0.24
353	0.22
354	0.15
355	0.14
356	0.11
357	0.15
358	0.14
359	0.13
360	0.13
361	0.12
362	0.11
363	0.13
364	0.15
365	0.1
366	0.13
367	0.13
368	0.14
369	0.14
370	0.14
371	0.15
372	0.16
373	0.18
374	0.18
375	0.19
376	0.18
377	0.19
378	0.19
379	0.17
380	0.16
381	0.13
382	0.15
383	0.17
384	0.16
385	0.16
386	0.16
387	0.16
388	0.15
389	0.16
390	0.11
391	0.09
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.09
396	0.09
397	0.07
398	0.07
399	0.05
400	0.04
401	0.05
402	0.05
403	0.08
404	0.09
405	0.11
406	0.2
407	0.23
408	0.26
409	0.32
410	0.37
411	0.4
412	0.46
413	0.46
414	0.37
415	0.35
416	0.32
417	0.26
418	0.21
419	0.15
420	0.07
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.06
427	0.08
428	0.08
429	0.1
430	0.1
431	0.12
432	0.13
433	0.14
434	0.15
435	0.15
436	0.15
437	0.14
438	0.15
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.11
443	0.12
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.09
450	0.08
451	0.05
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.04
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.08
474	0.09
475	0.11
476	0.14
477	0.14
478	0.16
479	0.17
480	0.17
481	0.16
482	0.16
483	0.17
484	0.19
485	0.2
486	0.17
487	0.17
488	0.18
489	0.17
490	0.18
491	0.17
492	0.14
493	0.14
494	0.15
495	0.15
496	0.16
497	0.17
498	0.17
499	0.18
500	0.17
501	0.18
502	0.22
503	0.21
504	0.2
505	0.19
506	0.17
507	0.16
508	0.2
509	0.22
510	0.17
511	0.17
512	0.17
513	0.21
514	0.21
515	0.21
516	0.17
517	0.18
518	0.18
519	0.18
520	0.17
521	0.13
522	0.13
523	0.15
524	0.2
525	0.15
526	0.19
527	0.19
528	0.21
529	0.23
530	0.25
531	0.27
532	0.23
533	0.22
534	0.22
535	0.26
536	0.25
537	0.23
538	0.21
539	0.17
540	0.15
541	0.17
542	0.2
543	0.21
544	0.22
545	0.23
546	0.25
547	0.27
548	0.29
549	0.3
550	0.29
551	0.23
552	0.24
553	0.27
554	0.29
555	0.3
556	0.32
557	0.29
558	0.25
559	0.24
560	0.22
561	0.19
562	0.16
563	0.14
564	0.1
565	0.11
566	0.11
567	0.12
568	0.13
569	0.12
570	0.13
571	0.14
572	0.14
573	0.13
574	0.13
575	0.14
576	0.13
577	0.15
578	0.14
579	0.15
580	0.14
581	0.13
582	0.14
583	0.16
584	0.16
585	0.15
586	0.13
587	0.12
588	0.12
589	0.14
590	0.15
591	0.12
592	0.2
593	0.28
594	0.33
595	0.36
596	0.4
597	0.47
598	0.5
599	0.53
600	0.46
601	0.42
602	0.39
603	0.38
604	0.39
605	0.31
606	0.24
607	0.26
608	0.27
609	0.23
610	0.21
611	0.2
612	0.16
613	0.21
614	0.22
615	0.18
616	0.17
617	0.17
618	0.19
619	0.18
620	0.2
621	0.19
622	0.21
623	0.2
624	0.23
625	0.27
626	0.29
627	0.39
628	0.45
629	0.5
630	0.52
631	0.6
632	0.64
633	0.69
634	0.74
635	0.74
636	0.75
637	0.75
638	0.82
639	0.75
640	0.68
641	0.62
642	0.61
643	0.6
644	0.55
645	0.52
646	0.46
647	0.47
648	0.49
649	0.55
650	0.55
651	0.52
652	0.51
653	0.47
654	0.46
655	0.48
656	0.48
657	0.47
658	0.46
659	0.42
660	0.38
661	0.35
662	0.33
663	0.29
664	0.25
665	0.17
666	0.14
667	0.15
668	0.16
669	0.2
670	0.22
671	0.28
672	0.31
673	0.37
674	0.4
675	0.43
676	0.47
677	0.46
678	0.53
679	0.52
680	0.56
681	0.56
682	0.52
683	0.52
684	0.53
685	0.56
686	0.48
687	0.5
688	0.53
689	0.56
690	0.56
691	0.6
692	0.61
693	0.65
694	0.67
695	0.7
696	0.7
697	0.71
698	0.76
699	0.76
700	0.79
701	0.74
702	0.73
703	0.7
704	0.68
705	0.65
706	0.63
707	0.63
708	0.61
709	0.58
710	0.54
711	0.51
712	0.47
713	0.48
714	0.47
715	0.44
716	0.37
717	0.37
718	0.41
719	0.42
720	0.41
721	0.34
722	0.3
723	0.25
724	0.26
725	0.24
726	0.19
727	0.18
728	0.18
729	0.17
730	0.17
731	0.17
732	0.15
733	0.17
734	0.19
735	0.19
736	0.19
737	0.24
738	0.27
739	0.29
740	0.29
741	0.3
742	0.29
743	0.32
744	0.32
745	0.31
746	0.28
747	0.27
748	0.28
749	0.29
750	0.32
751	0.34
752	0.3
753	0.31
754	0.37
755	0.37
756	0.36
757	0.33
758	0.29
759	0.25
760	0.27
761	0.24
762	0.17
763	0.15
764	0.15
765	0.15
766	0.15
767	0.13
768	0.1
769	0.11
770	0.14
771	0.2
772	0.22
773	0.23
774	0.26
775	0.26
776	0.26
777	0.35
778	0.42
779	0.42

I1CUD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer