FuNGI

I1BY57

Protein Details

Accession

I1BY57

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
156-175	RSEFKKRLEASRQKKNERLV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
138-170	PKNSKARGQRDGFPKPVHRSEFKKRLEASRQKK

Subcellular Location(s)

plas 14, nucl 7.5, cyto_nucl 5.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MSQFTRPTFNAEDDEDLERLQQEFFSQGQTPAAKVIRKGAPVPKVEAPTMPALEDPIPAMPALEDPTPAMPALEDPTLPARNDPAQDVEYEPVMDPNPEPHVPVSKKMIDLTSMLGQVLGDIQEHTVQKVTAPSLREPKNSKARGQRDGFPKPVHRSEFKKRLEASRQKKNERLVAPPEVQSGEWDENEERIRQMSEEELKEARAEIMNTLSPESIAILMKGLKKKPAEPVQQTPPPKKPVEPIQQTPPPKKPAGKEDDEYDLLKMKEKYFADVPFENDKLAWIDDRFASVPQEKEEEGMASEAEKVYRKVRFDLQGDVCRGEIPVHKGLHHHGDEPDKAGYTLAELFYLMRSQVPSQRALVLTIVARIIERAKRDQDKDEVWRKVLRVLTGKEHAASVYLRSALDDRHLVVLVSAVRALAALVLDEEGEERELYRFMGHLMRPVLRETSQPFERKGLNDKLTELVDRVHQTTRTVEDWKDDAALAEQDLPRALIKMNLLPRLRYLLAAESELRRDEGSMELVMRLLTRLAEAGEDVCEMMEEEELIAPVVSIGVIETSWPMTEVGQRYPSVAAVRLLTTLAQGSKSIAEGLVDKMTSLLALLLTDPEIACEERKSEAYALQLETLNLLHVLTCYGFIVPILETLQDPVMDWLRHVRTRQERTRACAAIGLLEVLLHAAADPHKTVPEHAIDWHQPTAYLPAILALLKEEEVFEASLGYLATWASYIDLFSPAKETVEQVWKAVVIQESSFNSRPSAASVGYTTHHVLRYIQFISAYATLHHACYQTFAKEAMDCLVKAEGYVKGAYEKDLYGRYALWIWLKHRKEVDMLWSIAELETGMKCLHMGITETWLAQDLLQLCLSKQVVDEKMRPFYFQLNTTELEISKALFRYDGRGVKTFMYPQSTNELSDVSAFVMSPIDALYHLDKSKVAQQVQEDAATVVVKTFETADRLFEIEHAMAIISLMKVFLIGDREGRNVDMESEKEIFWDPIVQGHLDDWLKRVCKKRTNLDTLEAAWRRSSVFIRQTHLPFFQFFQSFVAHYASVSLGHHGFARLLVYLVTQIDVVDYRHLVLSDYHDILSTLKVGLNEVPQLDKKELEQLSKGGLVLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.29
3	0.25
4	0.23
5	0.21
6	0.19
7	0.15
8	0.13
9	0.11
10	0.13
11	0.14
12	0.17
13	0.18
14	0.18
15	0.23
16	0.24
17	0.23
18	0.26
19	0.31
20	0.29
21	0.29
22	0.36
23	0.36
24	0.39
25	0.45
26	0.47
27	0.5
28	0.5
29	0.55
30	0.53
31	0.51
32	0.49
33	0.44
34	0.39
35	0.37
36	0.34
37	0.29
38	0.22
39	0.21
40	0.21
41	0.19
42	0.17
43	0.13
44	0.12
45	0.12
46	0.12
47	0.09
48	0.1
49	0.12
50	0.12
51	0.11
52	0.12
53	0.13
54	0.14
55	0.14
56	0.12
57	0.09
58	0.1
59	0.13
60	0.13
61	0.12
62	0.13
63	0.19
64	0.22
65	0.23
66	0.22
67	0.23
68	0.27
69	0.29
70	0.29
71	0.28
72	0.25
73	0.26
74	0.28
75	0.25
76	0.21
77	0.2
78	0.18
79	0.16
80	0.15
81	0.15
82	0.13
83	0.15
84	0.2
85	0.19
86	0.21
87	0.21
88	0.31
89	0.32
90	0.36
91	0.4
92	0.38
93	0.39
94	0.4
95	0.39
96	0.31
97	0.29
98	0.28
99	0.25
100	0.22
101	0.19
102	0.17
103	0.15
104	0.13
105	0.13
106	0.1
107	0.07
108	0.06
109	0.07
110	0.12
111	0.13
112	0.14
113	0.14
114	0.14
115	0.15
116	0.18
117	0.2
118	0.2
119	0.23
120	0.28
121	0.36
122	0.42
123	0.48
124	0.5
125	0.56
126	0.63
127	0.64
128	0.66
129	0.67
130	0.7
131	0.72
132	0.71
133	0.7
134	0.69
135	0.72
136	0.7
137	0.66
138	0.66
139	0.64
140	0.68
141	0.66
142	0.63
143	0.64
144	0.68
145	0.72
146	0.69
147	0.69
148	0.66
149	0.69
150	0.73
151	0.76
152	0.74
153	0.75
154	0.8
155	0.79
156	0.81
157	0.79
158	0.77
159	0.7
160	0.68
161	0.64
162	0.61
163	0.56
164	0.51
165	0.46
166	0.38
167	0.35
168	0.28
169	0.27
170	0.22
171	0.19
172	0.21
173	0.19
174	0.21
175	0.23
176	0.23
177	0.18
178	0.17
179	0.18
180	0.15
181	0.16
182	0.19
183	0.24
184	0.24
185	0.27
186	0.26
187	0.25
188	0.25
189	0.25
190	0.2
191	0.15
192	0.14
193	0.12
194	0.14
195	0.16
196	0.16
197	0.16
198	0.15
199	0.12
200	0.12
201	0.11
202	0.1
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.12
207	0.17
208	0.23
209	0.25
210	0.29
211	0.31
212	0.35
213	0.44
214	0.5
215	0.55
216	0.56
217	0.62
218	0.65
219	0.7
220	0.74
221	0.71
222	0.69
223	0.66
224	0.61
225	0.55
226	0.53
227	0.56
228	0.59
229	0.6
230	0.58
231	0.6
232	0.66
233	0.7
234	0.7
235	0.67
236	0.62
237	0.6
238	0.6
239	0.57
240	0.59
241	0.6
242	0.59
243	0.54
244	0.52
245	0.52
246	0.48
247	0.43
248	0.34
249	0.3
250	0.24
251	0.27
252	0.26
253	0.21
254	0.27
255	0.26
256	0.3
257	0.29
258	0.32
259	0.32
260	0.32
261	0.35
262	0.33
263	0.33
264	0.29
265	0.25
266	0.23
267	0.19
268	0.18
269	0.16
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.15
274	0.15
275	0.14
276	0.17
277	0.18
278	0.19
279	0.19
280	0.21
281	0.19
282	0.19
283	0.19
284	0.16
285	0.12
286	0.11
287	0.1
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.16
295	0.2
296	0.22
297	0.25
298	0.31
299	0.36
300	0.36
301	0.43
302	0.45
303	0.47
304	0.47
305	0.44
306	0.37
307	0.3
308	0.29
309	0.22
310	0.2
311	0.19
312	0.23
313	0.23
314	0.24
315	0.25
316	0.28
317	0.34
318	0.31
319	0.28
320	0.26
321	0.29
322	0.29
323	0.3
324	0.28
325	0.21
326	0.19
327	0.17
328	0.13
329	0.1
330	0.11
331	0.08
332	0.08
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.07
338	0.06
339	0.08
340	0.1
341	0.15
342	0.17
343	0.19
344	0.19
345	0.22
346	0.21
347	0.21
348	0.19
349	0.15
350	0.13
351	0.12
352	0.11
353	0.08
354	0.08
355	0.07
356	0.11
357	0.12
358	0.15
359	0.19
360	0.26
361	0.33
362	0.36
363	0.39
364	0.41
365	0.44
366	0.5
367	0.54
368	0.5
369	0.45
370	0.45
371	0.42
372	0.41
373	0.38
374	0.33
375	0.3
376	0.3
377	0.33
378	0.33
379	0.33
380	0.28
381	0.26
382	0.22
383	0.17
384	0.15
385	0.11
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.1
390	0.11
391	0.1
392	0.11
393	0.11
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.09
399	0.11
400	0.09
401	0.08
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.04
417	0.04
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.12
426	0.11
427	0.15
428	0.17
429	0.18
430	0.19
431	0.2
432	0.21
433	0.17
434	0.2
435	0.19
436	0.23
437	0.26
438	0.28
439	0.28
440	0.29
441	0.31
442	0.3
443	0.35
444	0.36
445	0.34
446	0.32
447	0.32
448	0.31
449	0.29
450	0.27
451	0.21
452	0.14
453	0.13
454	0.14
455	0.15
456	0.15
457	0.15
458	0.15
459	0.17
460	0.19
461	0.18
462	0.2
463	0.18
464	0.18
465	0.19
466	0.18
467	0.17
468	0.13
469	0.11
470	0.09
471	0.09
472	0.07
473	0.09
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.12
484	0.15
485	0.21
486	0.22
487	0.22
488	0.22
489	0.24
490	0.24
491	0.2
492	0.17
493	0.13
494	0.13
495	0.14
496	0.15
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.12
501	0.09
502	0.09
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.05
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.03
526	0.03
527	0.04
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.02
536	0.02
537	0.02
538	0.02
539	0.02
540	0.02
541	0.02
542	0.02
543	0.02
544	0.03
545	0.03
546	0.03
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.08
551	0.1
552	0.11
553	0.13
554	0.13
555	0.14
556	0.14
557	0.14
558	0.12
559	0.11
560	0.1
561	0.09
562	0.09
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.07
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.05
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.05
576	0.05
577	0.06
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.05
585	0.05
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.04
593	0.04
594	0.04
595	0.05
596	0.05
597	0.06
598	0.06
599	0.07
600	0.08
601	0.09
602	0.1
603	0.1
604	0.11
605	0.13
606	0.14
607	0.14
608	0.14
609	0.14
610	0.12
611	0.12
612	0.1
613	0.08
614	0.06
615	0.06
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.05
626	0.04
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.06
632	0.07
633	0.06
634	0.06
635	0.07
636	0.09
637	0.09
638	0.09
639	0.14
640	0.17
641	0.2
642	0.21
643	0.28
644	0.35
645	0.44
646	0.51
647	0.56
648	0.55
649	0.58
650	0.65
651	0.57
652	0.48
653	0.41
654	0.33
655	0.24
656	0.21
657	0.16
658	0.08
659	0.07
660	0.06
661	0.04
662	0.04
663	0.02
664	0.02
665	0.03
666	0.04
667	0.05
668	0.06
669	0.06
670	0.08
671	0.08
672	0.09
673	0.12
674	0.13
675	0.13
676	0.14
677	0.18
678	0.19
679	0.21
680	0.21
681	0.18
682	0.16
683	0.16
684	0.17
685	0.13
686	0.11
687	0.08
688	0.08
689	0.09
690	0.08
691	0.08
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.06
696	0.05
697	0.05
698	0.06
699	0.06
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.05
715	0.08
716	0.08
717	0.08
718	0.11
719	0.11
720	0.11
721	0.12
722	0.12
723	0.13
724	0.21
725	0.21
726	0.19
727	0.19
728	0.18
729	0.18
730	0.19
731	0.16
732	0.1
733	0.1
734	0.13
735	0.14
736	0.2
737	0.21
738	0.19
739	0.19
740	0.19
741	0.18
742	0.17
743	0.18
744	0.13
745	0.12
746	0.12
747	0.13
748	0.13
749	0.15
750	0.14
751	0.14
752	0.15
753	0.14
754	0.15
755	0.16
756	0.2
757	0.18
758	0.17
759	0.15
760	0.15
761	0.17
762	0.16
763	0.14
764	0.1
765	0.13
766	0.13
767	0.14
768	0.15
769	0.13
770	0.12
771	0.15
772	0.17
773	0.15
774	0.15
775	0.15
776	0.14
777	0.14
778	0.15
779	0.14
780	0.13
781	0.12
782	0.12
783	0.12
784	0.11
785	0.11
786	0.12
787	0.1
788	0.11
789	0.11
790	0.1
791	0.12
792	0.12
793	0.14
794	0.13
795	0.12
796	0.13
797	0.15
798	0.16
799	0.14
800	0.14
801	0.14
802	0.14
803	0.15
804	0.16
805	0.17
806	0.21
807	0.3
808	0.32
809	0.35
810	0.36
811	0.36
812	0.36
813	0.35
814	0.37
815	0.32
816	0.31
817	0.26
818	0.24
819	0.23
820	0.2
821	0.17
822	0.11
823	0.06
824	0.06
825	0.07
826	0.07
827	0.06
828	0.06
829	0.07
830	0.07
831	0.06
832	0.09
833	0.08
834	0.12
835	0.13
836	0.13
837	0.12
838	0.13
839	0.13
840	0.1
841	0.12
842	0.1
843	0.11
844	0.12
845	0.12
846	0.11
847	0.16
848	0.16
849	0.14
850	0.14
851	0.18
852	0.23
853	0.28
854	0.34
855	0.33
856	0.41
857	0.41
858	0.41
859	0.36
860	0.37
861	0.36
862	0.34
863	0.34
864	0.29
865	0.3
866	0.3
867	0.3
868	0.24
869	0.22
870	0.18
871	0.15
872	0.15
873	0.15
874	0.13
875	0.13
876	0.14
877	0.17
878	0.24
879	0.28
880	0.29
881	0.31
882	0.33
883	0.33
884	0.36
885	0.35
886	0.32
887	0.34
888	0.3
889	0.29
890	0.34
891	0.33
892	0.31
893	0.27
894	0.24
895	0.17
896	0.18
897	0.16
898	0.1
899	0.09
900	0.08
901	0.07
902	0.07
903	0.07
904	0.06
905	0.06
906	0.05
907	0.05
908	0.08
909	0.1
910	0.13
911	0.14
912	0.15
913	0.15
914	0.17
915	0.24
916	0.29
917	0.28
918	0.27
919	0.29
920	0.35
921	0.36
922	0.34
923	0.28
924	0.21
925	0.2
926	0.17
927	0.14
928	0.09
929	0.08
930	0.07
931	0.07
932	0.09
933	0.09
934	0.13
935	0.14
936	0.15
937	0.16
938	0.17
939	0.16
940	0.15
941	0.17
942	0.13
943	0.12
944	0.1
945	0.09
946	0.08
947	0.08
948	0.08
949	0.05
950	0.05
951	0.05
952	0.05
953	0.05
954	0.05
955	0.07
956	0.09
957	0.1
958	0.15
959	0.17
960	0.19
961	0.2
962	0.2
963	0.2
964	0.17
965	0.19
966	0.18
967	0.17
968	0.2
969	0.21
970	0.2
971	0.2
972	0.21
973	0.18
974	0.15
975	0.18
976	0.14
977	0.16
978	0.18
979	0.17
980	0.15
981	0.15
982	0.21
983	0.19
984	0.19
985	0.19
986	0.23
987	0.27
988	0.33
989	0.42
990	0.46
991	0.53
992	0.62
993	0.7
994	0.74
995	0.79
996	0.77
997	0.73
998	0.68
999	0.62
1000	0.63
1001	0.54
1002	0.45
1003	0.36
1004	0.32
1005	0.28
1006	0.28
1007	0.28
1008	0.27
1009	0.33
1010	0.36
1011	0.4
1012	0.47
1013	0.5
1014	0.51
1015	0.52
1016	0.45
1017	0.38
1018	0.37
1019	0.38
1020	0.32
1021	0.29
1022	0.26
1023	0.24
1024	0.23
1025	0.23
1026	0.23
1027	0.17
1028	0.15
1029	0.16
1030	0.14
1031	0.14
1032	0.13
1033	0.15
1034	0.12
1035	0.13
1036	0.14
1037	0.14
1038	0.13
1039	0.13
1040	0.13
1041	0.1
1042	0.1
1043	0.1
1044	0.09
1045	0.1
1046	0.1
1047	0.1
1048	0.09
1049	0.08
1050	0.09
1051	0.11
1052	0.11
1053	0.12
1054	0.12
1055	0.13
1056	0.14
1057	0.14
1058	0.14
1059	0.15
1060	0.2
1061	0.23
1062	0.24
1063	0.23
1064	0.22
1065	0.22
1066	0.22
1067	0.21
1068	0.16
1069	0.12
1070	0.12
1071	0.12
1072	0.14
1073	0.16
1074	0.18
1075	0.2
1076	0.2
1077	0.24
1078	0.26
1079	0.3
1080	0.31
1081	0.29
1082	0.28
1083	0.34
1084	0.36
1085	0.35
1086	0.35
1087	0.32
1088	0.33
1089	0.34

I1BY57

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer