Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CHY8

Protein Details
Accession I1CHY8    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-176SSSSSSYNDKKKKKKNYVRVAGGEHydrophilic
259-278NRPIKLRKSTWKERNIEVKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-167KKKKK
261-290PIKLRKSTWKERNIEVKAKKEKERMGPYSK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034215  RBM42_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12383  RRM_RBM42  
Amino Acid Sequences MPADRKGKDQSNSAYSSAGGYQGSEYDYSNYYGYGYDYSAGTYTDPNASTADYSQYYSQYYDPQAYYDAAATTTAKPMSAAAASTSTASSYKPSSTVAAAGPSAYTPVSSGTTTTSASGVKTYYPNQSNPNNPVGPVIITKSGYSGPSGTTGSSSSSSYNDKKKKKKNYVRVAGGEVWEDPTLADWDDQDYRLFAGDLGNEVTEELLFKTFSKYPSLTRTRVVRDSRTMKSKGFGFISFKDPDDFVRAWREMNGKYVGNRPIKLRKSTWKERNIEVKAKKEKERMGPYSKLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.36
3 0.34
4 0.27
5 0.21
6 0.15
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.12
11 0.11
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.15
16 0.15
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.2
48 0.22
49 0.21
50 0.2
51 0.21
52 0.2
53 0.19
54 0.15
55 0.14
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.08
90 0.08
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.06
95 0.08
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.19
111 0.21
112 0.24
113 0.28
114 0.33
115 0.36
116 0.37
117 0.4
118 0.33
119 0.3
120 0.28
121 0.23
122 0.19
123 0.15
124 0.13
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.11
144 0.15
145 0.19
146 0.28
147 0.35
148 0.43
149 0.52
150 0.61
151 0.7
152 0.77
153 0.84
154 0.85
155 0.88
156 0.88
157 0.86
158 0.79
159 0.72
160 0.62
161 0.51
162 0.41
163 0.3
164 0.22
165 0.15
166 0.12
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.1
197 0.13
198 0.15
199 0.19
200 0.2
201 0.24
202 0.33
203 0.39
204 0.38
205 0.41
206 0.46
207 0.47
208 0.54
209 0.55
210 0.51
211 0.53
212 0.58
213 0.59
214 0.6
215 0.57
216 0.5
217 0.49
218 0.47
219 0.43
220 0.39
221 0.36
222 0.33
223 0.32
224 0.36
225 0.34
226 0.32
227 0.28
228 0.26
229 0.24
230 0.25
231 0.23
232 0.2
233 0.25
234 0.25
235 0.24
236 0.28
237 0.32
238 0.27
239 0.32
240 0.33
241 0.29
242 0.31
243 0.37
244 0.41
245 0.42
246 0.44
247 0.46
248 0.52
249 0.57
250 0.6
251 0.61
252 0.63
253 0.67
254 0.75
255 0.78
256 0.78
257 0.76
258 0.78
259 0.81
260 0.78
261 0.78
262 0.75
263 0.75
264 0.75
265 0.78
266 0.78
267 0.76
268 0.77
269 0.77
270 0.8
271 0.78
272 0.75